Øvelser/opgaver

B = + 10 g kropsvægt b = -10 g. kropsvægt Der er komplet dominans hvor B dominerer over b.

Dette skema viser hvor meget en bestemt genotype bestemmer difference i kropsvægt i forhold til gennemsnittet. Hvilken effekt har B og b? er der dominans eller epistasi?

EBV = 0,2*85 g/dag = 17 g/dag

Hvad er lammets estimerede avlsværdi ift. tilvækst?

r_AI = KVROD(0,5*(0,5*20*0,3)/(1+(20-1)*(0,25*0,3))) = 0,79

Hvad er sikkerheden for avlsværdiskøn/EBV hos stampe?

Covarians: (149,45+347,35...+66,15)/(12-1) = 225,8 ib Dvs. at der er en positiv sammenhæng

Beregn covarians mellem disse oplysninger om fødselsdvægt og fravænningsvægt. Er der sammenhæng?

225,8/(9,39*55,5) = 0,43

Beregn korrelation på baggrund af disse oplysninger:

B = + 10 g kropsvægt B' = -10 g. kropsvægt Der er ren additiv effekt, ingen domians eller epistasi

Dette skema viser hvor meget en bestemt genotype bestemmer difference i kropsvægt i forhold til gennemsnittet. Hvilken effekt har B og B'? er der dominans eller epistasi?

regressionskoefificient: 225,8/(9,39)^2 = 2,55 ib Dvs. at hver gang fødselsvægten stiger med 1 ib stiger fravænningsvægten gns. med 2,55 ib.

Estimer den fænotypiske regression af franvænningsvægt mod fødselsvægt ud fra følgende: covarians: 225,8 ib spredning_fødselsvægt: 9,39 ib

GCV beregnes som forskellen mellem G og BV. TT: G: 0,1+0,1=0,2 BV: 0,1+0,1=0,2 GCV: 0 Tt G: 0,1+0,1 = 0,2 BV: 0,1-0,1= 0 GCV: 0,2 tt G: 0-,1-0,1 = -0,2 BV: -0,2 GCV = 0

I dette t-locus med effekt på kuldstørrelse hos svin, dominerer T over t og der er uafhængige/additive alleleffekter. T = +0,1 t= -0,1 Beregn GCV for genotyperne TT, Tt og tt

a. Så vil overlevelsen være 90% b. Så vil overlevelsen være 30 % c. Så vil overlevelsen være 60 % - grundet additiv effekt af aleller - 90/2 + 30/2 = 60

Kap 3-5 Overvej et hypotetisk locus for tuberkulose resistens / modtagelighed med allelerne Tr (resistens) og Ts (susceptible). Ved ekponering med tuberculose patogenet, vil TrTr individer overleve 90% af tiden, og TsTs individer vil overleve 30% af gangene. Hvad er værdien for overlevelses What is the value for survivalsprocenten for TrTs individer hvis locus er som følgende: a. Komplet dominans og Tr er den dominante allel b. Komplet dominans og Ts er den dominante allel c. Ingen dominans

AaBbCcDd G = 4*10 = 40 BV = (4*5)+(4*(-2))=20-8 = 12 GCV = 40-12 = 28 AABbCcDd G = 4*10 = 40 BV = (5*5)+(3*(-2))=25-6=19 GCV = 40-19 =21 AAbbCcdd G =(2*10)+(2*(-4))=20-8= 12 BV = (3*5)+(5*(-2))=15-10= 5 GCV = 12-5 = 7 aaBBCCdd G = 2*10+2*(-4)= 12 BV = (4*5)+(4*(-2)= 12 GCV = 0

Kap 7 Her er et eksempel med 4 loci med hver 2 aleller der påvirker samme egenskab. Der er komplet dominans hvor: domiannt allel = +5 recessiv allel = -2 Udregn følgende genotypers genotypeværdi, avlsværdi og genkombinationsværdi AaBbCcDd AABbCcDd AAbbCcdd aaBBCCdd

Dominant = +10 Reccesiv = -4 (1)AaBbCcDdEe BV = 10*5+(-4)*5 = 50-20= 30 G = 10*10 = 100 GCV = 100-10 = 70 E = 0 P = 600+30+90= 720 (2)AAbbCCddEE BV = 10*6+(-4*4) = 60-16 = 44 G = 44 GCV = 0 E = 0 P = 600+44 = 644

Kap 7 Hypotetisk kvantitativ egenskab der er påvirket af 5 loci. Komplet dominans af alle loci. Ingen epistasis. Den uafhængige effekt af hver dominant gen er +10 lb Den uafhængige effekt af hver recessive gen er -4 lb For en homozygot kombination, genotypeværdien er det samme som avlsværdien. my = 600 lb. (1)AaBbCcDdEe (2)AAbbCCddEE udregn: BV = G = GCV = E = P =

a. Udregn progency difference for hver hest PD = ½BV PD_raisearuckus = -8/2 = -4 PD_presidium = -12/2 = -6 b. Udregn producing ability for hver hest PA = BV+GCV+Ep PA_raisearuckus = -8-6 = -14 PA_presidium = -12+2 = -10 c. Hvilken hest vil du vædde på I et væddeløb? Hvorfor? Antager at jo lavere PA, jo mindre tid tager de at løbe et væddeløb og jo hurtigere løber hesten. Raise-a-ruckus har den mindste PA og har dermed evnen til at løbe hurtigts, til trods for at Presidium har bedre avlsværdi. Dette er grundet mere favorable miljøeffekter hos Raise-a-ruckus. d. Hvilken hest vil de avle på? Hvorfor? Vil avle på Presidium, da denne hest har en bedre avlsværdi. Alt efter miljø vil man kunne påvirke afkom til at blive bedre/dårligere,

Overvej fuldblodshingsten Raise-a-ruckus og Presidium. Raise-a-ruckus's avlsværdi for væddeløb er - 8 sekunder. Han var meget veltrænet og havde et permanent miljøeffekt på -6 sekunder. Presidiums avlsværdi er -12 sekunder, men hans permanente miljøeffekt er +2 sekunder. Antag at begge hingste har en genkombinationsværdi på 0. a. Udregn progency difference for hver hest b. Udregn producing ability for hver hest c. Hvilken hest vil du vædde på I et væddeløb? Hvorfor? d. Hvilken hest vil de avle på? Hvorfor?

Konfidensinterval = gns +- 2 spredningsenheder 506,25-(55,5*2)=395,25 506,25+(55,5*2)=617,25 Kalv nr. 5 ligger udenfor konfidensinterval. Genkombination-værdi, avlsværdi og miljø kan spille ind. Det er fænotype vi kigger på. Det indikerer at den ligger udenfor de 95%, men i top 2,5% tungeste kalve. Om det er godt eller skidt er alt efter hvad landmand ønsker

Vægten ved fravænning er i gns. 506,25 ib med en spredning på 55,5. Hvilken af disse kalve falder udenfor 95%-konfidensintervallet?

G = i * r_IA* spredning i = 2,06 (slåes op i tabel) r_IA = KVROD(0,50*((0,50*20*0,3)/(1+(20-1)*0,25*0,30)) = 0,79 G = 2,06*0,79*0,4 = 0,65 æg pr. generation

beregn genetisk fremgang ved direkte selektion på æg målt på 20 afkom (halvsøskende). top 5% af hannerne udvælges til avl. Spredning = 0,4 Heritabilitet = 0,3