Bio cell

Monocaténaire

1 seul brin (ARN)

-1,5 Milliards d'années

1er eucaryote pluricellulaire

Bicouche lipidique

2 couches de phospholipide

Disaccharide

2 oses

Hétérochromatine

ADN dense, inaccessible à la transcription

Euchromatine

ADN diffus, accessible à la transcription

Chromatine

ADN, protéine, ARN organisation en collier de perle

ARN

Acide Ribo-Nucléique Ribose Uracile

Kinésine

Adaptateur spécifique de microtubule, vers le +

Dynéine

Adaptateur spécifique de microtubule, vers le -

Base azotée purique

Adénine, Guanine

Arginine

Arg

Asparagine

Asn

Acide aspartique

Asp

Nucléoside

Base, pentose

Nucléotide

Base, pentose, acide phosphorique

Liposome

Bicouche en sphère

PRS (Particule de Reconnaissance du Signal)

Bloque la traduction du ribosome

Composés organiques

CHNOPS

Champignon

Caractéristique végétale mais composant animal.

Lysosome

Carrefour de maturation/ dégradation

lysosome

Carrefours des voies de synthèse et de dégradation Mucus interne protecteur de la mb

Microtubules kinétochoriens

Cellule végétale, lors de la mitose au niveau des centromères

Acides amineés polaire hydrophiles

Chaîne R avec des cycles, certains atomes ou fonction

Acides amineés apolaire hydrophobes

Chaîne R avec que des H et des C

Nucléole

Comprends les gènes des ARN ribosomaux train transcriptionnel

Cystéine

Cys

Base azotée pyrimidique

Cytosine, Uracile, Thymine

Transport passif

Dans le sens du gradient, pas besoin d'énergie

Résolution

Distance minimale à laquelle deux points peuvent s'approcher tout en étant encore reconnaissable

Aster

Duplication des centrioles, puis migration aux pôles de la cellule avant la mitose animale

Cryofracture

Découper la membrane

Cholestérol

Dérivé isoprénique Fonction de structuration et de rigidification des mb

Protéine structure primaire

Enchainement linéaire d'acide animé via des liaisons peptidiques

Macromolécules

Ensemble de polymère

Desmosomes

Entre deux cellules Cadhérine

Hémidesmosomes

Entre lame basale et cellule intégrine

Exon

Eucaryote séquence codante

Intron

Eucaryote séquence non codante

Microfilament et filament intermédiaire

Forme des cellules

Hétérocaryon, preuve du modèle de la mosaïque fluide

Frye et Edidin 1970

Glutamine

Gln

Acide glutamique

Glu

Biomolécules

Glucides, Lipides, Protéines, Nucléotides

Chromatographie d'affinité

Greffage sur le support d'un ligand par liaison covalente Protéine hautement purifié

Lymphocyte

Gros noyau

Réticulum endoplasmique rugueux

Génération des protéines grâce aux ribosomes sur la membrane

Protéine chaperon

HSP 70 HSP 60 + 10 surveille, contrôle qualité, ATPasique

Histidine

His

Isoleucine

Ile

Colorant non vital

Implique la mort de la cellule car colorant exclu par une pompe à ATP

Acides gras

Insoluble dans l'eau formule générale : CH3-(CH2)n-COOH Phospholipide, glycolipide, stérol

Microscopie électronique

Jusqu'à 0,5nm, avec des électrons

Leucine

Leu

Structure tertiaire des protéines

Liaisons faible entre les radicaux Reploiement irrégulier mais spécifique de chaque protéine

œil de réplication

Lieu de la réplication de l'ADN

Lysine

Lys

Colorant vital

Maintient la cellule vivante

Glycocalyx

Manteau glucidique de la membrane plasmique

Glycocalique

Manteau glucidique des organites

Association endosymbiotique

Margulis et Taylor 1979 Phagocytose de cellule capable de faire la respiration (ou photosynthèse) par de plus grosse cellule anaérobique

Bleu de toluidine

Met en évidence ADN et ARN Se fixe aux groupements anioniques

Réactif de Feulgen

Met en évidence l'ADN Oxydation par HCl puis réactif de Schiff

Cytoenzymologie

Mise en évidence de protéine via des enzymes

Acide Périodique Schiff

Modifie la fonction alcool en fonction aldéhyde, fuschine colore les fonctions aldéhydes Mise en évidence des glucides

Ose, monosaccharide

Monomère de glucides, (CH2O)n

Eosinophile

Noyau bi-lobé, grosse granulation rose

Monocyte

Noyau réniforme

Mitochondrie

Organite cellulaire producteur d'énergie, qui assure la respiration cellulaire pour produire l'énergie dont la cellule a besoin

Appareil de Golgi

Organite de stockage qui prépare et trie les protéines avant de les libérer à l'intérieur ou à l'extérieur de la cellule.

Glycoprotéine

Ose + protéine

Aldose

Ose avec la fonction --O en bout de chaîne

Cétose

Ose avec la fonction --O en milieu de chaîne

Ose phosphorylé

Ose avec un groupement phosphate

Acide uronique

Ose avec une fonction acide carboxylique COOH

Osamine

Ose avec une fonction amine NH2

Désoxyose

Ose ayant perdu un ou plusieurs groupement OH

Pyrane

Ose hexagonale avec un O dans le cycle

Furane

Ose pentagonale avec un O à l'extérieur du cycle

Peroxysome

Oxydation des lipides et divers substrats sans génération d'énergie. Détoxification des dérivés de l'oxygène en H2O2 puis de ce dernier en H2O

Bactérie

Pas d'organite, pas de compartimentation, pas de mouvement intracellulaire, d'endo/exocytose, ni de cytosquelette

Composés inorganiques

Pas de molécules de Carbones

Petite molécule polaire non chargée

Passe bien les mb par diffusion

Grosse molécule

Passe moins bien les mb par diffusion

Molécules chargées

Passe pas les mb par diffusion

Petite molécule hydrophobe

Passe très bien les mb par diffusion

Jonctions communicantes

Permet des échanges entre cellules Connexine

Phénylalanine

Phe

Polymères

Plusieurs monomères

Structure quaternaire des protéines

Plusieurs segments protéique lié ensemble --> hémoglobine

Oside, polysaccharide

Polymère de glucides

-2,8 à -3 Milliards d'années

Première cellule eucaryote

-3,5 Milliards d'années

Première cellule procaryote

Proline

Pro

Opéron

Procaryote structure fonctionnelle constitué de parties codantes entre les codons de démarrage et de terminaison

Protozoaire

Protiste hétérotrophe

Protéine extrinsèque

Protéine associée à des protéines intrinsèques ou lipide

Histone

Protéine de compaction de l'ADN 5 types : H1 H2A H2B H3 H4

Protéine intrinsèque transmembranaire

Protéine encrée dans les deux couches de la membrane

Protéine intrinsèque transmembranaire monotopique

Protéine encrée dans les deux couches de la membrane (1 seul passage)

Protéine intrinsèque transmembranaire poly topique

Protéine encrée dans les deux couches de la membrane (plusieurs passage)

Forme alpha

Présence au dessous du plan, du groupement OH lié au carbone 1

Forme beta

Présence au dessus du plan, du groupement OH lié au carbone 1

Acides gras insaturés

Présence de double liaison entre les C

Alanine

R = -CH3 Ala

Glycine

R = -H Gly

Pentose du nucléotide

Ribose Désoxyribose

ME à balayage

Réfléchie sur l'échantillon

Sérine

Ser

modèle de la mosaïque fluide

Singer et Nicholson 1972 Protéines peuvents se déplacer, liquide bi-dimensionel

Sphingophospholipides

Sphingosine permet la liaison avec l'acide gras Via liaison ester

Endocytose spécifique

Spécifique de certaines molécules, via des ligands

Réticulum endoplasmique lisse

Synthèse des lipides, génération de membrane

Microtubule

Ségrégation des chromosomes lors de la mitose agencement des organises et axes de déplacement des vésicules Agencement depuis le centrosome

T - SNARE

Target sur la membrane

Thréonine

Thr

Centrifugation

Tourne très vite en faisant sédimenter vers le fond les particules

Acides gras saturés

Tous les carbones internes avec 2 H, que des simples liaisons

Trytophane

Trp

Gram +

Très épaisse couche de peptidoglycane, une seule membrane parasite ou pathogène

Tyrosine

Tyr

Codon stop

UAA, UGA, UAG Déstructure le ribosome, arrêt de la traduction

Micelle

Une couche de phospholipide en sphère

Gram -

Une membrane externe, la couche de peptidoglycane est très fine donc un espace entre membrane plasmique et externe —> periplasme

Valine

Val

Diffusion facilitée

Via des protéines transporteuses transmembranaires

TRI des protéines (réseau trangolgien) pour les différentes destinations

Via des regroupements de protéines ancrées sur la face luminale du Golgi et qui interagissent comme récepteurs aux macromolécules à concentrer.

Phragmoplaste

Vésicule golgienne pendant la télophase

Virus

acaryote Matériel génétique mais pas de structure cellulaire, de métabolisme, de reproduction, communication

Lipide membranaire

amphiphile, bipolaire, auto-assemblage Assemblage dans le RE lisse Acide gras formé dans le cytosol Dégradation peroxysome, mitochondrie

Appareil de Golgi Voie constitutive

apporte à la mb des constituants qui lui sont propres (renouvellement et compensation des pertes par endocytose)

Amphibolique

associé au catabolisme et à l'anabolisme

Glycosylation post-traductionnelle des protéines

bcp de macromolécules sécrétées sous forme de mucoprotéines riches en sucre (glucose, manose, acetyl- glucosamine) insérés au niveau du REr Sulfatation et phosphorylations se font aussi dans le Golgi.

Procaryote

cellule sans noyau Inventé par E Chaton en 1920 (validé 40 ans plutard)

ARN pré-messager

coiffe à 5' (permet la reconnaissance par le ribosome) et une queue de adénosine polymérase en 3'

ARN polymérase

complexe de transcription 3' vers 5' Procaryote : 3 ss unités Eucaryote : plus d'une dizaine de ss unités

Nucléosome

composé d'un paquet de 8 histones autour duquel s'enroulent deux tours d'ADN stabilisé par l'histone H1

Virion à coque sphérique

constituée de 20 (capsomère) faces triangulaires jointives

Transport actif

contre le gradient, vers le plus concentré

Glycérophospholipides

deux chaines d'acides gras, d'une molécule de glycérol, d'un groupement acide phosphorique (phosphate une fois attaqué par l'alcool) et d'un alcool. Plus abondant dans les mb via liaison ester

Transcription primaire pré-messager

donne ARN pré-messager (avec les intron)

Réplication semi-conservative

ds la nouvelle double hélice : 1 brin ancien et 1 brin nouveau Watson et Crick en 1953 Preuve Meselson et Stahl (1958)

Extrémité 5' libre acide nucléique

début de la chaîne

Phagocytose

endocytose de grosse molécule, que par certain type cellulaire

Pinocytose

endocytose de petite molécule

Poche A du ribosome

endroit où un ARNt apporte un acide aminé

Chondriome

ensemble des mitochondries d'une cellule

Plastidome

ensemble des plastes d'une cellule

Anabolisme

ensemble des réactions métaboliques de synthèse

Eucaryote

entre 10 et 100um

Point de contrôle critique du cycle cellulaire

entre G1 et S : cycline E et CDK 2 entre G2 et M : cycline B et CDK 1 par les associations complémentaires de kinases CDK et des cyclines

Epissage alternatif

excise aussi des exons, variation de protéine

Sécrétion constitutive

exocytose en continue sans sélection

Sécrétion provoquée

exocytose sous l'effet d'un stimulus extracellulaire

Canaux ioniques

fermés, s'ouvrent sous l'effet d'un stimulus

Extrémité 3' libre acide nucléique

fin de la chaîne

Poche E du ribosome

fixe l'ARNt libre

Polymérisation des nucléotides

forme acide nucléique via des liaisons phosphodiester (entre liaison OH de l'acide phosphorique et OH du pentose)

Eythrocytes, hématie

forme biconcave anuclée (mammifère)

Glycéride

formeés a partir de l'association d'un acide gras (par sa partie COOH) avec une molécule de glycérol (par l'un de ses groupements OH) Via liaison ester

Fragment d'Okazaki

fragment d'ADN répliqué autour d'ADN non répliqué dans un œil de réplication

Aminoterminal

indique le premier acide aminé, fonction amine libre

Bourgeonnement

inverse de l'endocytose, entre deux compartiments intracellulaires

Microscopie photonique

jusqu'à 10nm, avec des photons

oligosaccharide

jusqu'à 15 oses

Electrophorèse

la séparation de molécule chargé (protéine et acide nucléique), sur un gel avec des pores de dimensions moléculaires

Télomère

la terminaison des chromosomes linéaires Sous unités répétées de long TTAGGG (500 à 3000 répétitions) Pour éviter une perte de matériel génétique

Carboxyterminal

le dernier acide aminé, fonction carboxyle libre

Perméase symport

les deux molécules vont dans le même sens

Perméase antiport

les deux molécules vont dans le sens opposé

Acide aminé

les sous-unités qui forment les protéines 20 lettres sauf BJOUXZ amphotères

Virions cylindrique ou hélicoïdaux

manchon capsidique serré autour de l'acide nucléique

Méthionine

met

Appareil de Golgi Voie controlée

mise en réserve provisoire de produits spécifiques dans des grosses vésicules initialement créé via intervention de la clathrine —> granule de sécrétion libérés sous stimulus

Immunocytochimie

mise en évidence de protéine via des anticorps

Monomères

molécule simple

Exocytose

méthode de transport dans laquelle une vésicule fusionne avec la membrane plasmique et libère sa charge à l'extérieur de la cellule

Basophile

noyau bi-lobé, grosse granulation bleu

Neutrophile

noyau pluri-lobé, fine granulation rose

Membrane

observer par Overton en 1895 Asymétrie et fluidité 40% de lipide

Microscopie à fluorescence

organisme absorbe de la lumière et la ré-émet

Glycolipide

ose + lipide

Polymérisation des oses

par condensation ou déshydratation Liaison entre deux groupements OH

Transport actif secondaire

par couplage à une autre molécule

Endocytose constitutive

pas de sélection, via le recyclage de la mb

SNARE

permet la fusion des mb pour mettre en continuité les différents éléments

Ligase

permet la mise en place des liaisons phosphodiesters entre les nucléotides déjà placés

polysaccharide

plus de 15 oses

Hétérosides, glycoconjugué

polymère composé à partir d'oses et de composé non glucidique

Holosides

polymère composés qu'a partir d'oses.

Train transcriptionnel

polymérases se suivent sur le même gène --> ARN ribosomaux

Catabolisme

processus métabolique qui comporte la dégradation d'une molécule en d'autres molécules plus petites et qui libère généralement de l'énergie

Endocytose

processus par lequel la membrane cellulaire absorbe des particules extracellulaires pour les transporter à l'intérieur de la cellule

Protophytes

protiste autotrophe

Protéine intrinsèque

protéine encrée dans la membrane

Phase G1

préparer le matériel pour répliquer par transcription

Maturation

raboutage des exons créé des boucles d'introns (épissage) puis l'excision des introns Donne ARNm mature

Phase S

réplication de l'ADN

Noyau

siège de l'information génétique et du contrôle de son expression

Cascade de signalisation

succession des transformations protéine-protéine

V- SNARE

sur la vésicule

Bactériophage complexe

système de pompe seringue : capside comptant un tube et système d'encrage

Uniport

système ping pong, s'arrête lors de la saturation

Filtration sur gel

séparation des molécules en fonction de la taille grâce à des microbilles poreuses

Coloration de Gram

test colorimétrique - Colorant pour incuber les bactéries - Passe les bactéries à l'alcool rapidement : certaine se décolore d'autre pas

Diffusion simple

transport d'une molécule sous l'effet du gradient de concentration (vers le moins concentré)

ME à transmission

traverse l'échantillon

Diglycéride

un glycéride avec deux liaison entre deux OH du glycérol et deux acides

Triglycéride

un glycéride avec trois liaison entre trois OH du glycérol et trois acides

Monoglycéride

un glycéride avec une liaison entre un OH du glycérol et un acide

Réplication procaryote

un seul point de démarrage, réplication bidirectionnelle

Structure en tonneau beta

via des liaisons hydrogène

Structure secondaire des protéines

via des liaisons hydrogène ou pont disulfure entre les aa 4 types de structure différente

Structure en hélice alpha

via des liaisons hydrogènes entre les CO et NH Chaîne R en périphérie

Structure en feuillet beta

via liaisons hydrogènes entre des liaisons peptidique

Transport actif primaire, pompe ATPase

via une pompe qui hydrolyse l'ATP

Phase G2

vérifier que l'ADN est correcte, préparation à la mitose

Exosome

vésicule <30 nm

Corps vésiculaire

vésicule >30nm

Jonctions serrées

Étanchéifier le tissu Claudine et occludine

Microscopie confocale

élimine les signaux localisés en dehors du plan de mise au point

Poche P du ribosome

élongation de la chaîne polypeptidique