Bio cell
Monocaténaire
1 seul brin (ARN)
-1,5 Milliards d'années
1er eucaryote pluricellulaire
Bicouche lipidique
2 couches de phospholipide
Disaccharide
2 oses
Hétérochromatine
ADN dense, inaccessible à la transcription
Euchromatine
ADN diffus, accessible à la transcription
Chromatine
ADN, protéine, ARN organisation en collier de perle
ARN
Acide Ribo-Nucléique Ribose Uracile
Kinésine
Adaptateur spécifique de microtubule, vers le +
Dynéine
Adaptateur spécifique de microtubule, vers le -
Base azotée purique
Adénine, Guanine
Arginine
Arg
Asparagine
Asn
Acide aspartique
Asp
Nucléoside
Base, pentose
Nucléotide
Base, pentose, acide phosphorique
Liposome
Bicouche en sphère
PRS (Particule de Reconnaissance du Signal)
Bloque la traduction du ribosome
Composés organiques
CHNOPS
Champignon
Caractéristique végétale mais composant animal.
Lysosome
Carrefour de maturation/ dégradation
lysosome
Carrefours des voies de synthèse et de dégradation Mucus interne protecteur de la mb
Microtubules kinétochoriens
Cellule végétale, lors de la mitose au niveau des centromères
Acides amineés polaire hydrophiles
Chaîne R avec des cycles, certains atomes ou fonction
Acides amineés apolaire hydrophobes
Chaîne R avec que des H et des C
Nucléole
Comprends les gènes des ARN ribosomaux train transcriptionnel
Cystéine
Cys
Base azotée pyrimidique
Cytosine, Uracile, Thymine
Transport passif
Dans le sens du gradient, pas besoin d'énergie
Résolution
Distance minimale à laquelle deux points peuvent s'approcher tout en étant encore reconnaissable
Aster
Duplication des centrioles, puis migration aux pôles de la cellule avant la mitose animale
Cryofracture
Découper la membrane
Cholestérol
Dérivé isoprénique Fonction de structuration et de rigidification des mb
Protéine structure primaire
Enchainement linéaire d'acide animé via des liaisons peptidiques
Macromolécules
Ensemble de polymère
Desmosomes
Entre deux cellules Cadhérine
Hémidesmosomes
Entre lame basale et cellule intégrine
Exon
Eucaryote séquence codante
Intron
Eucaryote séquence non codante
Microfilament et filament intermédiaire
Forme des cellules
Hétérocaryon, preuve du modèle de la mosaïque fluide
Frye et Edidin 1970
Glutamine
Gln
Acide glutamique
Glu
Biomolécules
Glucides, Lipides, Protéines, Nucléotides
Chromatographie d'affinité
Greffage sur le support d'un ligand par liaison covalente Protéine hautement purifié
Lymphocyte
Gros noyau
Réticulum endoplasmique rugueux
Génération des protéines grâce aux ribosomes sur la membrane
Protéine chaperon
HSP 70 HSP 60 + 10 surveille, contrôle qualité, ATPasique
Histidine
His
Isoleucine
Ile
Colorant non vital
Implique la mort de la cellule car colorant exclu par une pompe à ATP
Acides gras
Insoluble dans l'eau formule générale : CH3-(CH2)n-COOH Phospholipide, glycolipide, stérol
Microscopie électronique
Jusqu'à 0,5nm, avec des électrons
Leucine
Leu
Structure tertiaire des protéines
Liaisons faible entre les radicaux Reploiement irrégulier mais spécifique de chaque protéine
œil de réplication
Lieu de la réplication de l'ADN
Lysine
Lys
Colorant vital
Maintient la cellule vivante
Glycocalyx
Manteau glucidique de la membrane plasmique
Glycocalique
Manteau glucidique des organites
Association endosymbiotique
Margulis et Taylor 1979 Phagocytose de cellule capable de faire la respiration (ou photosynthèse) par de plus grosse cellule anaérobique
Bleu de toluidine
Met en évidence ADN et ARN Se fixe aux groupements anioniques
Réactif de Feulgen
Met en évidence l'ADN Oxydation par HCl puis réactif de Schiff
Cytoenzymologie
Mise en évidence de protéine via des enzymes
Acide Périodique Schiff
Modifie la fonction alcool en fonction aldéhyde, fuschine colore les fonctions aldéhydes Mise en évidence des glucides
Ose, monosaccharide
Monomère de glucides, (CH2O)n
Eosinophile
Noyau bi-lobé, grosse granulation rose
Monocyte
Noyau réniforme
Mitochondrie
Organite cellulaire producteur d'énergie, qui assure la respiration cellulaire pour produire l'énergie dont la cellule a besoin
Appareil de Golgi
Organite de stockage qui prépare et trie les protéines avant de les libérer à l'intérieur ou à l'extérieur de la cellule.
Glycoprotéine
Ose + protéine
Aldose
Ose avec la fonction --O en bout de chaîne
Cétose
Ose avec la fonction --O en milieu de chaîne
Ose phosphorylé
Ose avec un groupement phosphate
Acide uronique
Ose avec une fonction acide carboxylique COOH
Osamine
Ose avec une fonction amine NH2
Désoxyose
Ose ayant perdu un ou plusieurs groupement OH
Pyrane
Ose hexagonale avec un O dans le cycle
Furane
Ose pentagonale avec un O à l'extérieur du cycle
Peroxysome
Oxydation des lipides et divers substrats sans génération d'énergie. Détoxification des dérivés de l'oxygène en H2O2 puis de ce dernier en H2O
Bactérie
Pas d'organite, pas de compartimentation, pas de mouvement intracellulaire, d'endo/exocytose, ni de cytosquelette
Composés inorganiques
Pas de molécules de Carbones
Petite molécule polaire non chargée
Passe bien les mb par diffusion
Grosse molécule
Passe moins bien les mb par diffusion
Molécules chargées
Passe pas les mb par diffusion
Petite molécule hydrophobe
Passe très bien les mb par diffusion
Jonctions communicantes
Permet des échanges entre cellules Connexine
Phénylalanine
Phe
Polymères
Plusieurs monomères
Structure quaternaire des protéines
Plusieurs segments protéique lié ensemble --> hémoglobine
Oside, polysaccharide
Polymère de glucides
-2,8 à -3 Milliards d'années
Première cellule eucaryote
-3,5 Milliards d'années
Première cellule procaryote
Proline
Pro
Opéron
Procaryote structure fonctionnelle constitué de parties codantes entre les codons de démarrage et de terminaison
Protozoaire
Protiste hétérotrophe
Protéine extrinsèque
Protéine associée à des protéines intrinsèques ou lipide
Histone
Protéine de compaction de l'ADN 5 types : H1 H2A H2B H3 H4
Protéine intrinsèque transmembranaire
Protéine encrée dans les deux couches de la membrane
Protéine intrinsèque transmembranaire monotopique
Protéine encrée dans les deux couches de la membrane (1 seul passage)
Protéine intrinsèque transmembranaire poly topique
Protéine encrée dans les deux couches de la membrane (plusieurs passage)
Forme alpha
Présence au dessous du plan, du groupement OH lié au carbone 1
Forme beta
Présence au dessus du plan, du groupement OH lié au carbone 1
Acides gras insaturés
Présence de double liaison entre les C
Alanine
R = -CH3 Ala
Glycine
R = -H Gly
Pentose du nucléotide
Ribose Désoxyribose
ME à balayage
Réfléchie sur l'échantillon
Sérine
Ser
modèle de la mosaïque fluide
Singer et Nicholson 1972 Protéines peuvents se déplacer, liquide bi-dimensionel
Sphingophospholipides
Sphingosine permet la liaison avec l'acide gras Via liaison ester
Endocytose spécifique
Spécifique de certaines molécules, via des ligands
Réticulum endoplasmique lisse
Synthèse des lipides, génération de membrane
Microtubule
Ségrégation des chromosomes lors de la mitose agencement des organises et axes de déplacement des vésicules Agencement depuis le centrosome
T - SNARE
Target sur la membrane
Thréonine
Thr
Centrifugation
Tourne très vite en faisant sédimenter vers le fond les particules
Acides gras saturés
Tous les carbones internes avec 2 H, que des simples liaisons
Trytophane
Trp
Gram +
Très épaisse couche de peptidoglycane, une seule membrane parasite ou pathogène
Tyrosine
Tyr
Codon stop
UAA, UGA, UAG Déstructure le ribosome, arrêt de la traduction
Micelle
Une couche de phospholipide en sphère
Gram -
Une membrane externe, la couche de peptidoglycane est très fine donc un espace entre membrane plasmique et externe —> periplasme
Valine
Val
Diffusion facilitée
Via des protéines transporteuses transmembranaires
TRI des protéines (réseau trangolgien) pour les différentes destinations
Via des regroupements de protéines ancrées sur la face luminale du Golgi et qui interagissent comme récepteurs aux macromolécules à concentrer.
Phragmoplaste
Vésicule golgienne pendant la télophase
Virus
acaryote Matériel génétique mais pas de structure cellulaire, de métabolisme, de reproduction, communication
Lipide membranaire
amphiphile, bipolaire, auto-assemblage Assemblage dans le RE lisse Acide gras formé dans le cytosol Dégradation peroxysome, mitochondrie
Appareil de Golgi Voie constitutive
apporte à la mb des constituants qui lui sont propres (renouvellement et compensation des pertes par endocytose)
Amphibolique
associé au catabolisme et à l'anabolisme
Glycosylation post-traductionnelle des protéines
bcp de macromolécules sécrétées sous forme de mucoprotéines riches en sucre (glucose, manose, acetyl- glucosamine) insérés au niveau du REr Sulfatation et phosphorylations se font aussi dans le Golgi.
Procaryote
cellule sans noyau Inventé par E Chaton en 1920 (validé 40 ans plutard)
ARN pré-messager
coiffe à 5' (permet la reconnaissance par le ribosome) et une queue de adénosine polymérase en 3'
ARN polymérase
complexe de transcription 3' vers 5' Procaryote : 3 ss unités Eucaryote : plus d'une dizaine de ss unités
Nucléosome
composé d'un paquet de 8 histones autour duquel s'enroulent deux tours d'ADN stabilisé par l'histone H1
Virion à coque sphérique
constituée de 20 (capsomère) faces triangulaires jointives
Transport actif
contre le gradient, vers le plus concentré
Glycérophospholipides
deux chaines d'acides gras, d'une molécule de glycérol, d'un groupement acide phosphorique (phosphate une fois attaqué par l'alcool) et d'un alcool. Plus abondant dans les mb via liaison ester
Transcription primaire pré-messager
donne ARN pré-messager (avec les intron)
Réplication semi-conservative
ds la nouvelle double hélice : 1 brin ancien et 1 brin nouveau Watson et Crick en 1953 Preuve Meselson et Stahl (1958)
Extrémité 5' libre acide nucléique
début de la chaîne
Phagocytose
endocytose de grosse molécule, que par certain type cellulaire
Pinocytose
endocytose de petite molécule
Poche A du ribosome
endroit où un ARNt apporte un acide aminé
Chondriome
ensemble des mitochondries d'une cellule
Plastidome
ensemble des plastes d'une cellule
Anabolisme
ensemble des réactions métaboliques de synthèse
Eucaryote
entre 10 et 100um
Point de contrôle critique du cycle cellulaire
entre G1 et S : cycline E et CDK 2 entre G2 et M : cycline B et CDK 1 par les associations complémentaires de kinases CDK et des cyclines
Epissage alternatif
excise aussi des exons, variation de protéine
Sécrétion constitutive
exocytose en continue sans sélection
Sécrétion provoquée
exocytose sous l'effet d'un stimulus extracellulaire
Canaux ioniques
fermés, s'ouvrent sous l'effet d'un stimulus
Extrémité 3' libre acide nucléique
fin de la chaîne
Poche E du ribosome
fixe l'ARNt libre
Polymérisation des nucléotides
forme acide nucléique via des liaisons phosphodiester (entre liaison OH de l'acide phosphorique et OH du pentose)
Eythrocytes, hématie
forme biconcave anuclée (mammifère)
Glycéride
formeés a partir de l'association d'un acide gras (par sa partie COOH) avec une molécule de glycérol (par l'un de ses groupements OH) Via liaison ester
Fragment d'Okazaki
fragment d'ADN répliqué autour d'ADN non répliqué dans un œil de réplication
Aminoterminal
indique le premier acide aminé, fonction amine libre
Bourgeonnement
inverse de l'endocytose, entre deux compartiments intracellulaires
Microscopie photonique
jusqu'à 10nm, avec des photons
oligosaccharide
jusqu'à 15 oses
Electrophorèse
la séparation de molécule chargé (protéine et acide nucléique), sur un gel avec des pores de dimensions moléculaires
Télomère
la terminaison des chromosomes linéaires Sous unités répétées de long TTAGGG (500 à 3000 répétitions) Pour éviter une perte de matériel génétique
Carboxyterminal
le dernier acide aminé, fonction carboxyle libre
Perméase symport
les deux molécules vont dans le même sens
Perméase antiport
les deux molécules vont dans le sens opposé
Acide aminé
les sous-unités qui forment les protéines 20 lettres sauf BJOUXZ amphotères
Virions cylindrique ou hélicoïdaux
manchon capsidique serré autour de l'acide nucléique
Méthionine
met
Appareil de Golgi Voie controlée
mise en réserve provisoire de produits spécifiques dans des grosses vésicules initialement créé via intervention de la clathrine —> granule de sécrétion libérés sous stimulus
Immunocytochimie
mise en évidence de protéine via des anticorps
Monomères
molécule simple
Exocytose
méthode de transport dans laquelle une vésicule fusionne avec la membrane plasmique et libère sa charge à l'extérieur de la cellule
Basophile
noyau bi-lobé, grosse granulation bleu
Neutrophile
noyau pluri-lobé, fine granulation rose
Membrane
observer par Overton en 1895 Asymétrie et fluidité 40% de lipide
Microscopie à fluorescence
organisme absorbe de la lumière et la ré-émet
Glycolipide
ose + lipide
Polymérisation des oses
par condensation ou déshydratation Liaison entre deux groupements OH
Transport actif secondaire
par couplage à une autre molécule
Endocytose constitutive
pas de sélection, via le recyclage de la mb
SNARE
permet la fusion des mb pour mettre en continuité les différents éléments
Ligase
permet la mise en place des liaisons phosphodiesters entre les nucléotides déjà placés
polysaccharide
plus de 15 oses
Hétérosides, glycoconjugué
polymère composé à partir d'oses et de composé non glucidique
Holosides
polymère composés qu'a partir d'oses.
Train transcriptionnel
polymérases se suivent sur le même gène --> ARN ribosomaux
Catabolisme
processus métabolique qui comporte la dégradation d'une molécule en d'autres molécules plus petites et qui libère généralement de l'énergie
Endocytose
processus par lequel la membrane cellulaire absorbe des particules extracellulaires pour les transporter à l'intérieur de la cellule
Protophytes
protiste autotrophe
Protéine intrinsèque
protéine encrée dans la membrane
Phase G1
préparer le matériel pour répliquer par transcription
Maturation
raboutage des exons créé des boucles d'introns (épissage) puis l'excision des introns Donne ARNm mature
Phase S
réplication de l'ADN
Noyau
siège de l'information génétique et du contrôle de son expression
Cascade de signalisation
succession des transformations protéine-protéine
V- SNARE
sur la vésicule
Bactériophage complexe
système de pompe seringue : capside comptant un tube et système d'encrage
Uniport
système ping pong, s'arrête lors de la saturation
Filtration sur gel
séparation des molécules en fonction de la taille grâce à des microbilles poreuses
Coloration de Gram
test colorimétrique - Colorant pour incuber les bactéries - Passe les bactéries à l'alcool rapidement : certaine se décolore d'autre pas
Diffusion simple
transport d'une molécule sous l'effet du gradient de concentration (vers le moins concentré)
ME à transmission
traverse l'échantillon
Diglycéride
un glycéride avec deux liaison entre deux OH du glycérol et deux acides
Triglycéride
un glycéride avec trois liaison entre trois OH du glycérol et trois acides
Monoglycéride
un glycéride avec une liaison entre un OH du glycérol et un acide
Réplication procaryote
un seul point de démarrage, réplication bidirectionnelle
Structure en tonneau beta
via des liaisons hydrogène
Structure secondaire des protéines
via des liaisons hydrogène ou pont disulfure entre les aa 4 types de structure différente
Structure en hélice alpha
via des liaisons hydrogènes entre les CO et NH Chaîne R en périphérie
Structure en feuillet beta
via liaisons hydrogènes entre des liaisons peptidique
Transport actif primaire, pompe ATPase
via une pompe qui hydrolyse l'ATP
Phase G2
vérifier que l'ADN est correcte, préparation à la mitose
Exosome
vésicule <30 nm
Corps vésiculaire
vésicule >30nm
Jonctions serrées
Étanchéifier le tissu Claudine et occludine
Microscopie confocale
élimine les signaux localisés en dehors du plan de mise au point
Poche P du ribosome
élongation de la chaîne polypeptidique