Buněčná biologie

Jaké plyny obsahovala redukční atmosféra

(METAN, ČPAVEK, VODÍK, VODNÍ PÁRY) - BEZ KYSLÍKU

PŘíklad mimobuněčného signálu

(ligand, „primary messenger"): růstový faktor, cytokin, hormon, atd.

Vysvětli polarizaci mikrotubulů

+ konec (= dynamický konec) - konec (= zanořen v MTOC)

Jaké máme 3 vazebná místa na každém ribozomu a co se na ně váze

- A (AMINOACYLOVÉ) - VÁŽE AMINOACYL-TRNA − P (PEPTIDYLOVÉ) - VÁŽE TRNA, KE KTERÉ JE PŘIPOJEN ROSTOUCÍ POLYPEPTIDOVÝ ŘETĚZEC − E (EXIT) - VÁŽE TRNA ZBAVENOU AMINOKYSELINY PŘED POUŠTĚNÍM RIBOZOMU

3 druhy membránových lipidů + příklady

- FOSFOLIPIDY (NAPŘ. FOSFATIDYLSERIN) − STEROLY (NAPŘ. CHOLESTEROL) − GLYKOLIPIDY (NAPŘ. GALAKTOCEREBROSID)

Stavba aktinových filament

- G aktin (Globulární Aktin) - nepolymerizovaná forma aktinu (zásobní pool v cytoplazmě) - F aktin (fibrilární aktin) - polymerizovaný aktin - helikální struktura molekuly (aktinové filamentum má podobu dvoušroubovice - 2 navzájem se obtáčející polymery aktinu)

Výsledky Millerova experimentu

- HCN, FORMALDEHYD − KYSELINA MRAVENČÍ, MLÉČNÁ, OCTOVÁ, MOČOVINA − 17 AMINOKYSELIN − PURINY A PYRIMIDINY

Vysvětli pohybové funkce cytoskeletu

- INTRACELULÁRNÍ TRANSPORT (PŘESUN MATERIÁLU/MOLEKUL MEZI ORGANELAMI V BUŇCE) − POHYB CHROMOSOMŮ V ANAFÁZI (ROZCHOD CHROMOZOMŮ DO DVOU DCEŘINÝCH JADER) − POHYB BUNĚK PO SUBSTRÁTU =améboidní pohyb − POHYB BUNĚK POMOCÍ KINOCILIÍ (ŘASINKY A BIČÍKY) − SVALOVÁ KONTRAKCE (u živočichů)

Popiš všechny modifikace primárního transkriptu u eukaryot

- PŘIPOJENÍ ČEPIČKY NA 5' KONEC - TZV. „CAPPING" − PŘIPOJENÍ POLYADENYLAČNÍHO SIGNÁLU NA 3' KONEC − ODSTRANĚNÍ NEKÓDUJÍCÍCH SEKVENCÍ (INTRONŮ) − UMOŽŇUJÍ BUČE VYHODNOTIT, ŽE JE TRANSKRIPT INTAKTNÍ A MŮŽE BÝT PŘESUNUT DO CYTOPLAZMY − PODÍL NA TRANSLACI

Výhody kompartmentalizace

- vytvoření chemického mikroprostředí, které je vhodné pro daný typ chemických dějů (snížení difuze substrátů, obsah iontů, pH) -oddělení potenciálně nebezpečných, rozkladných dějů (hydrolytické enzymy - lyzozomy, oxidativní enzymy - peroxizomy) - dělba práce mezi organelami

Jaké 3 katalytické faktory mohli být příčinou proč mohlo dojít ke vzniku a sestavování biopolymerů

- zahřívání organických sloučenin - katalytická aktivita vysoce koncentrovaných anorganických polyfosfátů nebo dalších minerálních látek - autokatalytické schopnosti vzniklých polymerů - vzniklé polymery mohly samy katalyzovat vývoj dalších a došlo k selekci systémů se schopností autoreprodukce - to je otázka

Co se děje v exekutivní fázi apoptózy

- zmenšení (smrštění) buňky ▪ blebbing plazmatické membrány ▪ změny ve složení plazmatické membrány ▪ kolaps jádra (degradace chromatinu) ▪ proteolytické štěpení intracelulárních proteinů ▪ rozpad buňky na apoptotická tělíska ▪ fagocytóza apoptotických tělísek

Obecná struktura molekuly lipidu(PM)

1 HYDROFILNÍ HLAVIČKA A 2 HYDROFOBNÍ KONCE

Složení ECM + funkce jednotlivých složek

1. kolagenová vlákna (zajištění pevnosti v tahu; základní složkou kolagen) 2. elastická vlákna (zajištění pružnosti; základními složkami elastin a fibrilin) 3. výplňová komponenta (zábrana stlačování; základními složkami hyaluronany a proteoglykany) 4. adhezivní molekuly (glykoproteiny) Různé typy ECM v různých tkáních

Dva základní fundamentálně odlišné pohledy na vývoj + krátká charakteristika

1. kreacionizmus - buňky byly vytvořeny zásahem v jednodušších buňkách 2. evoluční teorie - nejjednodušší chemikálie, nejdříve anorganické, se seskupovaly do polymerů, které časem získaly schopnost replikace a seskupováním vznikla forma života označovaná jako protobiont - předchůdce forem života tak, jak ho známe dnes.

3 mechanizmy importu proteinů do membránových organel

1. pomocí jaderných pórů (přes jadernou membránu) 2. za použití proteinových translokátorů (transport do ER, mitochondrií, chloroplastů a peroxizomů) 3. za použití transportních váčků (transport z ER)

Jak moc jsou staré nejstarší Prokaryotní buňky + co využívali k výživě

3.5 miliardy let (nejprve využívaly metan, poté sulfáty, kyanovodík a teprve nakonec kyslík a prvními fotosyntetizujícími organizmy byly sinice)

V jakém směru probíhá replikace DNA5'->3'

5'->3'

Struktura kinocílie

= bičíkovité organely podélně tvořeny svazky mikrotubulů - princip struktury 9 + 2 (=> po obvodu 9 dupletů= dvojice mikrotubulů - jeden je kulatý a druhý na něj nasedá a má tvar polokruhu - 13 + 10 proto filament, uprostřed dva centrální Mikrotubuly ) - dobroty jsou vzájemně propojené dyneinem - dyneinová ramena napojena na dvojici centrálních mikrotubulů

Charakterizuj Shineovu-Dalgarnovu sekvenci

= sekvence 5' AGGA 3' PŘÍTOMNÁ V TRANSKRIPTECH PROKARYOT URČENÝCH K TRANSLACI NEZBYTNÁ PRO SESTAVENÍ RIBOZOMU VE SPRÁVNÉM MÍSTĚ TRANSKRIPTU - vazba ribozomu k mRNA UMÍSTĚNA 7 NUKLEOTIDŮ PROTI SMĚRU TRANSLACE OD INICIAČNÍHO KODONU AUG JE KOMPLEMENTÁRNÍ SEKVENCI BLÍZKO 3' KONCE 16S RRNA OBSAŽENÉ V MALÉ PODJEDNOTCE RIBOZOMU PÁROVÁNÍ BÁZÍ MEZI SD SEKVENCÍ MRNA A 16S RRNA RIBOZOMU UMOŽŇUJE ZAHÁJENÍ TRANSLACE

Popiš aktinová filamenta ve srovnání s Mikrotubuly

AF jsou ve srovnání s MT tenčí, pružnější (u MT rigidní struktura), kratší

Mechanizmus účinku fotodynamických barviv

AKTIVACE FOTODYNAMICKÉHO BARVIVA (ABSORBUJÍ VIDITELNÉ SVĚTLO) → PRODUKCE AKTIVNÍCH KYSLÍKOVÝCH RADIKÁLŮ → OXIDAČNÍ STRES

Jakým způsobem probíhá vazba Hsp70 na protein - vysvětli

ATP-dependentním způsobem,kdy chaperon napřed naváže ATP a tím je schopen reagovat s pomocným proteinem, přeměnit ATP na ADP a získaná energie umožní vazbu na nesbalený protein, který když se uvolní, nová molekula ATP nahradí na chaperonu ADP a umožní tak opětovné použití

Příklad nukleačního proteinu - proteiny asociované s aktinem + co zajisťují

Actin Related Proteins (ARPs) - větvení aktinových filament

Jaké proteiny zajišťují vazbu klathrinu na membránu a k receptorům nákladu transportovaných molekul

Adaptiny

Charakterizuj aktivitu MPF v průběhu BC

Aktivita MPF velmi výrazně osciluje v průběhu každého buněčného cyklu. Rychle se zvyšuje těsně před vstupem do mitózy a rychle klesá až k nule ke konci mitózy

Když se během Prometafáze chromozomy pohybují k opačným pólům buňky jedná se o aktivní nebo pasivní pohyb

Aktivní pohyb

Vysvětli celkové působení proteinu p53 když dochází k zastavení buněčného cyklu v G1 fázi

Aktivovaný p53 stimuluje transkripce genu, který kóduje Cdk inhibiční protein p21 -> tento protein se váže na komplex cyklin S-fáze-Cdk a inaktivuje ho, takže se buněčný cyklus zastaví právě v G1 dfáui

Co dělají enzymy v translaci

Aktivují aminokyseliny

Popiš složení Vezikulů = transportní váčky + Funkce

Ale organely vymezené lipidovou membránou, které se pohybují buňkou Zajišťují přepravu materiálu mezi oddíly sekreční/endocytické dráhy

Co to znamená amfipatické a jiný název

Amfifilní Obsahují trombofilní a hydrofobní část

Jaký druh enzymů hraje roli v translaci

Aminoacyl-tRNA syntetázy

Na co rozdělujeme Anafáze

Anafáze A Anafáze B

Sníží se počet chromozomů na polovinu přesně - při vzniku spermií a vajíček

Ano! Naprosto přesně

Porovnej celkovou délku AF v buňce ve srovnání s MT

Asi 30x větší - AF se narozdíl od MT mohou větvit (napojení ARP proteinů na AF, který je na nukleačním základem pro boční vlákno AF )

Jaké buňky jsou citlivější na ionizující záření

BUŇKY VYŠŠÍCH ORGANISMŮ - JSOU CITLIVĚJŠÍ (ČÍM EVOLUČNĚJI POKROČILEJŠÍ ORGANISMUS, TÍM VĚTŠÍ CITLIVOST VŮČI IONIZUJÍCÍMU ZÁŘENÍ) buňky s vyšším obsahem DNA a gamety proliferující buňky (kostní dřeň, lymfatické uzliny, zárodečné buňky - spermatogeneze, epitely, embryonální buňky)

K čemu slouží periplazmatický prostor a jaké organismy ho mají

Bakterie, sinice, rostliny, houby - prostor mezi PM a BS Bariéra mezi buňkou a okolím Regulace toku látek, energie a informací

Přehled adhezí mezi buňkami navzájem

Buněčné adheze adhezní pásy desmosomy Buněčné spoje těsné spoje mezerové spoje Rostliny: plasmodesmata

Jaké máme přímé interakci buněk + co to jsou přímé interakci buněk

Buněčné adheze - slabší Buněčné svoje - pevnější interakce Interakce mezi buňkami navzájem

S čím je spojen buněčné dělení u jednobuněčných organismů

Buněčné dělení je spojeno s růstem - udržování správné velikosti buněk

Co se vážou extracelulární signální molekuly

Buď k receptorům na povrchu buňky nebo k intracelulárním receptorům

Popiš co bylo dokázáno v teorie RNA světu

Bylo prokázáno, že RNA může vykazovat i katalytické vlastnosti a je tedy schopná za určitých okolností replikovat sama sebe i bez přítomnosti proteinů

V jaké fázi mi to že jsou chromozomy drženy pod značným napětím + jak se tento útvar nazývá

Během Metafáze - chromozomy jsou v metafázní destičce

Co se děje s GA a ER během Cytokineze

Během mitózy se rozpadají na fragmenty a poté při Cytokineze rovnoměrně distribuují Během cyklu dceřinných buněk pak dochází k jejich zvětšování

Jakým způsobem roste fragmoplast + dokdy fragmoplast roste

Centripetálně Dokud se nespojí s cytoplazmatickou membránu a původní buněčnou stěnou a nerozdělí buňku na dvě

Kde je ukotven na cytoplazmatické straně protein Ras

Cytoplazmatické straně plazmatické membrány

Rozdíl ribonukleotid vs deoxyribonukleotid

DEOXYRIBONUKLEOTID MÁ NA DRUHÉM UHLÍKU CUKERNÉHO ZBYTKU POUZE H RIBONUKLEOTID OBSAHUJE NA DRUHÉM UHLÍKU CUKERNÉHO ZBYTKU OH SKUPINU

Jakým způsobem došlo k vytvoření bakteriální buňky s umělým genomem

DESIGN, SYNTÉZA A SESTAVENÍ BAKTERIÁLNÍHO GENOMU MYCOPLASMA MYCOIDES JVCI-SYN01 • VNESENÍ UMĚLÉHO GENOMU DO BAKTERIE MYCOPLASMA CAPRICOLUM (PRVNĚ ODSTRANILY JEJÍ PŮVODNÍ GENOM) SE VŠEMI GENY, KTERÉ BAKTERIE POTŘEBUJE K ŽIVOTU → NOVÁ BAKTERIE SE SYNTETICKÝM GENOMEM

Co se předpokládá že byl zřejmě nejmladší biopolymer

DNA

Vysvětli spojení Okazakiho fragmentu

DNA-POLYMERÁZA PRODLUŽUJE RNA-PRIMER A TVOŘÍ NOVÉ VLÁKNO DNA − SYNTÉZA OKAZAKIHO FRAGMENTŮ SKONČÍ, JAKMILE DNA POLYMERÁZA NARAZÍ NA PRIMER PŘEDCHOZÍHO FRAGMENTU PŘI VYTVÁŘENÍ CELISTVÉ STRUKTURY DNA OPOŽĎUJÍCÍHO SE ŘETĚZCE DNA PAK PROBÍHÁ BEZ SE UPLATŇUJÍ OPRAVNÉ MECHANISMY - RNA-PRIMERY SE ODSTRANÍ A NAHRADÍ JE DNA

Jaký enzym zaceluje zářezy v DNA při replikaci

DNA-ligáza

A co zajišťuje konstitutivní - neřízená sekrece

DODÁVÁ NOVĚ VYTVOŘENÉ LIPIDY A PROTEINY DO PLAZMATICKÉ MEMBRÁNY ZODPOVÍDÁ ZA RŮST PLAZMATICKÉ MEMBRÁNY PŘED BUNĚČNÝM DĚLENÍM

Jakým způsobem se předpokládá že vznikla mRNA

DŮSLEDKU PŘIBLIŽOVÁNÍ AMINOKYSELIN A VZNIKAJÍCÍHO POLYPEPTIDOVÉHO ŘETĚZCE

Kam putují molekuly pohlcené Endocytózou

Do lysozomu, kde jsou ztrávený - metabolity vzniklé trávením se přenášejí do cytosolu kde je buňka může dále využít

Do čeho se spojují nukleotidy + typ vazby

Do polymerů - každý polynukleotidové řetězec je polymerem nukleotidů, které jsou k sobě vázány kovalentními fosfodiesterovými vazbami - propojení 5' uhlíku na jednom cukerném zbytku s 3' uhlíkem následujícího cukerného zbytku prostřednictvím fosfátu

Během transportních drah - průběžná modifikace přenášených molekul - co se děje v Lumen ER + Co je následkem

Dochází k tvorbě disulfidických můstků - díky oxidaci postranních řetězců cysteinu Nesvítí mi vyšší stabilita molekul a odolnost ke změnám pH ve vnějším prostředí

Rozdělení signálu živočišných buněk podle dosahu

Endokrinní Parakrinní Synaptické - nervové Přímý kontakt Autokrinní

Co může být cílovou molekulou - efektorem

Enzym Složka replikačního aparátu Složka aparátu pro genovou expresi Složka cytoskeletu

Co rozdvojuje dvoušroubovici DNA při replikaci

Enzym HELIKÁZA

Popiš funkci Jederného pórů

FUNGUJE JAKO SELEKTIVNÍ BRANKA, KTERÁ AKTIVNĚ PŘENÁŠÍ SPECIFICKÉ MAKROMOLEKULY A ZÁROVEŇ UMOŽŇUJE VOLNOU DIFÚZI MENŠÍCH MOLEKUL OBĚMA SMĚRY

Co se uplatňuje jako zásah v případě neplodnosti v důsledku nepohyblivosti spermií

Fertilizace in vitro (IVF): intracytoplazmatická injekce spermie (ICSI)

Jaké buňky zajišťují syntézu kolagenu v embryogenezi

Fibroblasty a epitelové buňky Obrázek = molekulární struktura kolagenu

Jaká barva používá MV fluorescenční mikroskopií pro vizualizaci cytoskeletu

Fluorochromy

Druhy interakce mezi buňkami a ECM

Fokální adheze Hemidesmozomy

Co se stane se strukturou poté co dojde k záměně GDP na GTP

G protein se rozdělí na podjednotku alfa navázaným GTP a na komplex podjednotek beta a gama

Jakýchproteinu se týká vazba GTP - Molekulové přepínače

G proteinů

Fáze Interfáze + základní charakteristika

G1 FÁZE - METABOLICKÁ AKTIVITA, RŮST BUŇKY, ZDVOJOVÁNÍ ORGANEL S-FÁZE - REPLIKACE DNA G2 FÁZE - METABOLICKÁ AKTIVITA, SYNTÉZA PROTEINŮ POTŘEBNÝCH K VSTUPU DO MITÓZY

Popiš cytokinezi II

Haploidní dceřiné buňky jsou odděleny svými plazmatickými membránami

Jaká forma chromatinu je nejvíce kondenzovaná+ kolik procent interfázního chromozomu tvoří

Heterochromatin - tvoří obvykle více než 10% interfázního chromozomu

Vysvětli kotranslační transport proteinů

Hledají si své místo v průběhu syntézy Přes ER do GA, Lysozomů, endosomů, peroxisomů- Přes proteinové translokátory

Jakých dvou dělení se skládá meióza popiš

I. meiotického (heterotypické, redukční) II. meiotického (homotypické, ekvační)

Co jsou to priony

Infekční proteiny Priony jsou původci neurodegenerativních onemocnění lidí a zvířat Patogenní priony mají stejnou primární strukturu (pořadí aminokyselin), ale liší se svým konformačním uspořádáním

Charakterizuj hodnotu informace vzniklou transkripcí

Informace si uchovává stejný obsah je podobnou chemickou povahu, ale je mobilnější

Aktivace p53 S vyšší hladinu inhibitoru čeho

Inhibitoru Cdk21 Pokud je DNA Poškozená zvýší se množství proteinu p53 A stává se tento protein aktivním

Které druhy Translace probíhají stejně U prokaryot a eukaryot a které ne

Iniciace probíhá jinak, Elongace a terminace probíhají U prokaryot eukaryot stejně

Fáze apoptózy

Iniciační a executivní

Typy membránových proteinů

Integrální proteiny Laterální proteiny Integrální transmembránové proteiny Periferní asociované proteiny

Co nahrazuje nepřítomnost buněčné stěny u živočišných buněk

Intermediální filamenta

Co je to metafázová destička

Je vytvořená chromozomy během Metafáze - chromozomy v ekvatoriální roviny Vřeténka

Popiš amplifikace signálu

Jeden signál stačí k vyvolání rozsáhlé odpovědi - jedna signální molekule aktivuje jediný receptor, jediný aktivovaný receptor však aktivuje větší počet molekul enzymu tvořícího sekundární Přenašeč, každá molekula tohoto enzymu katalyzuje tvorbu mnoha molekul sekundárního přenašeče, každá molekula sekundárního přenašeče aktivuje mnoho cílových molekul

Čemu se využívá schopnostem krevních buněk mě nic stupeň kondenzace Chromatinu

Jeden z mechanizmu pro kontrolu genové exprese

Co prochází že cytosolu do jádra přes jaderný pór

Jederné proteiny, transkripční faktory,..

Vysvětli roli proteinu p53

Jedná se o nádorový supresor p53- Jeho aktivaci je možná Apoptóza případě závažných chyb v průběhu buněčného cyklu A také zastavení buněčného cyklu v případě opravitelného poškození DNA V průběhu buněčného cyklu

Vysvětli cykliny a cyklin-dependentní kinázy

Jedná se o specifické degradační systémy Pro každou fázi existují specifické komplexy cyklin-CDK

Jakých buňkách funguje řízena sekrece z buňky + co se sekretu je například

Jen v buňkách zaměřeních na sekrecí - hormony, trávicí enzymy

Čím získávají receptory spojené s enzymy katalytickou schopnost

Jsou aktivované ligandem

Popiš Slinutý membrán pomocí SNARE proteinů

KE SPLYNUTÍ MEMBRÁN NEDOCHÁZÍ OKAMŽITĚ PO NAVÁZÁNÍ VÁČKU POŽADOVÁNO VELMI TĚSNÉ PŘIBÍŽENÍ Z HYDROFILNÍHO POVRCHU MEMBRÁNY MUSÍ BÝT ODSTRANĚNA VODY (ENERGETICKY NEVÝHODNÉ) FÚZE KATALYZOVÁNA ZVLÁŠTNÍMI PROTEINY, KTERÉ SE MUSÍ SESKUPIT DO KOMPLEXU A ZAJISTIT ENERGETICKY NÁROČNOU FÚZI

Popiš systém translace

KODONY V MRNA JSOU ROZEZNÁVÁNY ANTIKODONY V TRNA, KTERÉ NESOU SPECIFICKÉ AMINOKYSELINY

Co jsou to RNA - primery

KRÁTKÉ ÚSEKY RNA NUTNÉ PRO INICIACI REPLIKACE DNA

Popiš první krok barvení podle grama

KRYSTALOVÁ VIOLEŤ - TMAVÁ MODRO- FIALOVÁ BARVA - VAZBA NA PEPTIDOGLYKAN V BUNĚČNÉ STĚNĚ - všechny bakterie zbarvené do tmavě fialova - neodlišení grampozitivních a gramnegativních

Co je to attachment plaque

KULOVITÁ OBLAST, KDE SE SBÍHAJÍ VLÁKNA IF -> PŘES ASOCIOVANÉ PROTEINY VAZBA PŘES INTEGRINY NA ECM INTRACELULÁRNÍ VAZEBNÉ DOMÉNY INTEGRINŮ VAZBA NA KOMPLEX ASOCIOVANÝCH PROTEINŮ

Jaká onemocnění způsobují priony lidem

KURU (PRVNÍ OBJEVENÉ U LIDÍ - SPOJENÉ S KANIBALISMEM CREUTZFELD-JACOBOVA CHOROBA (CJD)

V kolik sad chromozomů nesou samatické buňky a od koho jednotlivé sady máme

Každá Somatická buňka obsahuje dvě sady chromozomů - jednu od otce a druhou od matky

Jaké proteiny najdeme v Bazální lamině + co tam zajišťují

Kolagen IV (síťová struktura) Laminin a entaktin (spojovací protein)=> Adhezivní Glykoproteiny

Kdy poškození buněk při vystavení buněk nízké teplotě ještě ireverzibilní

Kolem 0° C

Co se děje během telofáze

Kolem každé sady chromozomů se tvoří nový obal a vznikají dvě dceřiná jádra

Co je zodpovědný za vstup do M-fáze

Komplex MPF - mitosis promoting factor

Jaký komplex cyklin- CDK zajišťuje M-fázi BC

Komplex cyklin B a CDK - tzv. MPF Vysoká hladina cyklinu B tedy způsobuje vysokou aktivitu MPF

Typy myozinových proteinů( = motorové proteiny asociované s aktinovými filamenty) + co zajišťují

Konvenční typ II - Cytokineze, svalová kontrakce Nekonvenční typ I, III-XV - pohyb membránových vezikulů v blízkosti plazmatické membrány, tvorba vnitřní struktury protruzí plazmatické membrá

Co jsou to exony

Kódující sekvence - exprimováné úseky

Popiš endocytózu

LÁTKY V OKOLÍ BUŇKY JSOU UZAVÍRÁNY DO MEMBRÁNOVÉHO VEZIKLU (VZNIKÁ VCHLÍPENÍM PM), MĚCHÝŘEK SE ODDĚLUJE OD PM A PŘECHÁZÍ DO CYTOPLAZMY

Opožďující se vlákno anglicky

Lagging strand

Na co dělíme laminy (V. třida IF)+ Připojení čeho zajišťují

Lamin A - připojení interfázních chromozomů Lamin B - připojení fibrózní vrstvy na integrální proteiny vnitřní membrány jaderného obalu Lamin C - připojení interfázních chromozomů

Jaké pohyby v plazmatické membrány probíhají spontánně

Laterální difúze Rotace molekulu kolem své Podélné osy

Vedoucí vlákno anglicky

Leading strand

Jaké jsou fáze profáze meióze I

Leptotene Zygotene Pachytene Diplotene Diakineze

Jinak nazýváme signální molekuly

Ligandy

Kdo poprvé popsal elektronegativitu

Linus Pauling

Jak jinak přezdíváme hydrofobní signály a prostřednictvím čeho se pohybují v krvi a jak dlouho jsi tam udržují + Ostatní funkce

Lipofilní signály • v krvi se pohybují prostřednictvím nosičů - volně procházejí plazmatickou membránou • vážou se na cytoplazmatické nebo jaderné receptory • zprostředkovávají dlouhodobé odpovědi • v krvi setrvávají hodiny až dni (výjimka prostaglandiny)

Čím se liší izotopy

Liší se počtem NEUTRONŮ nikoliv protonů

Lokalizace čeho probíhá v jadérku + Proces dělení jadérka

Lokalizace genů pro rRNA (100-1000) Specifický proces - mitóza, meióza

charakterizuj lipidové rafty

Mají specifické složení (- jiné složení než fosfolipidy okolo) A větší tloušťku -v biomembráně vytvářejí ostrovy

Kolik nukleotidů má tRNA

Malá RNA (70-95 nukleotidů)

Nevýhoda fluorescenční mikroskopie

Malá hloubka ostrosti

Jak se ve starší literatuře označují aktinová filamenta

Mikrofilamenta

Jak se nazývají největší známe very které jsou větší než některé Prokaryotní organismy

Mimi viry

Jaké signály vyžadují živočišné buňky pro dělení, růst a přežití + 3 skupiny

Mimobuněčné signální molekuly - jsou produkovány jinými buňkami téhož organismu 1. Mitogeny 2. Růstové faktory 3. Faktory pro přežívání (survival factors)

Čeho je převaha U svalů a epitelů ECM nebo buněk+ proč

Minimum ECM - Redukce na velmi tenkou vrstvu - Bazální lamina mechanickou oporu zajišťuje Cytoskelet

Jaké organely neměli původní anaerobní Eukaryotní buňky+ Když se ti to organely objevily

Mitochondrie PO VZNIKU MITOCHONDRIÍ - VZNIK EUKARYONTNÍ AEROBNÍ BUŇKY (DNEŠNÍ PODOBA)

Třídění xenobiotik

Mnoho způsobů třídění chemické složení (těžké kovy, kyseliny, alkaloidy...) původ (chemické toxiny, biologické toxiny...) mechanismus působení (poškození DNA, cytoskeletu, inhibice proteosyntézy, respiračního řetězce...)

Kde vznikají AF

Mohou vznikat kdekoliv v bance - není nutná základní struktura jako u mikrotubulů MTOC

Jaké proteiny jsou ortologem aktinu + Na čem se podílí

MreB, MbI a MreBH Podílí se na udržování tvaru buňky, zejména u G- bakterií

Typy motorových proteinů asociovaných s aktinovými filamenty

Myoziny a tropomyoziny, troponin

Kolik kovalentních vazeb může vytvořit atom vodíku

Má pouze jeden elektron = může vytvořit pouze jedinou Kovalentní vazbu

Jakým způsobem může vyplňovala komponenta zajišťovat odolnost vůči tlaku

Má tendenci zaujímat velký objem

Jaké buňky jsou nejlépe odolné vůči nízkým teplotám

Málo vody: semena, spory psychrofilní bakterie

Jak častý je u bakterií parazitismus

Méně častý - intracelulární výjimečně ale většinou nezávislý

Co dělá syntetická biologie

NAVRHOVÁNÍ A VYTVÁŘENÍ BIOLOGICKÝCH KOMPONENT A SYSTÉMŮ, KTERÉ NEEXISTUJÍ V PŘIROZENÉM SVĚTĚ • NÁVRHY NA PŘESTAVOVÁNÍ EXISTUJÍCÍCH BIOLOGICKÝCH SYSTÉMŮ A JEJICH NÁSLEDNÉ VYTVÁŘENÍ

Co probíhá na hladkém endoplazmatickém retikulu

NENÍ SPOJENO S RIBOZOMY − ÚČAST V SYNTÉZE LIPIDŮ A STEROIDNÍCH HORMONŮ − DETOXIFIKAČNÍ REAKCE − KATABOLISMUS GLYKOGENU − ZÁSOBÁRNA CA2+

V čem se podívej synaptické signály

Na regulaci permeability membrány

Kde začíná syntéza všech proteinů

Na ribozomech v cytosolu- S výjimkou několika mitochondriálních a Chloroplastových proteinů

A co se začíná buňka rozpadat během apoptózy

Na spoustu malých váčků

Na co jsou specializovany mitochondrie a Chloroplasty

Na syntézu ATP

Kde je zahájena syntéza úplně všech proteinů

Na volných ribozomech

Kdy se začíná u rostlin vytvářet nová buněčná stěna

Na začátku Telofáze

Stačí pro maximální aktivitu MPF pouze vysoká koncentrace cyklinu B?

Ne - maximální aktivita MPF Vyžaduje totiž ještě fosforylaci určitých aminokyselin specifickou kinázou a defosforylaci jiných aminokyselin specifickou fosfatázou

Priony a viry jsou živé ano/ne

Ne - priony nepovažujeme za živé

Může Organela vzniknout de novo?

Ne!

Jsou nějakým způsobem rozeznatelné volné ribozómy a ribozómy váz. na Endoplazmatické retikulum?

Ne- Liší se jen proteiny které zrovna syntetizují

Jakým způsobem mohou protein Rb a traskripční faktory E2F Umožnit průchod bodem restrikce G1 fáze

Nefosforylovaný Rb váže klíčový faktor S-fáze E2F Aktivovaný E2F - zajistí expresi genů S-fáze

Jaký náboj nese fosfátová skupina

Negativní

Na co rozdělujeme stresové faktory- Při reakci buněk na stresové podmínky

Nespecifické a specifické stresové faktory

Charakterizuj způsob jakým DNA- polymerázy prodlužují již existující řetězec při replikaci DNA

Nesyntetizují DNA de novo ale prodlužují pouze již existující řetězec

Pro jaká spojení je typická Synaptická signalizace

Neuron - neuron Neuron - svalová buňka

Co tvoří Intermediární filamenta IV. třídy (Neurofilamenta, α-internexin)

Neurony

Čím se liší organismy od neživé hmoty co se týče uspořádanosti

Neživá hmota směřuje spíše k neuspořádanosti u organismu ty si udržují vysoký stupeň uspořádanosti

Co znamená de novo

Nově nasyntetizovaný

Jaké molekuly narozdíl od proteinu jsou schopné fungovat jako templaty pro svou vlastní syntézu

Nukleové kyseliny (polynukleotidy) Polynukleotidy podle pravidel o párování bází mohou vytvářet vodíkové můstky a syntetizovat komplementární vlákna a vznikají identická polynukleotidová vlákna.

Co je první stupeň kondenzace DNA

Nukleozom

Co je základní jednotkou kondenzace Chromatinu + popiš strukturu

Nukleozom = jádro nukleozomu je tvořeno komplexem 8 histonů Kolem jádra nukleozomu je obtočena DNA -tzv. 11nm vlákno

Z jakých genu jsou odvozeny nádorové supresory a z jaký genů onkogeny

Nádorové supresory - odvozené z antiproliferačních genů, již produkty zpomalují buněčný cyklus v kontrolních bodech Onkogeny - odvozeny od Proliferačních genů = tzv. Protoonkogenů, Jejich produkty napomáhají buněčnému dělení

Jak vysoká je hladina p53 ve zdravých buňkách

Nízká

Která etapa evoluce buněčných forem života jako jediná není experimentálně ověřena

OD ZÁRODEČNÉ POLÉVKY K PRVNÍM BUŇKÁM

V čem se liší složení lipidových raftů od biomembrány

Obsahují 3 až 5 krát více cholesterolu Jsou obohaceny o: sfingolipidy - živoč. buňka Fytosteroly - rostlinná buňka

Kdy obvykle začíná Cytokineze - fáze mitózy + kdy je Cytokineze dokončena

Obvykle začíná v Anafázi, ale není dokončena do vzniku obou dceřiných jader

Jakou membránou Jádra prostupuje pór

Oběma - vnější i vnitřní

Jaký protein je induktorem apoptózy

P53

Příčiny selhání apoptózy

PORUCHY VÝVOJE, PORUCHY HOMEOSTÁZE, RAKOVINA

Odkud pučí Klathrinové váčky + typ dráhy, Které se účastní

PUČÍ Z GOLGIHO APARÁTU V RÁMCI SEKREČNÍ DRÁHY A Z PLAZMATICKÉ MEMBRÁNY NA POČÁTKU ENDOCYTICKÉ DRÁHY

Jak se nazývá teorie jejíž hypotéza předpokládá že život byl na planetu zemi přinesen z vesmíru mikroorganismy, které v podobě sportutují kosmickým prostorem a v příznivých podmínkách se pokouší uchytit

Panspermie

Jak se nazývá chromozom od matky a otce

Paternální a maternální chromozom

Co přispívá ke stabilitě DNA dvoušroubovice mimo hlavní vazby

Patrové (Nekovalentní) interakce mezi aromatickými jádry

Jaká část jádra kontinuálně přechází v Lumen ER

Perinukleární prostor

Jaké organely slouží v eukaryotních buňkách k oxidaci toxických molekul

Peroxisomy, glykoxysomy

Popiš integrální proteiny

Pevná - nedílná součást biomembrány - připojené pomocí kovalentních vazeb k lipidům = pevně ukotveny

Typy lipidových raftů

Planární Kaveola

Jací prvoci se účastní intracelulárního parazitismu

Plasmodium malariae, Toxoplasma gondii

Jak se nazývá někdy rostlinná buňka hypertonickém roztoku

Plazmolýza

Jak se nazývá děj kdy je živoč. buňka v hypotonickém roztoku

Plazmoptýza

Jak se nazývá děj kdy je živoč. buňka v hypertonickém roztoku

Plazmorhiza

Kdy se signální sekvence odštěpuje od proteinů

Po navedení proteinů do cílových struktur

Popiš strukturu centriolu

Po obvodu 9 fibril (svazky 3 mikrotubulů : - A (kulovitý tvar) - B - C (nasedají na předchozí Mikrotubulus v oblouku) - spojené asociovanými protein i, uprostřed jeden centrální Mikrotubulus propojen pomocí asociovaných proteinů s fibrilami po obvodu

kdy nazýváme chromozom dceřinný

Po přerušení spojení mezi sesterskými chromatidami během Anafáze

Kdy se odštěpuje pyrofosfát při replikaci

Po připojení příslušných deoxyribonukleozidtrifosfát ve směru 5' - 3' - odštěpení pyrofosfátu -> vznik fosfodiesterovéť vazby

Kdy se odštěpuje adresová sekvence a jaký enzym toto zajišťuje

Po translokaci - signální Peptidáza

Kam zmizí a pop tická tělíska - malé váčky

Pohltí je makrofágy Nebo Dendritické buňky nevzniká zánětlivé ložisko

Co je to améboidní pohyb

Pohyb celých buněk po podkladu Pohyb buňky pomocí kortexu, bohatého na aktin Schopnost vytvářet různévýběžky - pohyb ve směru vytvářením výběžků

Co se děje v telofázi meiózy I

Pohyb chromozomů je dokončen a začínají se formovat nová jádra

Jak můžeme zajistit aby protein původně určený k přítomnosti v cytosolu přešel a nacházel se v ER

Pomocí genové exprese zajistíme výměnu adresové sekvence která změní lokalizaci proteinu

Jinak polypeptid

Protein

Proč je kontraktilní prstenec přechodná struktura

Protože se během Cytokineze neustále zmenšuje a nakonec při rozdělení buňky zcela zmizí

Jaké signály si během průběhu apoptózy přijímají

Přijetí negativního signálu ▪ zvýšení hladiny oxidačních látek v buňce ▪ poškození DNA (volné radikály, UVR, gama záření, chemoterapeutika) ▪ molekuly (death activators), které se napojují na specifické receptory (death receptors)

Co je příčinou a důsledkem nondisjunkce

Příčinou může být porucha centromer nebo porucha mitotického 12 aparátu Důsledkem nondisjunkce je aneuploidie

Jakýpak kteří jsou přímo adaptované na život v nízkých Teplotách

Psychrofilní bakterie

Které z typů bázi jsou větší (Pyrimidinové nebo purinové)

Purinové (A, G)

Jaký je význam meiózy

Párování homologický chromozomů, Který umožňuje crossing-over A tím i rekombinaci genů

Příklad katabolismu

Přeměna glukózy na CO2 a H2O

Jaký mechanizmus je principem vývoje buněk

Přirozený výběr

Co dělá aminoacyl-tRNA- syntetáza

Přiřazuje správnou AMK k tRNA => katalyzuje syntézu aa-tRNA Z toho vyplývá že tento enzym musí být přísně substrátově specifický

Vliv G proteinu na Iontové Kanály + příklad

Příklad regulace činnosti srdce nervová vlákna uvolňují acetylcholin, který se váže na receptor v buňkách srdečního svalu • aktivace proteinu G • komplex podjednotek βγ se váže ke kanálku pro K+ v membráně buněk srdečního svalu a otevře jej • změna elektrických vlastností svalové buňky - omezení frekvence stahů /relaxace

U jakého typu signálu se využívají mezerové spoje

Přímý kontakt

Jaké buňky mají vyšší absorpci světla

Případě pigmentů v buňce

Co umožňuje rozvolněný stav chromozomů

Přístup proteinů potřebných pro Expresy genů nebo replikaci

Já byla první molekula schopná replikace

RNA

Co prochází jadernými póry z jádra do cytosolu

RNA, Ribozomální Podjednotky, mRNA- Nesestřižená pre-mRNA Jádro neopouští

Hlavní tipy povrchových receptorů

Receptory typu iontových kanálků Receptory napojené na protein G Receptory váz. na enzym ( katalytické receptory)

Co jsou to fosforylační kaskády a jak vznikají

Regulační kináza/fosfatáza je často sama podrobena kontrole fosforylací jinou kinázou = Fosforylační kaskády

Co je základem fosfátu

Ribóza (RNA) Deoxyribóza (DNA)

Opak Fluidity

Rigidita

Jaké buňky mají glykoxysomy

Rostlinné buňky a buňky hub

Co znamená S u značení Pod jednotek ribozomu

S = SEDIMENTAČNÍ KONSTANTA - HODNOTA, PŘI KTERÉ RIBOZOMY SEDIMENTUJÍ (ODPOVÍDÁ JEJICH VELIKOSTI)

Čeho je schopná DNA-DEPENDENTNÍ RNA-POLYMERÁZA

SPOJIT DVA RIBONUKLEOZIDTRIFOSFÁTY NA TEMPLÁTU DNA

Uspořádání fibril kolagenu v kůži

STŘÍDAJÍCÍ SE VRSTVY KOLAGENU S RŮZNOU ORIENTACÍ - ZAJIŠTĚNÍ MECHANICKÉ ODOLNOSTI- Můžem přirovnat uspořádání celulózy

Co jsou to stresová vlákna a k čemu slouží

SVAZKY VĚTŠÍHO POČTU AF - STABILIZACE BUŇKY V OSE POHYBU

Charakterizuj expresi receptorů CAM

Selektivní exprese

Co je to SRP protein

Signal Recognition particle Přítomen v cytosolu, Váže se k signální sekvencí

Co přitahuje Ribozom s proteinem drsnému endoplazmatickém retikulu

Signální sekvence na N-konci Vznikajícího polypeptidu

Kdo řekl že virus je špatná zpráva zabalená do bílkoviny

Sir Peter Medawar

Různé typy jak zastavit buněčný cyklus například při poškození DN a a

Specifickými inhibitory komplexů Cdk/cykliny - ZVÝŠENÍ KONCENTRACE A AKTIVITY TRANSKRIPČNÍHO FAKTORU P53 − STIMULACE TRANSKRIPCE GENU P21 − PROTEIN P21 VÁŽE KOMPLEX CYKLIN S-FÁZE/CDK A INAKTIVUJE JEJ − CYKLUS SE ZASTAVÍ A NÁSLEDUJE OPRAVA DNA

Co přerušuje v buňkách Kovalentní vazby

Speciální proteinové katalyzátory - enzymy

A příklad proteinů které tvoří Membránový skelet + jednotlivé buňky

Spektrin (erytrocyty) Fodrin (nonerytroidní spektrin)

Čím je určeno spektrum receptorů které je buňka schopná vytvořit - odráží se od toho schopnost buňky reagovat na podněty

Spektrum receptorů je určeno geneticky

Typy elektronové mikroskopie

TEM - transmisní (prozařovací) SEM - skenovací (rastovací)

Co se děje když je snížena četnost apoptózy a Proliferace v normálu

TKÁŇ HYPERTROFUJE - OBJEVENÍ NEOPLASIE („NOVOTVAR") - NADBYTEK BUNĚK

K čemu slouží transportní vezikly v eukaryotních buňkách

TRANSPORT MATERIÁLU MEZI ORGANELAMI A PLAZMATICKOU MEMBRÁNOU

Jaký byl pravděpodobně první typ RNA Jsi jak vzniká

TRNA (NAPOJENÍ AMK), PROSTOROVÝMI INTERAKCEMI DOŠLO KE VZNIKU PRIMITIVNÍ PROTEOSYNTÉZY

Popiš vzhled sER

TRUBIČKY BEZ RIBOZOMŮ

Kolik izoforem CESA a jak uspořádaných najdeme V rozetě

TŘI IZOFORMY CESA JEDNA FORMA ZASTOUPENA JEDNOU, DRUHÁ DVAKRÁT A TŘETÍ TŘIKRÁT

V čemu slouží endosomy v eukaryotní buňce

TŘÍDĚNÍ ENDOCYTOVANÉHO MATERIÁLU

Jaké jsou dvě hlavní funkce proteinových plášťů okolo váčku

TVAROVÁNÍ MEMBRÁNY DO VÁČKŮ ZACHYTÁVÁNÍ MOLEKUL URČENÝCH K TRANSPORTU

Na co rozdělujeme transport přes Membránové organely

Transport jadernými póry Translokace do mitochondrií a chloroplastů Endoplazmatické retikulum

Kde se nachází signální sekvence

U ER

Jaký typ UV Záření má nepřímý efekt na buňky + co způsobuje

UVA, UVB (OXIDATIVNÍ STRES) - TVORBA KYSLÍKOVÝCH RADIKÁLŮ (ROS - REACTIVE OXYGEN SPECIES) → OXIDATIVNÍ POŠKOZENÍ CÍLOVÝCH MOLEKUL (DNA, PROTEINY, LIPIDY) A BUNĚČNÝCH STRUKTUR - NEJEDNÁ SE O TAK SPECIFICKÉ PŮSOBENÍ JAKO U UVC

jaký typ UV záření je mutagenní

UVC

Co je to extracelulární digese

UVOLŇOVÁNÍ LYSOSOMÁLNÍCH ENZYMŮ DO OKOLÍ BUŇKY - ÚČELNÁ, PATOLOGICKÁ

Kde je ukotvena signální molekula při přímém kontaktu

V membráně a zároveň je vystavena receptorů cílové buňky

Co vytváří protein FtsZ

Ve střední části buňky vytvářejí prstencovou strukturu (Z-ring), Která se účastní buněčného dělení (aktin a myosin u eukaryot)

Co jsou to Introny

Vnitřní Nekódující sekvence - interventing sequences

Jak vyrůstají Mikrotubuly

Z MTOC Prodlužování: na plus konec mikrotubulů se připojuji Heterodimery (na beta podjednotku se připojuje alfa podjednotka předchozího dimeru)

Funkce kontraktilního prstence

Zajišťuje dělení buněk - formuje se po obvodu ekvatoriální roviny v buňkách na konci buněčného cyklu ( viz. D)

Co je inhibitorem pohybu RNA-polymerázy- blokuje její pohyb

aktinomycin D

Co znamená zkratka CAM

cell adhesion molecules

Charakterizuj strukturu receptorů spojených s enzymy + Jakou povahu má enzymová aktivita

jeden transmembránový úsek doména vázající ligandy směřuje ven z buňky cytoplazmatická doména má enzymovou aktivitu buď sama o sobě a nebo tvoří s enzymem komplex • enzymová aktivita má proteinkinázovou povahu

Kolik se radu je stáří planety

na 4.5 miliardy let

Co je to nekroptóza

nekróza indukovaná specifickým faktorem

Jak staré jsou první Eukaryotní buňky

pouze 1.5 miliardy let

Popiš homogenizaci buněk

proces při kterém dojde k rozrušení membrány buňky a uvolnění buněčných součástí do roztoku

Co je to cytokineze

proces rozdělení cytoplazmy na dvě části a vznik dvou buněk

Co je to apoptóza

programovaná smrt buňky za účasti proteolytických enzymů (kaspázy, příp. další...)

Jaké jsou integrační prvky při integraci signálu v buňkách

především kinázy, které fosforylují složky alternativních drah

Co umožňují protein i navázané na chromozomech

svinutí tenkého vlákna DNA do kompaktnější struktury

Popiš adhézní pásy

vazba na aktinová filamenta (AF) → propojení AF v sousedních buňkách prostřednictvím kadherinů

Funkce Hsp90

váže se na steroidní hormony

Popiš konformační změnu receptoru - typ přenosu signálu

vyvolanou vazbou ligandu, která se projeví na vnitřní straně membrány typické pro receptory se sedminásobným vinutím membránou

Co dělají fosfolipázy

Štěpí esterové vazby ve fosfolipidech

Charakterizuj signální molekuly pro nitrobuněčné receptory

• nízká molekulová hmotnost • hydrofobní povaha • jejich receptory jsou zároveň efektory

Jakým pokusem došlo k objevu MPF

− MIKROINJEKCE CYTOPLAZMY VAJÍČEK DRÁPATKY V M-FÁZI DO OOCYTŮ − M-FÁZOVÁ CYTOPLAZMA (NIKOLI INTERFÁZOVÁ KONTROLA) INDUKUJE ZAHÁJENÍ MITÓZY OOCYTŮ − JEDNÁ SE O DŮSLEDEK PŘÍTOMNOSTI MPF

Popiš fungování klathrinových váčků

− MOLEKULY KLATHRINU SE NA CYTOSOLOVÉ STRANĚ MEMBRÁNY SKLÁDAJÍ DO SÍTĚ − MEMBRÁNU TAK NUTÍ K ZAŠKRCENÍ DO PODOBY VÁČKU − MALÝ GTP-VÁZAJÍCÍ PROTEIN DYNAMIN SE OBTÁČÍ KOLEM VCHLÍPENÉHO VÁČKU − HYDROLÝZOU GTP SE DYNAMIN UTÁHNE A ODŠKRTÍ VÁČEK OD MEMBRÁNY

Co dělají takzvané obecné transkripční faktory u eukaryot

− NAVÁDĚJÍ EUKARYOTICKOU RNA-POLYMERÁZU PŘESNĚ NA PROMOTOR − PODÍLEJÍ SE NA ROZVOLNĚNÍ ŘETĚZCŮ DNA PŘED ZAČÁTKEM TRANSKRIPCE − UVOLŇUJÍ RNA-POLYMERÁZU Z PROMOTORU PŘI PŘECHODU Z INICIACE DO ELONGACE

Co všechno se odehrává po transkripci u eukaryot = modifikace čeho

- Modifikace primárních transkriptů (hnRNA) -> Modifikace 5. konce transkriptu -> Modifikace 3. konce transkriptu -> SESTŘIH - SPLICING

Kolik monosacharidů má Oligosacharid

2-10

Z kolika složek se skládá nukleotid a jaké to jsou

3 složky - cukr, fosfát, dusíkaté báze spojené kovalentními vazbami

Jaká molekula se spojí s jakou při odstraňování primeru

3' OH KONEC JEDNOHO OKAZAKIHO FRAGMENTU SE SPOJÍ S 5' P KONCEM SOUSEDNÍHO OKAZAKIHO FRAGMENTU DNA-LIGÁZOU

Poločas rozpadu uhlíku 14C

5730 LET (+/- 30 LET)

Kolik existuje na světě přirozených prvků

90 PŘIROZENÝCH PRVKŮ

Jaké jsou 3 ionizující kategorie

A, B, I-

Jak se jinak nazývá lipidová dvojvrstva

Bilayer

Kdy vznikají během mitózy kinetochory

Během pozdní Profáze

Co je přesnější RNA/DNA-polymerázy

DNA polymerázy

Co je to osmóza

Difuze vody přes selektivně propustnou membránu - prochází rozpouštědlo nerozpuštěná látka Jedná se také o pasivní proces

Vysvětli protein tubulin + kde ho najdeme

Dimerní protein - skládá se ze dvou podjednotek - alfa-tubulin a beta tubulin = heterodimery Gama- tubulin - pouze v MTOC (mikrotubuly organizující centrum - Centrozom, Bazální tělíska)

Co se děje během Anafáze A

Dochází ke zkracování kinetochorových mikrotubulů A připojené chromozomy jsou tak od sebe od stahovány Na Kinetochorách je generována síla, která táhne dceřiné chromozomy k pólu jejich Vřeténka

To je to peptidyltansferaa

Enzym katalyzujecí vznik peptidové vazby při translaci, součást velké Podjednotky ribozomů

Který typ bakterií dělíme na G+ a G- + vysvětli

Eubakterie G+ mají jednodušší buněčnou stěnu s relativně velkým množstvím peptidoglykanu G- méně peptidoglykanu a jsou strukturálně jednodušší

Kde je syntetizovaná celulóza

Extracelulárně

Co je to Fagocytóza a Pinocytóza

Fagocytóza - pohlcování větších částic Pinocytóza - pohlcování malých částic/kapalin

Příklad přirozené fúze

Fertilizace (oocyt+ spermie), vznik syncitia (membrány myocytů) Membránové váčky spolu fúzují - normálně buňky spolu nefúzují

Pomocí jaké skupiny proteinů dochází k oddělení dceřinných buněk při binárním dělení + Kde se tento protein polymerizuje za normálních podmínek a kde při oddělování dceřinných buněk

FtsZ ZA NORMÁLNÍCH PODMÍNEK POLYMERIZOVÁN POD CYTOPLAZMATICKOU MEMBRÁNOU - PŘI DĚLENÍ POLYMERIZUJE VE STŘEDOVÉ ROVINĚ BAKTERIÁLNÍ BUŇKY (FTSZ RING) A DÍKY JEHO KONTRAKCI DOCHÁZÍ K ODDĚLENÍ BUNĚK

Jaké jsou hlavní třídy chaperonů

Hsp70 Válcovité chaperoniny Hsp60 Hsp90

Kam směřuje při lipidové dvojvrstvy hydrofilní a hydrofobní část

Hydrofilní - směřuje vně Hydrofobní - směřuje dovnitř membrány

Jakým způsobem působí receptor pro tyroidní hormon když se váže na DNA I za nepřítomnosti ligandu

Jako represor transkripce = Bílkovina která se váže na operátor a tím inhibují je transkripce

Význam cAMP

Je rozpustný = snadno difunduje buňkou aktivuje efektory: např. cAMP-dependentní proteinkinázu A kináza A fosforyluje různé substráty a mění tak jejich aktivitu (např. regulátory genové exprese)

K jakým proteinům se Hsp70 nevážou

Je správně sbaleným proteinů

Popiš vzhled mikrotubulu

Je to ta trubička

Charakterizuj evoluční vývoj cyklinů a CDK

Jistou evoluční konzervativní - jen nepatrné strukturní odlišnosti U různých organismu - defektní cyklin nebo CDK U kvasinek může být nahrazen lidskými varianta mi těchto proteinů

Jak je hlavní plášťový protein klathrinových váčků

Klathrin

Popiš identitu každé organely

MÁ CHARAKTERISTICKÉ ZASTOUPENÍ PROTEINŮ A LIPIDŮ V PLAZMATICKÉ MEMBRÁNĚ

Co určuje načasování Cytokineze u živočichů

Mitotické vřeténko

Co by nemohla buňka dělat bez aktinových filament

Nemohla by se pohybovat na podkladu, nemohla by pohlcovat velké částice pomocí fagocytózy, aniž by se nemohla dělit

Na co dělíme asociované proteiny s aktinovými filamenty

Nemotorové a motorové proteiny

Lat. jadérko

Nucleolus

Od koho chaperoniny Hsp60 príjimají nesbalené proteiny

Od Hsp70

Struktura primární cílie

Organizační princip 9 + 0 - nemá centrální Mikrotubulus, jen 9 fibril po obvodu- Nevyskytují se zde dyneinová ramena A jsou nepohyblivé

Oxidace jakých molekuly je energeticky velmi výhodná

Oxidace uhlovodíkových molekul

Jaké jsou asociované proteiny s III. třídou IF

PLECTIN, FILENSIN, EPINEMIN, PARANEMIN

Co se váže na NLS

Pomocné cytosolové proteiny = importiny, Které navádějí protein k póru a zajišťují jeho translokaci

Pomocí čeho se překládá genetická informace z mRNA do sekvence AMK v polypeptidu

Pomocí genetického kódu

K čemu jsou připojeny kinetochorové mikrotubuly během metafáze

Párové kinetochory jsou připojeny k opačným pólům Vřeténka

Přesto jsou propojené Mikrotubuly s celulózovými vlákny

Přes asociované proteiny

Co rozhoduje o způsobu vstupu signálních molekul do buňky

Rozpustnost

Jakými poruchami často souvisí abnormální signalizace z receptorů spojených s enzymy

S poruchami proliferace, diferenciace, životaschopnosti, migrace buněk (rakovinou)

Příklad buňky která nemá ER

Spermie

Co je to homodimerace + kdy probíhá během aktivace kaspáz

Spojení dvou molekul kaspáz Probíhá úplně na konci

Jaký inhibitor inhibuje depolymeraci mikrotubulů

Taxol

Kolik mikrotubulů je tak na jeden Kinetochor během prometafáze navázaný

Tento počet se různí mezi jednotlivými druhy - u lidských Kinetochor je to 20 až 40 mikrotubulů na 1 kinetochor

Jak se nazývají bakterie a do jakého typu ba který patří které mají tolik toleranci extrémně vysokým teplotám plus nějaké rozmezí jejich ideálních teplotních podmínek

Termofilní bakterie - archeabakterie (~90oC)

V jakém prostředí se tvoří pravotočivá A-DNA

Tvoří se v dehydratujícím prostředí

Co umožní mezerové spoje (gap junction)

Umožňují přímou výměnu Iontů a dalších malých molekul mezi buňkami

Kdy dochází ke zduplikování chromozomů

V S- fázi

V jakém typu RNA Se často objevují atypické Nukleotidy

V tRNA

Čím se zabývá molekulární patologie

VLIV STRESOVÝCH PODMÍNEK OKOLÍ NA ŽIVOTNÍ PROJEVY NA MOLEKULÁRNÍ ÚROVNI

Co zřejmě zařizovala Plazmatická membrána U předchůdců prvních eukaryot a proč

VŠECHNY MEMBRÁNOVÉ FUNKCE (VČETNĚ SYNTÉZY ATP) - umožněno malou velikostí buněk

Jak se lysozomy chrání před působením hydroláz

VYSOKÝ STUPEŇ GLYKOSYLACE MEMBRÁNOVÝCH PROTEINŮ

Jakým způsobem napodobovali prvotní podmínky na zemi při Millerově experimentu

VYTVOŘIL K TOMU UZAVŘENÝ SYSTÉM S VÝCHOZÍ SMĚSÍ PLYNŮ (METHAN, ČPAVEK, VODA (PÁRA), VODÍK) ELEKTRICKÉ VÝBOJE DO PLYNNÉ SMĚSI - VE SNAZE NAPODOBIT, CO SE KDYSI DĚLO KONDENZACE VODY A NÁSLEDNÁ ANALÝZA ROZTOKU (POMOCÍ CHROMATOGRAFIE)

Kde se vyskytují archeabakterie hojně

VÝSKYT NA EXTRÉMNÍCH STANOVIŠTÍCH - KONCENTROVANÉ ROZTOKY SOLÍ, HORKÁ/KYSELÁ SOPEČNÁ VŘÍDLA, ANAEROBNÍ PODMÍNKY (DNO OCEÁNŮ, SPLAŠKY...)

Jakým způsobem se aktivují receptorové kinázy

Vazbou ligandu ligand-dependentní dimerizace receptorů • kontakt sousedních receptorů aktivuje jejich kinázovou aktivitu - dojde k vzájemné fosforylaci

Jak nejspíše vznikly membrány membránových organel

Vchlípením plazmatické membrány

Popiš světelnou mikroskopy ve světlém poli

Ve světelným poli = klasický typ Fázový kontrast - diferenciálně - interferenční kontrast - liší se v pracování se světlem procházejícím pozorovaným objektem

Jakou pod jednotku ribozomu opouštějí nově vytvořené proteiny

Velkou

Jak se může rostlina nakazit viroidem

Viroidy se chovají patogenně - dostanou se přes zranění rostliny -> změna fenotypu

Z čeho se skládají myofibrily

Z řady stejných malých kontraktilní ch pod jednotek - sarkomer

Popiš SNARE proteiny

Zajišťují rozeznání cílové struktury při transportu váčků po buňce Jedná se o takzvané molekulární značky které nesou na svém povrchu transportní váčky a cílové membrány Zajišťují rozpoznání, nikoliv fúzi membrán

Co Se stane receptorů typu iontových kanálků když se na něj naváže nervový mediátor

Změní tento typ receptorů konformaci a tím otevře nebo zavře kanál pro průtok specifických iontů

Jak se nazývá ději kdy je rostlinná buňka v hypotonickém roztoku

Zvýšení turgoru

Jakými dvěma způsoby může dojít k abnormalitám v průběhu meiózy

a) nerovnoměrným crossing-overem b) neoddělením homologických chromozomů - tzv. nondisjunkce

Co je inhibitorem vazby na RNA-polymerázu

alfa-amanitin, ethionin, lomofungin

Popiš Autokrinní signalizaci

buňka vydávající signál je zároveň buňkou cílovou

Struktura proteoglykanů

centrální protein + řetězce GAG (glykosaminoglykany)

Co je to dystrofie

chorobný stav způsobený poruchou výživy tkání nebo látkové výměny provázený změnami vzhledu

Co je to autofagie

degradace buněčných komponent / organel pomocí lysozomů

Co jsou to filopodia

dlouhé tenké výběžky povrchu živočišné buňky Někdy mají „průzkumnou" funkci

Charakterizuj Endokrinní signály živočišných buněk

jsou vylučovány do krevního oběhu a mohou být přenášeny na velké vzdálenosti difuzí

Co se stane po aktivaci kaspázi 8

kaspáza 8 štěpením dalších prokaspáz spouští proteolytickou kaskádu

Jaké specifické inhibitory blokují cytochromy respiračního řetězce

kyanidy, 2,3-dimerkaptoetanol (Lewisit)

Příklad mimobuněčného signálu

například růstový faktor, cytokin, hormon, atd.

Interakce CAM

navzájem mezi buňkami (cell-cell) s ECM (cell-matrix)

Různé mechanizmy integrací signálu

některé proteiny slouží jako spojnice toku informací různých drah nebo aktivní protein vzniká z podjednotek pouze tehdy, jsou-li obě fosforylovány, apod.

Jakým způsobem působí oxid dusnatý

prochází plazmatickou membránou a přímo aktivuje cílové enzymy nemění genovou expresi - rychlejší odezva snadno difunduje z buněk produkčních do buněk cílových působí lokálně a existuje jen krátkodobě (reakcí s vodou a kyslíkem se mění na dusičnany a dusitany)

Jak se organely v eukaryotické buňky se zvětšují

přidáváním nových molekul proteinů (lipidů)

Co je to fokální adheze

připojení aktinových filament (AF) k ECM prostřednictvím integrinů VAZEBNÉ DOMÉNY INTEGRINŮ (2 PODJEDNOTKY - Α A Β) SE VÁŽOU NA KOLAGENOVÁ VLÁKNA V ECM → PŘES ASOCIOVANÉ PROTEINY NEPŘÍMÉ NAPOJENÍ NA AF

Co zajišťují centromery

zajišťují rozchod replikovaných chromozomů do dceřiných buněk při buněčném dělení Centromera také pomáhá držet u sebe duplikované chromozomy do doby, než jsou připraveny se rozejít

Co dělají fosfolipázy jako inhibitory - působící na změnu funkce Biomembrán

změna fosfolipidů → tvorba micel

Výsledek fosforylační kaskády aktivované Ras

změna chování buněk obvykle v úrovni jejich proliferace nebo diferenciace

Typy transportních váčků

− KLATHRINOVÉ S NEJMÉNĚ DVĚMA TYPY ADAPTINU − VÁČKY COP (COAT PROTEIN)

Co dělá zona pellucida+ co to je

(TLUSTÁ VRSTVA) U OOCYTŮ - CHRÁNÍ OOCYT A REGULUJE PŘÍSTUP SPERMIÍ K MEMBRÁNĚ ŽIVOČICHŮ, ZABRAŇUJE OPLODNĚNÍ VAJÍČKA VÍCE SPERMIEMI= polyspermie

Popiš modifikaci 3' konce transkriptu

- ENZYMATICKÉ PŘIPOJENÍ CCA 250 KOPIÍ ADENINU − STABILIZACE MRNA (ZVÝŠENÍ ODOLNOSTI VŮČI BUNĚČNÝM NUKLEOVÉ KYSELINY V OBLASTI FOSFODIESTEROVÉ VAZBY) − PODÍL NA EXPORTU MRNA Z JÁDRA

Charakterizuj amonacyl-tRNA co dělá

- JSOU VLASTNÍMI SUBSTRÁTY PROTEOSYNTÉZY NA RIBOZOMECH − UMOŽŇUJÍ PŘIRAŽENÍ SPRÁVNÉ AMINOKYSELINY K PŘÍSLUŠNÉMU KODONU V MRNA − UMOŽŇUJÍ PŘÍSTUPNOST ANTIKODONU PRO REAKCI S KODONEM − PREZENTUJÍ AMINOKYSELINY V TAKOVÉ PROSTOROVÉ KONFORMACI, KTERÁ UMOŽŇUJE TVORBU PEPTIDOVÝCH VAZEB

Popiš iniciaci transkripce u bakterií

- K JÁDRU RNA-POLYMERÁZY SE PŘIPOJUJE FAKTOR SIGMA − TENTO KOMPLEX KLOUŽE PO MOLEKULE DNA − POKUD PŘI POHYBU PO DNA NARAZÍ NA SPECIFICKOU NUKLEOTIDOVOU SEKVENCI (PROMOTOR), NAVÁŽE SE NA NI PEVNĚJI − PROMOTOR PŘEDSTAVUJE STARTOVNÍ BOD TRANSKRIPCE − FAKTOR SIGMA ZAJISTÍ ROZEZNÁNÍ PROMOTORU DÍKY SPECIFICKÝM INTERAKCÍM S BÁZEMI PROMOTORU

Charakterizuj působení kovalentních a nekovalentních vazeb

- KOVALENTNÍ VAZBY SPOJUJÍCÍ ATOMY DO MOLEKUL − NEKOVALENTNÍ INTERAKCE TVOŘÍCÍ „LEPIDLO", KTERÉ STABILIZUJE STRUKTURU MOLEKUL A UMOŽŇUJE JEJICH SPOJOVÁNÍ

Typy stresových reakcí buňky

- NAPROGRAMOVANÝ ADAPTAČNÍ STRES - V PŘÍPADĚ, ŽE STRES NENÍ PŘÍLIŠ ROZSÁHLÝ − > CÍLEM JE OCHRANA PŘED NEPŘÍZNIVÝMI DŮSLEDKY PŮSOBENÍ STRESOVÉHO FAKTORU − ZMĚNA GENOVÉ EXPRESE (BUŇKA NESE GENY, KTERÉ JÍ POMÁHAJÍ ZVLÁDAT STRES) → SYNTÉZA STRESOVÝCH PROTEINŮ A DALŠÍCH PROTEINŮ, KTERÉ BUŇCE POMÁHAJÍ KOMPENZOVAT STRES (NAPŘ. STRESOVÉ PROTEINY CHAPERONY NEBO SYNTÉZA PROTEINŮ NAHRAZUJÍCÍCH POŠKOZENÉ PROTEINY)

RNA- polymerázy co dělají během transkripce

- POHYBUJÍ SE PODÉL DNA, POSTUPNĚ ROZVÍJEJÍ DVOUŠROUBOVICI, OBNAŽUJÍ TEMPLÁTOVÝ ŘETĚZEC PRO PÁROVÁNÍ S KOMPLEMENTÁRNÍMI BÁZEMI − KATALYZUJÍ TVORBU FOSFODIESTEROVÝCH VAZEB MEZI RIBONUKLEOTIDY − VZNIKAJÍCÍ ŘETĚZEC RNA SE PRODLUŽUJE VE SMĚRU 5'→ 3' − SUBSTRÁTY POLYMERACE JSOU RIBONUKLEOSIDTRIFOSFÁTY ATP, CTP, UTP A GTP

Vysvětli morfologické a strukturní funkce cytoskeletu

- POMÁHÁ UDRŽOVAT TVAR BUNĚK VČETNĚ CYTOPLAZMATICKÝCH PROTRUZÍ (VÝBĚŽKY CYTOPLAZMY) − ODOLNOST VŮČI VNĚJŠÍM MECHANICKÝM VLIVŮM − PODÍLÍ SE NA VNITŘNÍ ORGANIZACE BUNĚK (ORGANELY JSOU POMOCÍ ASOCIOVANÝCH PROTEINŮ SPOJENY S CYTOSKELETÁLNÍMI VLÁKNY - ZAJIŠTĚNÍ PROSTOROVÉ ORIENTACE A KOMUNIKACE MEZI NIMI)

Odlišnost transkripce s replikací

- PŘEPISUJE SE JEN JEDEN A NIKOLIV OBA ŘETĚZCE − VZNIKLÝ ŘETĚZEC RNA NEZŮSTÁVÁ PŘIPOJEN K DNA, ALE ODVÍJÍ SE OD NĚJ (OBNOVENÍ DVOUŠROUBOVICOVÉ STRUKTURY DNA) − VELIKOST TRANSKRIPTŮ JE PODSTATNĚ MENŠÍ NEŽ VELIKOST GENOMU − TRANSKRIPCI ZAJIŠŤUJE DNA-DEPENDENTNÍ RNA-POLYMERÁZA, ZATÍMCO REPLIKACI KATALYZUJE DNA-DEPENDENTNÍ DNA-POLYMERÁZA - NEJSOU POTŘEBA ŽÁDNÉ PRIMERY

Popiš modifikace 5' konce transkriptu

- PŘIPOJENÍ 7-METYLGUANOSINU (ČEPIČKA) − NASTÁVÁ PO SYNTÉZE PRVNÍCH CCA 25 NUKLEOTIDŮ − POMÁHÁ BUŇCE ODLIŠIT MRNA OD JINÝCH RNA − PŘEDSTAVUJE VAZEBNÉ MÍSTO PRO „CAP-BINDING COMPLEX" (CPC), KTERÝ NAPOMÁHÁ SESTŘIHU A EXPORTU TRANSKRIPTU Z JÁDRA − PODÍLÍ SE NA ŘÍZENÍ TRANSLACE MRNA

Vysvětli pohyb pomocí kinocilií

- Pohyb celých buněk

Vysvětlit průběh transkripce u bakterií

- RNA-POLYMERÁZA SE NAVÁŽE NA PROMOTOR A ROZVOLNÍ DVOUŠROUBOVICI DNA − OBNAŽÍ SE NĚKOLIK NUKLEOTIDŮ NA KAŽDÉM ŘETĚZCI DNA − PO PŘIPOJENÍ A SPOJENÍ PRVNÍCH CCA 10 RIBONUKLEOTIDŮ SE OSLABÍ VAZBA MEZI RNA- POLYMERÁZOU/PROMOTOREM A JÁDREM ENZYMU/FAKTOREM SIGMA − DOJDE K UVOLNĚNÍ FAKTORU SIGMA − NASTÁVÁ ELONGACE TRANSKRIPCE, KTERÁ POKRAČUJE, DOKUD ENZYM V DNA NEZAZNAMENÁ TERMINÁTOR - ZDE SE POHYB RNA-POLYMERÁZY ZASTAVÍ − ŘETĚZEC RNA SE UVOLNÍ (TERMINACE TRANSKRIPCE)

Charakterizuj vrstvy e- orbitalů a kolik elektronů mohou obsahovat + kolik vrstev mají typicky atomy v biologických systémech

- VRSTVA NEJBLIŽŠÍ JÁDRU OBSÁHNE MAXIMÁLNĚ 2 ELEKTRONY − DRUHÁ A TŘETÍ VRSTVA MŮŽE OBSAHOVAT PO 8 ELEKTRONECH − ČTVRTÁ A PÁTÁ VRSTVA MOHOU OBSAHOVAT PO 18 ELEKTRONECH ATOMY S VĚTŠÍM POČTEM VRSTEV, NEŽ ČTYŘI JSOU V BIOLOGICKÝCH SYSTÉMECH VELMI VZÁCNÉ

Podobnosti transkripce s replikací DNA

- ZAČÍNÁ ROZVOLNĚNÍM MALÉ OBLASTI DVOUŠROUBOVICE DNA V DEFINOVANÉM MÍSTĚ - OBNAŽENÍ NĚKOLIKA BÁZÍ OBOU ŘETĚZCŮ − JEDEN Z ŘETĚZCŮ SLOUŽÍ JAKO TEMPLÁT PRO SYNTÉZU VLÁKNA KOMPLEMENTÁRNÍHO (RNA), KTERÁ PROBÍHÁ VE STEJNÉM SMĚRU 5'→ 3' − VÝBĚR ZAČLEŇOVANÉHO NUKLEOTIDU VYPLÝVÁ Z PRAVIDEL O PÁROVÁNÍ BÁZÍ − NOVÝ NUKLEOTID JE DO ROSTOUCÍHO VLÁKNA PŘIPOJEN KOVALENTNÍ VAZBOU − VZNIKLÁ RNA JE PŘESNOU KOMPLEMENTÁRNÍ VERZÍ TEMPLÁTOVÉHO ŘETĚZCE

Jak ovlivňuje G protein hladinu cAMP

- adenylátcykláza je pod kontrolou proteinu G • účinek může být stimulační nebo inhibiční - dáno typem proteinu G

V jakých případech je Apoptóza také nezbytná pro likvidaci buněk, které představují ohrožení organismu

- buňky infikované viry ▪ efektorové buňky imunitního systému po odeznění imunitní odpovědi ▪ buňky s poškozením DNA = zvýšená produkce proteinu p53 (induktor apoptózy) ▪ nádorově transformované buňky

Několik funkcí signálních kaskád

- fyzicky přenášejí signál - transformují signál do molekulární podoby, Která může stimulovat patřičnou odpověď - Ve většině případů signál zesilují - amplifikují - Mohou signál rozdělit tak, aby současně ovlivnil několik dějů - Signál může být modulován podle podmínek, které uvnitř a vně buňky převládají

Popiš amplifikace signálu

- jedna signální molekula aktivuje jediný receptor • jediný aktivovaný receptor aktivuje větší počet přenašečů • každý přenašeč může zajistit odezvu

Popiš receptory napojené na G-protein

- nemají enzymovou aktivitu • řídí aktivitu efektorů prostřednictvím proteinu G („GTP-binding regulatory protein")

Co jsou cílové efektory fosforylační kaskády aktivované Ras

- proteiny, které změní aktivitu - transkripční faktory, které změní spektrum exprimovaných genů

Příklady kde je Apoptóza nezbytná pro řádný vývoj organismu

- resorpce ocásku během metamorfózy pulce v žábu ▪ odstranění tkáně mezi prsty během embryogeneze ▪ odstranění nadbytečných neuronů při vytváření synapsí v mozku ▪ uvolňování endometria na počátku menstruace

Jaké jsou dvě formy organizace chemických reakcí v buňce

- soustředění enzymů ke katalýze určitého sledu reakcí do jednoho proteinového komplexu (například syntéza DNA, RNA proteinů) - soustředění metabolických dějů do buněčných oddílů ohraničených membránou

Kolik je obvykle mitochondrií v buňkách a na co jsou napojeny

1-několik 1000, napojeny na Mikrotubuly (cytoskelet)

Evoluční větve buněk - 3 + krátká charakteristika

1. Archebakterie - evolučně nejstarší typy buněk, vyskytují s v nejextrémnějších podmínkách (horké prameny, slané prostředí, pH extrémy). Toto prostředí odpovídá podmínkám, které se vyskytovaly na planetě v době právě vývoje buněk. 2. Bakterie (eubakterie) - většina prokaryotních forem života 3. Eukaryota - buňky se složitější vnitřní strukturou s kompartmenty (funkčně odlišné oddíly) a jinak utvořeným jádrem s rozdílně uloženou informací DNA

Dva způsoby vstupu Ca2+ do cytosolu

1. Depolarizací membrány - AP - Otevření vápníkových kanálku 2. Otevřením kanálků pro Ca2+ inozitoltrifosfátem (IP3)

Popiš Lytický cyklus viru

1. Napadení buňky 2. Vytvoří se nové částice = viriony 3. Lýza buňky - viriony se uvolní do prostředí

Popiš lyzogenní cyklus buňky v li zoogenní cyklus buňky

1. Napadení buňky DNA virem 2. Jeho genom se začlení do chromozomu buňky hostitelské 3. Hostitelské buňky se může přežívat radu generací - v rámci buněčného dělení se rozšiřuje do dalších populací buněk 4. Indukce = pro **** se uvolní a buňka zalezugenní ho cyklu se uvolní do cyklu lytického

Jednotlivé etapy evoluce buněčných forem života

1. RNA-> protein a DNA 2. Od Zárodečné polévky k prvním buňkám 3. Od prokaryot k eukaryotám

Průběh Autofagie - Živočišné buňky

1. indukce 2. vytvoření autofagosomu (nejasný původ = ER?) 3. dokování autofagosomu, fúze s lysosomem 4. rozpad autofagosomálního veziklu

Funkce ECM

1.Mechanická opora 2. Specifické funkce tkání (vazba signálních molekul) 3. Regulace embryogeneze

Kolik bází tvoří 1 otáčku šroubovice

10 bází

Eukaryotní buňky velikost

10-100 mikrometrů

Kolik nukleotidů U prokaryot a u eukaryot tvoří Okazakiho fragment

1000 až 2000 nukleotidů u prokaryot 100 až 200 nukleotidů u eukaryot

To si jako první zmínil o endosymbiotické teorie a kdy

1883 - ANDREAS W. SCHIMPER

Kdy a kde se odehrál + k dohodě prováděl první experiment - ověření možnosti vzniku života na planetě zemi

1953 - UNIVERSITY OF CHICAGO - STANLEY MILLER A HAROLD UREY = Millerův experiment

Kdy byl poprvé použit termín Apoptóza

1972

Kdy byl objeven splicing

1977

Kdo následně shrnula kdy podstatu endosymbiotické teorie

1981 - LYNN MARGULIS - SYMBIOSIS IN CELL EVOLUTION - PODROBNÝ VÝZKUM (SHRNULA PODSTATU ENDOSYMBIOTICKÉ TEORIE)

Popiš strukturu mitochondrií

2 SAMOSTATNÉ BIOMEMBRÁNY - 2 KOMPARTMENTY − VNĚJŠÍ PROSTOR - INTERMEMBRÁNOVÝ PROSTOR − VNITŘNÍ PROSTOR - MATRIX - ENZYMY METABOLICKÝCH DRAH − VNĚJŠÍ MEMBRÁNA - NESPECIFICKÉ KANÁLY (PROTEINY PORINY) − VNITŘNÍ MEMBRÁNA - KRISTY (LOKALIZACE ENZYMŮ RESPIRAČNÍHO ŘETĚZCE

Popiš strukturu chloroplastů

2 SAMOSTATNÉ BIOMEMBRÁNY - 2 KOMPARTMENTY − VNĚJŠÍ PROSTOR - INTERMEMBRÁNOVÝ PROSTOR − VNITŘNÍ PROSTOR - STROMA - V NĚM OBSAŽENY DALŠÍ MEMBRÁNOVÉ STRUKTURY - THYLAKOIDY (V JEJICH MEMBRÁNĚ LOKALIZOVÁNY ENZYMY FOTOSYNTÉZY)

Struktura centrozomu

2 centrioly (vůči sobě v pravém úhlu) + PCM (pericentrionální materiál= komplex asociovaných proteinů)

Jak vypočítáme kolik možných kombinací chromozomů je v Gameta ach + co toto číslo zvyšuje - určitě u lidí

2 na n - u lidí 2 na 23 => toto číslozvýšeno crossing-overem

Kdo a kdy dostal Nobelovu cenu za výzkum genetické regulace vývoje orgánů a programované Buněčné smrti

2002 - Nobelova cena za fyziologii a lékařství: Sydney Brenner H. Robert Horvitz John E. Sulston

Kdo a kdy dostal Nobelovu cenu za vískou mechanismů Autofagie

2016 - NOBELOVA CENA ZA FYZIOLOGII A LÉKAŘSTVÍ - YOSHINORI OHSUMI

Kolik typů a jaké typy RNA-polymeráz máme u eukaryot a co dělají

3 typy - RNA-POLYMERÁZA I - PŘEPISUJE GENY KÓDUJÍCÍ RRNA − RNA-POLYMERÁZA II - PŘEPISUJE GENY KÓDUJÍCÍ PROTEINY − RNA-POLYMERÁZA III - PŘEPISUJE GENY KÓDUJÍCÍ TRNA

Kolik vazebných doména mají molekulové motory

3 vazebné domény -> dvě se vážou na Mikrotubuly -> jedna se váže na přenášené molekuly/látky (transportované molekula,membránový váček),...

Co jsou mikrofosílie A ve které etapě vývoje buněčných forem hrají roli

3. etapě od prokaryot k eukaryotům zkamenělé zbytky různých forem buněčného života

Kolik nm vlákno vytváří nukleozomy těsně u sebe

30 nm - toto vlákno může být sbaleno i do dalších struktur

Co tvoří ECM v pojivech

3D síť- důležitá spojivek - mechanická námaha

Kolika chromatidami je tvořen bivalent

4

Co vzniká spermatogenezi

4 rovnocenné spermie - všechny jsou schopné fungovat jako Gamety

Kolik různých tRNA potřebujeme Pro úspěšnou translaci

40-60 různých tRNA

Na kolik fázi je rozdělená mitóza a jaké

5 Stádií Profáze Prometafáze Metafáze Anafáze Telofáze

V jakém směru syntetizuje primáza polypeptid při replikaci DNA

5' -> 3'

Tloušťka biomembrány

5-7,5 nm - Rozměr narůstá díky obsahu proteinů

Tloušťka Bazální laminy

50 až 200 nm - velmi tenká

Kolik existuje možných tripletu

64 61 určuje 20 aminokyselin + 3 terminaci Translace

Průměr akty nového vlákna + struktura

7 nm Každé vlákno představuje stočený řetězec, sestávající že stejných globulárníh molekul aktinu - všechny molekuly v řetězci směřují stejným směrem podél osy vlákna, proto mají aktinová vlákna strukturní polaritu (+ a - konce)

Popiš Aktinová filamenta + průměr

7 nm Podélné svazky vláken probíhající buňkou po její délce z jednoho konce na druhý

Kolik procent nově vytvořených proteinů potřebuje asistencí chápe rodinu a kolik procent pomoc s Hsp70

85% nově vytvořených proteinů se skládá spontánně nebo s pomocí Hsp70 a pouze 15% zbytek potřebuje asistenci chaperoninů

Čtyři hlavní biogenní prvky + kolik % organismu tvoří + i těch dalších

96 % HMOTNOSTI ORGANISMU: KYSLÍK, UHLÍK, VODÍK, DUSÍK MEZI MAKROBIOGENNÍ SE ŘADÍ I VÁPNÍK (1,5 %) A FOSFOR (1,2 %)

Vysvětli Phalloidin

= alkaloid (= toxin z Amanta Phalloides = muchomůrka zelená) konjugovaný s fluorochromem - přijme značení - F-aktinu Mechanizmus = vazba na f-aktin (na nic jiného se neváže), stabilizace s filament v Polymerizované podobě + zastaví se veškeré strukturní změny => princip otravy - zablokování veškerých buněčných funkcí

Popiš válcovité chaperoniny Hsp60 - funkce

= válcovité částice zapojené do skládání nadprodukovaných proteinů a umožňují skládání nově vznikajícím a denaturovaným proteinům tím, že jim poskytují prostor oddělený od cytoplazmy -umí také rozbalit špatně sbalené proteiny.

Popiš SEM

= Černobílý reálný prostorový obraz PROUD ELEKTRONŮ KONDENZOVÁN POMOCÍ NĚKOLIKA SOUSTAV KONDENZORŮ, ZAKONDENZOVÁN NA VELMI ÚZKÝ PAPRSEK (PROCHÁZÍ PO POVRCHU POZOROVANÉHO OBJEKTU) -> JEDNOTLIVÉ VRSTVY SNÍMÁNY DETEKTOREM -> SOFTWAROVÉ SKLÁDÁNÍ DO „PLASTICKÉHO" 3D MODELU − NUTNOST POKOVENÍ VZORKU (VĚTŠINOU AU NEBO PT) NA VELMI TENKÉ VRSTVY

V čem se liší Cytokineze u rostlin od živočichů

A mechanizmus Cytokineze u vyšších rostlin je zcela odlišný Uvnitř buňky vzniká nová stěna Rostoucí nová buněčná stěna je obklopena membránou a s tím jak roste rozdíly cytoplazmu buňky na dvě části Rovina buněčného dělení tady spolu s růstem buňky určuje konečný tvar rostliny

Jakého párů bází je více v takzvaných ori počátcích

A=T

Jaká je reakce buněk na poškození indukované UV zářením

AKTIVACE REPARAČNÍCH MECHANISMŮ S TŘEMI MOŽNÝMI NÁSLEDNÝMI SITUACEMI - KOMPLETNÍ OPRAVENÍ POŠKOZENÍ - BUŇKA JE SCHOPNA REDUKOVAT NÁSLEDKY POŠKOZENÍ - DÁL SE BUDE DĚLIT A NORMÁLNĚ FUNGOVAT − OPRAVA POŠKOZENÍ, NIKOLI VŠAK V PLNÉM ROZSAHU - PO DALŠÍ DÁVCE UV ZÁŘENÍ BUŇKA PŘEŽÍVÁ, ALE POŠKOZENÍ SE PŘEDÁVÁ DO DALŠÍCH GENERACÍ − NESCHOPNOST REPARAČNÍCH MECHANISMŮ ZVRÁTIT MÍRU POŠKOZENÍ (PŘI VELKÉ DÁVCE UV ZÁŘENÍ) - AKTIVACE BUNĚČNÉ SMRTI (ABY NEDOŠLO K POŠKOZENÍ CELÉHO ORGANISMU)

Jakej jsou asociované protein i připojující Membránový skelet + Určité funkce

ANKYRIN - PŘIPOJENÍ K TRANSMEMBRÁNOVÝM PROTEINŮM − PROTEIN 4.1. - PŘIPOJENÍ NA OLIGOMERY AKTINU

Charakterizuj atomové číslo a atomovou hmotnost

ATOMOVÉ ČÍSLO PRVKU JE DEFINOVÁNO POČTEM PROTONŮ V JÁDŘE A SHODUJE SE S POČTEM ELEKTRONŮ - JE STEJNÉ U VŠECH ATOMŮ DANÉHO PRVKU, ROZHODUJE O JEHO CHEMICKÝCH VLASTNOSTECH ATOMOVÁ HMOTNOST = HMOTNOST DANÉHO ATOMU VZHLEDEM K HMOTNOSTI ATOMU VODÍKU − URČENA POČTEM PROTONŮ A NEUTRONŮ, KTERÉ ATOM OBSAHUJE − HLAVNÍ IZOTOP UHLÍKU MÁ ATOMOVOU HMOTNOST 12 (12C) − HMOTNOST ATOMU NEBO MOLEKULY SE OBVYKLE VYJADŘUJE V DALTONECH

Co je to tRNA

Adaptéry mezi kodony v mRNA a AMK

Co určuje import proteinů do organel + Jak se tento jev nazývá + O jaký typ transportu třídění proteinů se jedná

Adresová sekvence (15-60 AMK)- Malá sekvence, Která je součástí proteinu Posttranslační translokace proteinů z cytosolu do organel Existují adresové sekvence pro jádro, mitochondrie, Chloroplasty, Peroxizomy, ER Jedná se o kotranslační transportu

Co blokuje proto syntézu odpojováním ribozomů od ER

Aflatoxiny

Co umožňuje vykonávat aktinovým vláknům různorodé buněčné funkce

Aktin - vázající proteiny

Jaká struktura cytoskeletu kompenzuje lokální mechanické vlivy - tah, tlak - mikromanipulace, mikroaspirace

Aktinová filamenta

Dochází k obnovení konformace po průchodu proteinu mámbránou cílové organely

Ano

Je cAMP rozpustný

Ano

Může probíhat aktivní transport is místo nižší koncentrace do vyšší koncentrace

Ano

Když vznikají kinetochory na centromerech - směřují stejným směrem?

Ano - Mikrotubuly vřeténka proto připojí každý ze zreplikovaných chromozomů k jinému pólu vřeténka

Má buňka během profáze jaderný obal ?

Ano - během profáze je stále neporušený

Jsou si z hlediska evoluce eukaryotické buňky rostlin, živočichů a hub příbuzné

Ano docela hodně na evolučním stromu jsou si sobě velmi blízké

Fungují dvě rozdělené Podjednotky G proteinu samostatně

Ano obě mohou samostatně difundovat membránou, interagovat s cílovými molekulami a předávat jim signál

Je možné že si můžu vymyslet vlastní protein a Ribozom nebude řešit odkaď přišel ale prostě ho nasyntetizuje

Anooo :)

Jaké molekuly hrají roli při tvorbě apoptosomu

Apaf-1 Cytochrom C (Apaf-2) prokaspáza 9 (dATP)

Charakterizuj kam směřují jednotlivé části Epiteliálního listu= tkáň

Apikální- směřuje dovnitř dutiny orgánu Bazální povrch - směřuje k dalšímu druhů tkáně

Rozdělení prokaryotní organismy

Archeabakterie - evolučně nejstarší Eubakterie - větsina běžných bakterií Sinice

Jaká rychlost pohybu chromozomů k mitotickému vřeténko během Anafáze

Asi 1 mm/1min

Kolik proteinů je ve skupině FtsZ

Asi 12

Kolik hydrolytických enzymů obsahují asi lysozomy a co pomocí těchto enzymů odbourávají

Asi 40 typu hydrolytických enzymů odbourávají proteiny, Nukleové kyseliny, Oligosacharidy a fosfolipidy

Jak se nazývá proces kdy Lyzozom tráví složky vlastní buňky

Autofagie

Co vzniká při makroautofagii

Autofagosom

Co vzniká oogenezí

BĚHEM I. MEIOTICKÉM DĚLENÍ VZNIKÁ SEKUNDÁRNÍ OOCYT (BUŇKA S REDUKOVANÝM POČTEM CHROMOZOMŮ) A PRVNÍ POLÁRNÍ TĚLÍSKO (NEJEDNÁ SE O PLNOHODNOTNOU BUŇKU - NENÍ SCHOPNÁ FUNGOVAT JAKO GAMETA) − SEKUNDÁRNÍ OOCYT VSTUPUJE DO II. MEIOTICKÉHO DĚLENÍ - VZNIK OOIDU A DRUHÉHO POLÁRNÍHO TĚLÍSKA − PRODUKTEM MEIÓZY JE 1 OOCYT A 3 POLÁRNÍ TĚLÍSKA

Popiš indukci a průběh apoptózy

BUŇKA SE ZAČÍNÁ SVRAŠŤOVAT → NA JEJÍM POVRCHU SE VYTVÁŘÍ VYCHLÍPENINY → ROZPAD BUNĚČNÉHO JÁDRA → ROZPAD BUŇKY NA APOPTOTICKÁ TĚLÍSKA (MALÉ VÁČKY)

Popiš specializaci buněk ve vláknitých koloniích

BUŇKY FIXUJÍCÍ DUSÍK, BUŇKY FIXUJÍCÍ CO2, SPORY)

A charakterizuj plazmatickou membránu Eubakterií

Bariera mezi buňkou a okolím, na povrchu ještě buněčná stěna - obsahuje peptidoglykan a slizovitý obal - umožnění snažšího přežívání ve vhodném prostředí

Jaká archeabakterie se hojně vyskytuje v sirném prostředí a jaký způsob zpracování energie využívá

Beggiatoa - OXIDACE H2S JAKO ZDROJ ENERGIE, FIXACE UHLÍKU I ZA TMY

Příklad proteinu regulující délku aktinových filament blokováním jednoho konce vlákna - proteiny asociované s aktinem

Beta-aktin, Cap Z Protein, capping protein

Popiš Prokaryotická buňku co se týče Kompartmentalizace

Bez specializovaných vnitřních oddílů - jediný oddílu obklopený membránou je cytosol

Jak jinak nazýváme Anabolické dráhy

Biosyntetické

Na co se vážou extracelulární signální molekuly

Buď k receptorům na povrchu buňky nebo k intracelulárním receptorům

Popiš buněčnou respiraci

Buňka potřebující energii využije své cukry nebo jiné organické molekuly tak, že umožní reakci jejich atomů uhlíku a vodíku s kyslíkem - dojde k jejich oxidaci za vzniku CO2 a H2O Tímto procesem se molekuly potravy rozpadají za současného uvolnění energie= ATP

Co mají buňky které jsou odolné více vůči mechanickému stresu - mikromanipulaci

Buňky s buněčnou stěnu no

Kdo byl Alexander Ivanovič Oparin - popiš co zkoumal a kdy

Byl to ruský biochemik V roce 1922 přišel s teorií vzniku života na planetě Zemi z redukční atmosféry na vzniklé planetě. Tato atmosféra obsahovala jednoduché anorganické molekuly jako metan, čpavek, vodík nebo vodní páry. Tyto látky se podle něj pomocí tzv. chemické evoluce mohly přeměnit na látky organické v podobě uhlíkatých sloučenin. Vznikaly tak složitější a složitější organické molekuly. Jako první také použil termín „zárodečná polévka"(primordial soup) - vodný roztok anorganických a posléze organických sloučenin, ze kterých se mohly vyvinout první formy života EXPERIMENTY S KOACERVÁTY

Kdy může dojít k nerovnoměrnému crossing overu aco je důsledkem

Během profáze I důsledkem je ztráta (delece) v jedné a zdvojení (duplikace) ve druhé zúčastněné chromatidě

Co se děje s proteiny během transportům - změny konformace do mitochondrií a chloroplastů

Během transportu se proteiny rozvíjejí - změna konformace

Z kolika částí a z jakých se skládají Nitrobuněčné intracelulární receptory+ pro co jednotlivé části slouží

C-konec - doména pro vazbu hormonu N-konec - doména pro řízení transkripce střed molekuly - doména pro vazbu DNA

Charakterizuj organizaci spojovací struktury mezi homologními chromozomy v zygotene I

CENTRÁLNÍ ELEMENT (PŘEKRYTÍ TRANSVERZÁLNÍCH PROTEINŮ TRANSVERZÁLNÍCH VLÁKEN), TRANSVERZÁLNÍ VLÁKNA (PROPOJUJÍ CENTRÁLNÍ A LATERÁLNÍ ELEMENTY), LATERÁLNÍ ELEMENTY (NAPOJUJÍ SE NA NĚ SMYČKY HOMOLOGNÍCH CHROMOZOMŮ)

Co jsou to Fotodynamická barviva

CHEMIKÁLIE, KTERÉ JSOU ABSORBOVÁNY BUŇKAMI −sloučeniny zvyšující citlivost buněk na světlo

Popiš funkční polarizaci GA

CIS-STRANA - SOUSEDÍCÍ S ER - TRANSPORT MOLEKUL Z ER − TRANS-STRANA - PROTILEHLÁ - TŘÍDĚNÍ MODIFIKOVANÉHO MATERIÁLU (jestli to půjde do cytoplazmy nebo k mémbráně)

Jak se označí inhibitory komplexů Cdk/cyklin + Jak fungují

CKI (Cdk Inhibitors) - Blokují jejich sestavení nebo jejich aktivitu Vyvolávají změnu struktury aktivního místa Cdk Některé se vážou na různé komplexy cyklin-Cdk A některé pouze na specifické - Selektivní blokace

Co je energeticky nejstabilnější formou uhlíku a vodíku

CO2 H2O

Jaký máme 4 hlavní typy malých molekul v buňkách + jakou maji Mr + max. počet uhlíku

CUKRY, NUKLEOTIDY, AMINOKYSELINY, MASTNÉ KYSELINY Mr 100-1000 Do 30 atomů C

Rozdíl mezi cytoplazmou a cytosolem

CYTOPLAZMA - TEKUTINA SLOŽENÁ Z CYTOSOLU A ORGANEL (VŠE MEZI PLAZMATICKOU MEMBRÁNOU A JÁDREM) − CYTOSOL - OMEZEN PLAZMATICKOU MEMBRÁNOU A VNĚJŠÍM POVRCHEM ORGANEL

Co je to protein p21

Cdk inhibiční protein - aktivovaný p53 stimuluje transkripce genu, který kóduje Cdk inhibiční protein p21

Složení buněčné stěny

Celulóza, další Polysacharidy (pektin, hemicelulóza), strukturní proteiny lignin- U některých typu buněk místo celulózy

Funkční struktura MTOC

Centrozom

Co napomáhá obnovení konformace transportované molekuly uvnitř organely

Chaperony - brání předčasnému skládání a umožní vznik správné konformace až je na světě celý protein

Jakým způsobem se převádí chemický signál na elektrický

Chemický signál - nepoví mediátory se převádí na elektrický signál v podobě změny permeability plazmatické membrány cílové buňky

Co je to ručně mladší mitochondrie nebo Chloroplasty

Chloroplasty

Co se děje v metafázi mitózy

Chromozomy jsou srovnány v ekvatoriální roviny Vřeténka = uprostřed mezi jeho póly Chromozomy seskupené v ekvatoriální roviny mi ta fázového Vřeténka se pohybují sem a tam a neustále tak upravují svoji polohu

Co se děje v telofázi meiózy II

Chromozomy se dekondenzují a začínají se formovat nová jádra.

Co se děje v profázi meiózy II

Chromozomy, z nichž každý je tvořen dvěma sesterskými chromatidami, se kondenzují a připojují se na vlákna dělícího vřeténka.

Jaké máme junction adhesion molecules- molekuly těsného spoje

Claudin, occludin, JAMs

Příklady proteinů depolymerující aktinová vlákna+ co dělají

Cofilin, ADF, depactin - podíl na regulování dynamiky aktinových filament

Jaký protein je homologem proteinu Intermediární filamenta a na čem se podílíý

CreS podílí se na tvorbě denzní sítě v cytoplazmě

Co se nachází vně pravotočivé dvoušroubovice DNA

Cukr-fosfátová kostra

Jak se mění koncentrace cyklinů v průběhu BC

Cyklicky

Jaká skupina proteinu je zodpovědná za správné načasování působení proteokináz

Cykliny

4 hlavní druhy cyklinů

Cykliny G1 Cykliny G1/S Cykliny S Cykliny M

Jaké systémy- proteiny Řídí regulaci buněčného cyklu

Cykliny a cyklin- dependentní kinázy (CDK) -> MPF - mitosis- promoting factor Protein p53,..

Popiš princip mikroautofagie

ČÁSTICE, KTERÁ MÁ BÝT DEGRADOVÁNA JE ROVNOU TRANSFEROVÁNA DO LYSOSOMU PŘÍMOU INVAGINACÍ

Struktura elastického vlákna

ČLENITÁ STRUKTURA - ČLENITÝ POVRCH ELASTICKÉHO VLÁKNA • JÁDRO TVOŘENO ZESÍŤOVANÝMI MOLEKULAMI ELASTINU - PŘECHOD Z RELAXOVANÉ FORMY DO NATAŽENÉ A ZPĚT - ZMĚNY KONFORMACE • OBAL TVOŘEN MIKROFIBRILAMI FIBRILINU

Jaký enzym zajistí Kovalentní spojení 3' konce jednoho fragmentu DNA s 5'koncem sousedního

DNA - ligáza

Komplex čeho se nazývá Chromatin

DNA a proteinů

Jakých virus se týká lyzogenní cyklus buňky

DNA virů

Jaký enzym zajišťuje tvorbu RNA-primerů

DNA-primáza (=DNA-dependentní RNA-polymeráza)

Popiš množství vody v těle v průběhu života

DO 5LET -80% DO 20LET 70% DO 35LET -60% DO 50 LET - 55 % DO 80 LET - 50 %

Charakterizuj ECM

DO URČITÉ MÍRY NAHRAZUJE ABSENCI BS Součástí celé tkáně - nepatří jednotlivé buňce ODLIŠNÉ USPOŘÁDÁNÍ A VLASTNOSTI V ZÁVISLOSTI NA TYPU TKÁNĚ

Popiš binární dělení =dělení prokaryot

DUPLIKACE CHROMOZOMU (MECHANISMEM REPLIKACE SE VYTVOŘÍ KOPIE KRUHOVÉHO BAKTERIÁLNÍHO CHROMOZOMU, KTERÁ JE ROVNĚŽ PŘICHYCENA K CYTOPLAZMATICKÉ MEMBRÁNĚ, BLÍZKO U TEMPLÁTU) → RŮSTU BUNĚK (DOCHÁZÍ K ODDALOVÁNÍ CHROMOZOMŮ DO DVOU PROTILEHLÝCH PÓLŮ BUŇKY)→ ROZDĚLENÍ DCEŘINÝCH BUNĚK

Co to znamená když je geneticky kód degenerovaný

DVA ČI VÍCE KODONŮ MŮŽOU KÓDOVAT TUTÉŽ AMINOKYSELINU

Co se musí syntetizovat po skončení syntézy každého Okazakiho fragmentu

Další primer

Jak vypadají chromozomy na konci Anafáze

Dceřiné chromozomy jsou rozděleny na dvě stejné skupiny, které se nachází na opačných pólech Vřeténka

Popiš Intermediální filamenta + průměr

Denzní síť propletená uvnitř celé buňky 10 nm

Jakou reakci jsou Kinetochorové Mikrotubuly v anafázi A zkracovány

Depolymerizací

Jakým způsobem prochází přes plazmatickou membránu některé malé hydrofobní signální molekuly+ na co se vážou

Difundují přes plazmatickou membránu a vážou se na receptory uvnitř cílové buňky, buďv cytosolu nebo v jádru

Co vytváří fibrilární molekula ve stavbě Intermediálních filament

Dimery (-hetero i -homo) - Spojují se do tetramerů Tetramery se řetězí do proto filamenta Vlákno Intermediární ho filamenta je tvořeno 8 proto filamenty (jako klasické lano)

Do čeho se párují homology během pachytene

Do bivalentů

3 hlavní mechanizmy importu proteinů do organel

Do vnitřního prostoru jádra - transport přes jederné póry Do mitochondrií, chloroplastů, peroxisomů- Přes proteinové translokátory Do ER, GA, endosomů, lysozomů, membrán, vnějšího prostoru - vezikulární transport

Co se děje v profázi

Dochází ke spiralizaci vláken DNA a diferenciaci chromozomů, u kterých jsou patrné dvě chromatidy Na začátku profáze se oba centrozomy, od sebe oddělují a pohybují směrem k opačným pólům buňky. Každý centrozom slouží jako organizátor vlastního svazku mikrotubulů. Oba svazky pak spolu interagují a vzniká mitotické vřeténko.

Co jsi kontroluje v kontrolním bodě G2 během BC

Dostatečná velikost buňky Zreplikovaná DNA a zdvojený centrozom

Co se děje když je Apoptóza v normálu a Proliferace je snížená

Dystrofie

Funkce Kinetochorů a v jaké fázi mitózy hrají svou roli

Díky Kinetochorům se Mikrotubuly Vřeténka vážou na chromozomy Prometafáze

Díky čemu jsou přenášeny látky při aktivním transportu

Díky jo to vím kanálům a transportním proteinů

Jaký typ experimentu byl důležitý v druhé etapě evoluce buněčných forem života

Důležité experimenty s kacerováty

Příklady bakterií které se řadí mezi G-

E. coli Bacillus subtilis

Jaké jsou dva stavební proteiny elastických vláken

ELASTIN + FIBRILIN

Jaká Organela je u většiny eukaryotických buněk největší + cca kolik procent celkového objemu zastává

ER - Až 10% celkového objemu

Co se děje s ER během homogenizace a frakcionizace

ER se rozpadne a vytvoří tzv. mikrosomy (hladké a drsné (-s ribozomy)

Popiš sekreční dráhu Vezikulárního transportu

ER → GA → MEMBRÁNA nebo ER-> endosomy-> lysozom

Co je to Millerův experiment a co ověřil

EXPERIMENTÁLNĚ OVĚŘIL A PROKÁZAL OPARIN-HALDANOVU TEORII VZNIKU ŽIVOTA (MOHLO BY TO TAK BÝT) PRVNÍ EXPERIMENTÁLNÍ OVĚŘENÍ MOŽNOSTI VZNIKU ŽIVOTA NA PLANETĚ ZEMI − STANLEY MILLER DĚLAL DOKTORÁT POD HAROLDEM UREYEM, SE KTERÝM EXPERIMENT PROVÁDĚL

Jaký typ energie je energie slunečního záření

Elektromagnetická energie

Od koho odvodili Watson a Crick strukturu DNA a co tito lidé poskytli

Erwin Chargaff - chemická data KONCENTRACE TYMINU JE V DNA DANÉHO ORGANISMU VŽDY STEJNÁ JAKO KONCENTRACE ADENINU − KONCENTRACE CYTOSINU JE VŽDY STEJNÁ JAKO KONCENTRACE GUANINU Maurice Wilkins a Rosalind Franklinová -fyzikální data ROZPTYL PAPRSKŮ RENTGENOVÉHO ZÁŘENÍ NA MOLEKULÁCH DNA

Jak se nazývá stupeň kondenzace DNA jiný než heterochromatin

Euchromatin

sedimentační koeficient od jednotek ribozomu U prokaryot a u eukaryot

Eukaryotický ribozom má 80 S (samostatně má 60 S velká pod jednotka + 40 S malá Podjednotka) Prokaryotický Ribozom má 70 S (50 S velká, 30 S malá)

Charakterizuj stáří jednotlivých komponentů cytoskeletu

Evoluční staré - najdeme ve všech eukaryotických buňkách Aktinová filamenta + Mikrotubuly - ve všech typech buněk mají stejnou stavbu Intermediární filamenta - pouze uživočichů, evolučně nejnovější

Která fáze apoptózy je pozorovatelna v mikroskopu

Exekutivní

Kolik existuje aminoacyl-tRNA- syntetáz

Existuje alespoň jedna pro každou z 20 aminokyselin

Jaké změny ve složení plazmatické membrány probíhají během exekutivní fáze apoptózy

Externilizace fosfatidylserinu: Externilizace: přesun molekuly nebo komplexu molekul na vnější povrch buňky E. fosfatidylserinu, který je typickým fosfolipidem vnitřního listu buněčné membrány, je charakteristickou známkou časného stadia apoptózy

Z jakého důvodu při pohlcení apoptických tělísek Nevzniká zánět

FAGOCYTUJÍCÍ BUŇKY VYLUČUJÍ CYTOKINY, KTERÉ ZABRAŇUJÍ ZÁNĚTU VE TKÁNI

Co říkal vitalismus a kdo ho popřel

FRIEDRICH WÖHLER - V ROCE 1828 POPŘEL VITALISMUS (NENÍ ZDE ŽÁDNÁ SPECIFICKÁ VIS VITALIS = ŽIVOTNÍ SÍLA) POKUSEM, KDY POVAŘIL ANORGANICKOU SŮL KYANÁT AMONNÝ A VYTVOŘIL MOČOVINU (ORGANICKÁ LÁTKA) - ZROD BIOCHEMIE

Popiš vakuoly + funkce

FUNKČNÍ ANALOGIE LYSOSOMŮ U ROSTLIN A U HUB KATABOLISMUS, ZÁSOBY, REGULACE TURGORU

Čím je řízen Vznik nové buněčné stěny během Cytokineze u rostlin + Z čeho je tahle struktura formována

Fragmoplastem- Formován ze zbytku polárních mikrotubulů v ekvatoriální roviny je starého mitotického Vřeténka Mali mi Vránou obalené váčky, naplněné Polysacharidy a Glykoproteiny, jsou transportovány podél mikrotubulů k fragmoplastu Zde se slévají do struktury podobné disku obklopené mu membránou, která s tím, jak s ní fúzují další a další váčky, Postupně roste směrem k povrchu buňky

Co často ovlivňují signální ligandy + příklady

Fyziologii a pocity organismu - heroin, nikotin, tišící prostředky, léky

Charakterizuj dva druhy klidovoé fáze buněčného cyklu a v důsledku čeho dojde k zastavení buněčného cyklu

G0 fáze - například důsledku absence růstových faktorů - po jejich dodání se cyklus obnoví Vstup do postmitotické fáze - Týká se vysoce diferencovaných buněk, které se až do své smrti nedělí

Kdo to byl John B. Haldan

Genetik a fyziolog STEJNÁ TEORIE EVOLUCE ORGANICKÝCH SLOUČENIN - BEZ KOACERVACE (SLUČOVÁNÍ SLOUČENIN DO UZAVŘENÝCH SYSTÉMŮ)

Genom jakého organismu byl poprvé sekvenován, kdy a kým

Genom bakteriálního viru 1977 Britským biochemikem Frederickem Sangerem

Jaký typ proteinu jsou receptory steroidních a tyroidních hormonů

Genové regulační proteiny, které jsou přítomny v nasty malované bance v neaktivním stavu Když se k receptorů naváže jeho hormon, receptorový protein změní svou konformaci, a tomu umožní navázat se ke své odpovídající regulační sekvencí v DNA, Což může následně vést k zahájení nebo inhibici transkripce vybraného souboru genů Jelikož pro každý typ hormonu existují různé typy receptorových proteinu - každý receptor působí na jiný soubor regulačních míst a tak řídí různé soubor genů

Co je polysacharidovou zásobou u živočichů a u rostlin

Glykogen - Živočichové Škrob - Rostliny

Co mají živočišné buňky místo buněčné stěny

Glykokalyx

Co je analogii buněčné stěny uživočichů + jak se jinak nazývá

Glykokalyx - buněčný plášť Pouze u některých buněk

Co vynahrazuje absenci buněčné stěny u živočišných buněk

Glykokalyx - př. propůjčují buňce slizovitý povrch, který pomáhá pohyblivým buňkám (např. bílým krvinkám) proklouzávat úzkými mezerami Buňka co má Glykokalyx má specifické složení - mají je některé bakterie a některé eukaryotické buňky

Čím jsou chráněny složky lysozomální membrány před vlastními enzymy

Glykosylací

Pomocí čeho se vypíná G protein - vazba GDP + co to je GDP

Guanosindifosfát vypnuto pomocí proteinů GAP GTPase-activating protein)

Jak se zapne vazba GTP + co je to GTP

Guanosintrifosfát Zapnuto - přímou interakcí s receptorem nebo proteiny GEF (Guanine nucleotide exchange factor)

Na co dělíme archeabakterie podle výskytu

HALOFILNÍ (ROZDÍLNÉ PH) TERMOFILNÍ (VYSOKÉ TEPLOTY)

Co je to proliferace

Hojné množení

Co se děje v anafázi meiózy I

Homologické chromozomy se oddělují a pohybují se k opačným pólům buňky

co se děje s homology během meiózy před uspořádáním do metafázní destičky

Homology paternální a maternální S před uspořádáním párují

Příklad rozdělení signálu aby současně ovlivnil několik dějů

Hormon Acetylcholin - v těle zajišťuje několik změn Stimuluje kontrakci buněk kosterního svalstvo, tlumí účinek buněk srdečního svalstva a stimuluje žláznaté buňky k sekrecí

Co vytvářejí Intermediární filamenta + strukturní vlastnost

Hustou cytoplazmatickou síť - Která obklopuje jádro, dosahují filamenta ale až k periferii, kde jsou pak často za kotvené do plazmatické membrány v místech mezi buněčných spojů Nacházejí se také v buněčném jádře, pod jadernou Medrano uleží seats zvaná jaderná lamina - podpírá a zesiluje jadernou mým ráno všech eukaryotních buněk Jsou rigidní - neměnná

Jaké jsou výplňové komponenty

Hyaluronany Proteoglykany Tvorba viskózního hydratovaného gelu

Co je základním stavebním kamenem výplňové komponenty

Hyaluronany - Z boku napojení proteoglykanů pomocí asociovaných proteinů

Je většina signálních molekul hydrofilních nebo hydrofobních + co to značí

Hydrofilní • neprocházejí plazmatickou membránou • vážou se na povrchové receptory • z krve se odstraňují během několika minut • zprostředkovávají krátkodobé odpovědi

Je většina signálních molekul hydrofilních nebo hydrofobních + co to značí + Ostatní funkce

Hydrofilní • neprocházejí plazmatickou membránou • vážou se na povrchové receptory • z krve se odstraňují během několika minut • zprostředkovávají krátkodobé odpovědi

Které molekuly nemohou projít membránou + co dělají

Hydrofilní molekuly - aktivují povrchové receptory

Jaké molekuly tvoří málo vodíkových můstku

Hydrofobní molekuly - nenesou žádný náboj - mastné kyseliny, alkany,..

Jak se nazývá reakce kde se Polymery rozpadají na Monomery

Hydrolýza - probíhá za spotřeby molekuly vody - Energeticky výhodná

Co je to Hypertrofie a hyperplazie

Hypertrofie - zvětšení tkáně nebo orgánu při zvětšení jednotlivých buněk v orgánech, jejíž buňky se nedělí - jejich počet se nemění Vzniká při dlouhodobé zátěži, např. ve svalech - Hypertrofie srdečního svalu Hyperplazie zvětšení dané zvýšení počtu buněk- Hyperplazie prostaty

Do jakých tříd rozdělujeme Intermediární filamenta

I.Keratiny II. Keratiny III. Vimentin, desmin, GFAP, synemin, peripherin IV. Neurofilamenta, α-internexin V. Jaderné laminy VI. Nestin

Jaké napojení zajišťují hemidesmozomy

IC napojení na intermediální filamenta prostřednictvím integrinů

Jaké máme typy biologických stresových faktorů

Intracelulární parazitismus

Nekovalentní vazby biologických makromolekulách

Iontové vazby H- můstky Van der Waalsovy síly Hydrofóbní interakce

Charakterizuj M-fázi

JADERNÉ DĚLENÍ (MITÓZA) + DĚLENÍ CYTOPLAZMY (CYTOKINEZE) DOBŘE POZOROVATELNÁ MIKROSKOPIÍ

Jakým způsobem působí receptory pro G-proteiny

Jako Nitrobuněčná doména pro vazbu proteinu G

Vysvětli co jsou to mezerové spoje

Je to oblast, kde membrány dvou buněk leží rovnoběžně těsně vedle sebe a mezi nimi je úzká štěrbina ošířce 2-4nm Vytváří se tak úzké průchody umožňující anorganickým iontům a malým, ve vodě rozpustným molekulám, procházet přímo z cytoplazmy jedné buňky do cytoplazmy druhé buňky

Popiš amplifikaci signálu

Jedna signální molekula aktivuje jediný receptor Jediný aktivovaný receptor však aktivuje větší počet molekul enzymu tvořícího sekundární přenašeč Každá molekula tohoto enzymu katalyzuje tvorbu mnoha molekul sekundárního přenašeče Každá molekula sekundárního přenašeče aktivuje mnoho cílových molekul. To umožňuje, že i při nízké koncentraci ligandu, může dojít k významné odpovědi uvnitř buňky

Popiš respirace versus fotosyntéza

Jedná se o navzájem komplementární procesy Kyslík - produkovaný rostlinami při fotosyntéza je konzumován téměř všemi organismy pro rozklad organických molekul Uhlík - pocházející z CO2 a začleňovaný do organických molekul při fotosyntéze může pocházet z atmosféry, kam byl uvolnění něm respiraci živočichů, hub nebo samotnou rostlinou

Popiš světelnou mikroskopii v tmavém poli

Jinak nazývaná fluorescenční mikroskopie Světlo produkováno z UV výbojky - Dochází k filtraci světla pomocí excitačních a emisních filtrů o určité vlnové délce odpovídající typu barviva Světelný paprsek projde přes excitační filtr který vyfiltruje světlo o určité vlnové délce - záření po dopadu na vzorek se odrazí a prochází přes emisní filtr - dochází k detekci a následnému promítnutí na kameru Vždyť vidíme 1,01 ¥ filtr - pro vidění komplexního obrazu dochází k vyfocení každého zvlášť a následnému softwarovému spojení/použít složené emisní filtry

Kdy začíná syntéza cyklinu B a závislost na aktivaci MPF

Již během interfáze (fáze S a G2) Koncentrace cyklinu B se zvyšuje rovnoměrně během G2 fáze, ale aktivace MPF nastává najednou

Popiš rozpustné proteiny které se přenášejí z cytosolu do ER

Jsou do Lumen ER přeneseny úplně - (určeny k sekrecí nebo pro Lumen ER nebo jinou organelu spojenou se sekreční drahou)- Nikdy se z nich už nestanou Membránové proteiny

Jakým způsobem mohou procházet hormony přes plazmatickou membránu

Jsou malé takže mohu snadno difundovat

Charakterizuj rozmístění transmembránových proteinů v biomembráně

Jsou nerovnoměrně rozmístěny - střední Epitel

Charakterizuj mastné kyseliny v buňce

Jsou složené z hydrofobních Uhlovodíkový řetězců - hydrofilní skupina karboxylové kyseliny Protože jsou hydrofobní hodí se K tvorbě membrán nebo se nachází v buňce ve formě kapének Obsahují vysoce koncentrovanou energii Buněčné membrány jsou tvořeny zejména fosfolipidy - obsahují glycerol a na něj váz. dva řetězce mastných kyselin - hydrofobní část a na druhé straně fosfátová skupina - hydrofilní část

Funkce importinů

Jsou to pomocné cytosolové proteiny- vážou se na NLS A navádějí protein k pórů a zajišťují jeho translokaci

Co se děje s mitochondriemi během Cytokineze

Jsou zdvojené během buněčného cyklu a během Cytokineze rovnoměrně rozdělené do obou dceřinných buněk

Co nejčastěji bývá primární efektor

Jádro

Jaká čas buňky se do cytoplazmy nepočítá

Jádro

Kam putují importiny potom co dovedou NLS jádra

Jádře se oddělí a putují zpátky do cytosolu

Kdy dochází k přesunu proteinů a do mitochondrií a chloroplastů a co je nutné pro tento přesun

K přesunu dochází ve speciálních místech vzájemného dotyku membrán - nutná změna konformace transportované molekuly

K Přenosu jakého typu signálu slouží receptory typu iontových kanálků- Povrchové receptory

K rychlému přenosu signálu přes Synapse v nervovém systému

Jaké oxidační enzymy obsahují peroxisomy, glyoxysomy

KATALÁZA, LUCIFERÁZA (U SVĚTÉLKUJÍCÍCH ORGANISMŮ)

U jakého typu tkání najdeme elastická vlákna

KDE DOCHÁZÍ KE ZMĚNÁM OBJEMU - KOŽNÍ POJIVO, STĚNY KAPILÁR, PLÍCE

Co je to apoptosom a jak vzniká

KOMPLEX UVOLNĚNÉHO PROTEINU APAF-1, CYTOCHROMU C (APAF-2), A PROKASPÁZY 9 - HEPTAMER (7 KOMPLEXŮ, NA KTERÉ SE NAPOJUJE PROKASPÁZA)

Charakterizuj napojení kolagenních vláken na ECM přes asociované proteiny

KOMPLEX VINCULINU A TALINU (TALIN SE VÁŽE NA INTRACELULÁRNÍ VAZEBNOU DOMÉNU INTEGRINU, NA NĚJ NASEDÁ VINCULIN VÁŽÍCÍ SE NA AF) NEBO Α-AKTININ (DIMER SE DVĚMA VAZEBNÝMI DOMÉNAMI - VAZBA NA INTRACELULÁRNÍ DOMÉNU INTEGRINU A ZÁROVEŇ MOŽNOST VAZBY DVOU AF)

Kde se kondenzuje Chromatin během kolapsu jádra exekutivní fázi apoptózy + k jakému štěpení DNA Dochází

KONDENZACE CHROMATINU NA PERIFERNÍCH OBLASTECH JÁDRA → INTERNUKLEOSOMÁLNÍ ŠTĚPENÍ DNA (MEZI JEDNOTLIVÝMI NUKELOSOMY - ŽEBŘÍČEK (LADDER) NA ELEKTROFORÉZE) → FRAGMENTACE JÁDRA

Jaký protein patří mezi hlavní proteiny citlivé na Ca2+

Kalmodulin

Co zajišťuje výkonný aparát mechanizmu apoptózy a jak se tyto látky aktivují

Kaspázy- proteázy, které se aktivují vlastní proteolýzou Aktivace nastává po přijetí specifických signálu Každá kaspáza má určité spektrum substrátů, které rozkládá

Jak jinak přezdíváme receptory váz. na enzym - povrchové receptory A proč

Katalytické receptory - vazbou ligandu získávají katalytickou schopnost

Další typy proteáz mimo kaspázy

Katepsiny Kalpainy Granzymy

Co umožňuje buňce přejít do apoptózy

Každá buňka má v sobě gen který toto umožňuje

Kolik kinetochorů má každý duplikovaný chromozom a kde a o jaké fázi mluvíme

Každý s duplikované chromozom má dva kinetochory - na každé sesterské chromatidě jeden

Co jsou to signální kaskády

Když receptorový protein zachytí nový signál uvnitř buňky Signál je obvykle předán od jednoho souboru intracelulárních signálních molekul k druhému a každý soubor vyvolá tvorbu dalšího, až ke konečné specifické odpovědi na příjem signálu buňkou

Co jsou to fosforylační kaskády

Když regulační kináza/ Fosfatáza je často podrobena kontrole fosforylací jinou kinázu

K jakému konci tRNA Je připojena AMK a jakou vazbou

Ke 3' konci tRNA - kovalentní vazbou (karboxylová skupina AMK + 3' hydroxylový konec tRNA) => MAKROERGICKÁ VAZBA

Popiš kinesiny a dyneiny

Kinesiny - pohybují se směrem k + konci mikrotubulu (od centrozomu k periferii buňky) Dyneiny - pohybují se směrem k mínus-konci (k centrozomu dovnitř buňky) Pracují na principu hydrolýzyATPázy- Tato reakce poskytuje energii pro Cyklický se opakující změny konformace molekuly hlavičky molekulového motoru - Pohyb podél mikrotubulů se uskuteční střídáním vazby, uvolnění a opětovné vazby k mikrotubulu

Popiš dva do druhy pozorování cytoskeletu ve světelné mikroskopii + Další metody vizualizace cytoskeletu ve světelné mikroskopii

Klasická fluorescenční mikroskopie Konfokální mikroskopie Imunofluorescence Green Fluorescent Protein (GFP) Phalloidin

Opak hydrolýzy

Kondenzace

Jak vznikají Polymery

Kondenzací monomerů Kondenzační reakce - tvorba vazby doprovázená ztrátou molekuly vody - energeticky nevýhodná

Dva způsoby přenosu signálu přes plazmatickou membránu

Konformační změna receptoru Dimerizace receptoru

Co nastane po vazbě ligandu na receptor

Konformační změna receptorů - interakce s proteinem G Aktivace proteinu G ->záměna GDP-> GTP

Základní drahá exocytózy

Konstitutivní sekrece -Neustálý proud váčků které pučí z GA A fúzují s plazmatickou membránou S květované proteiny přilnou k mém bráně s Mníšku nebo se stávají součástí extracelulární Matrix

Jaká přechodná struktura + čeho se skládá se tvoří při cytokinezi u živočichů

Kontraktilní prstenec - složen z překrývajících se aktinových a myozinových filament

Jakým procesem je spojen vstup proteinů do ER

Kontranlací - vznikající protein proniká membránou ER A nemůže se vrátit zpět do cytosolu - Ribozom syntetizující příslušný protein musí být v kontaktu s membránou ER

Jaké vazby najdeme mezi jednotkami monosacharidů

Kovalentní glykosidické vazby

Co spojují Kovalentní vazby a co vzniká + co spojují a co vzniká u nekovalentních vazeb

Kovalentní vazby - spojují menší molekuly - vznikají makromolekuly Nekovalentní vazby - spojují makromolekuly - vznikají makro molekulární komplexy

Co se váže a jakým typem vazby koncem mitózy k cyklinu B

Kovalentně se váže řada molekul ubiqitinu A přítomnost této látky označuje protein pro degradaci proteazomu

Charakterizuj dvě raménka chromozomu a jak se nazývají

Kratší - p Delši - q

jaká teorie popírá vývoj mechanismem přirozeného výběru

Kreacionismus

Jak je plazmatické útvary mají Prokaryotní buňky

Kromě plazmatické membrány nemají téměř žádné pouze občas mesozomy

Vysvětli kroky barvení podle grama

Krystalová violeť Lugolův roztok (KI) Rozpouštědlo (ethanol, aceton) Safranin

Co jsou to Micely

Kulovité zbytky jedné lipidové vrstvy - plavu v micelární vodě - jsou uměle připravovány

Popiš vnitřní prostředí lysozomů

Kyselé prostředí - 40 druhů hydroláz, pH cca 5

Vážnost kyslíku a dusíku

Kyslík - 6 elektronů Dusík - 5 elektronů

Co určuje lineární sekvence Nukleotidů v DNA

Lineární pořadí aminokyselin v proteinech

Lokalizace čeho probíhá v jádře euk. b.

Lokalizace hlavní části genetické informace - Chromatin, procesy replikace a transkripce

Popiš druhý krok barvení podle grama

Lugolův roztok (KI) STABILIZACE VAZBY KRYSTALOVÉ VIOLETI NA PEPTIDOGLYKAN - OPĚT VŠECHNY BAKTERIE TMAVĚ FIALOVÉ

Jaké máme organely katabolismu a v čem jsou funkčně stejný

Lysozomy Vakuoly Peroxisomy, glykoxysomy - Odstranění škodliviny - intracelulární degradace molekul

Jaké organely slouží v eukaryotních buňkách intracelulární degradaci molekul

Lysozomy, vakuoly

Vysvětli princip fluorescence u fluorochromů (=fluoroforů)

Látka absorbuje určitou energii - dochází k přeskoku jejich elektronů s nižší energetické hladiny na vyšší energetickou hladinu -> tím dochází k excitaci atomu Excitovaný stav není stabilní, a tak vzápětí dochází k deexcitaci(= přeskok a elektronů zpět na původní hladinu) - přičemž je uvolněna přebytečná energie v podobě světelné energie, tepla nebo jinou formou - Jedním z projevů excitace a tomu je luminiscence

Popiš exocytózu

Látky jsou uzavřené v transportních měchýřcích veziklu, ten se přesouvá do blízkosti PM, fúzuje s ní a jeho obsah se uvolňuje do okolního (extracelulárního) prostředí

Jakým způsobem se účastní virusy intracelulárního parazitismu

Lýzou buňky nebo integrací do genomu- lyzogenníncyklus

Funkce Glykokalyx

MECHANICKÁ OCHRANA POVRCHU BUŇKY REALIZACE BUNĚČNÝCH INTERAKCÍ - NAPŘ. MEZI OOCYTU A SPERMIEMI

Popiš Endocytickou dráhu Vezikulárního transportu

MEMBRÁNA → LYSOSOM/endosom Molekuly z vnější ho prostředí jsou uzavřeny do váčku plazmatické membrány Přesun k raným endozomům a lysozomům Při dálkovém transportu jsou váčky vedeny pomocnými proteiny, které se pohybují podél vláken cytoskeletu, jinak difúze Hydrolytické enzymy v lyzozomech zajistí rozklad přijatého materiálu

Co jsou to Plazmodezmata

MEZERY V BUNĚČNÉ STĚNĚ, KTERÝMI DOCHÁZÍ K PROPOJENÍ CYTOPLAZMY DVOU SOUSEDNÍCH BUNĚK V RÁMCI PLETIVA

Co to jsou nepřímé interakce buněk + co determinují

MEZI BUŇKAMI A ECM - DETERMINUJÍ USPOŘÁDÁNÍ TKÁNĚ/PLETIVA

Co jsou to lipidové rafty

MIKRODOMÉNY PM, KTERÉ SE V NÍ POHYBUJÍ JAKO CELEK - uvnitř transmembránové proteiny, Glykolipidy

Jací byli předchůdci prvních eukaryot

MIKROORGANISMY PODOBNÉ BAKTERIÍM (ŽÁDNÉ VNITŘNÍ MEMBRÁNY)

K čemu slouží Golgiho aparát eukaryotních buňkách

MODIFIKACE PROTEINŮ A LIPIDŮ, JEJICH TŘÍDĚNÍ PRO SEKREČNÍ DRÁHY

Co kontroluje aktivaci kináz a fosfatáz , Které způsobí maximální aktivitu MPF

MPF - Díky pozitivní zpětné vazbě

Které bakterie provádí intracelulární parazitismus

MYKOPLAZMATA, RICKETTSIE, CHLAMYDIA

Charakterizují náboje velkých molekul z mnoha polárními skupinami

Mají na svém povrchu místa s částečným kladným a záporným nábojem - možnost nekovalentní Iontové interakce s molekulami s komplementárním rozložením náboje

Jak se sinice vznášejí ve vodě

Mají plynové váčky

Co aktivují aktivované receptory ( receptorové kinázy)prostřednictvím adaptéru + Kam se dál signál šíří

Malé jednopodjednotkové proteiny G (Ras) odtud se signál šíří dále do nitra buňky

Jaké molekuly prochází přes bio membránu difuzí + na čem závisí rychlost

Malé nenabité polární molekuly - molekuly rozpouštědel (H2O, glycerol, ethanol) Rychlost závisí na velikosti molekuly Probíhá po koncentračním Gardientu

Jaké molekuly prochází přes biomembránu volnou difúzí

Malé nepolární molekuly - typicky molekuly plynu (O2, CO2, N2) Proti koncentračnímu gradientu

Co je to secernovaný materiál

Materiál co buňky vylučují ven

Důsledky vystavení buněk nízké teplotě - fyzikální stres

Mechanické poškození biomembrán- změna skupenství vody s kapalného na tuhé - zároveň zvětšení jejího objemu- Potrhání biomembrán poruchy struktury a funkce cytoplazmatických mikrotubulů (INTRACELULÁRNÍ TRANSPORT, ANAFÁZNÍ ROZESTUP CHROMOZOMŮ...) POŠKOZENÍ MEMBRÁNOVÝCH ORGANEL a PROMÍCHÁNÍ VNITŘNÍCH KOMPARTMENTŮ V BUŇCE

Čemu se rovná cytokineze I

Meióze II

Jaké proteiny se syntetizují na ribozomech vázaných na rER

Membránové proteiny,proteiny organel a bílkoviny uvolňované mimo buňku

Co je to buněčný kortex

Membránový skelet

Čím je udržován Gradient rozložení Ca2+

Membránovými pumpami

V jakém rozmezí teplotního šoku je poškození buněk i ireverzibilní

Mezi 40 až 50°C

Mezi jakými polohami obvykle kolísají proteiny - přenašeče + podstata přepnutí + Co je přivádí do jednotlivých stavů

Mezi polohami zapnuto a vypnuto Podstata přepnutí: obvykle připojení nebo odpojení zbytku kyseliny fosforečné nebo GTP/GDP Signál převádí stav přenašeče z neaktivního do aktivního stavu

Vztah mezi čím definuje genetický kód

Mezi strukturou DNA a Strukturu aminokyselin

Jaké druhy za obalení hydrofobních konců jako ochrana před vodou máme - PM

Micely a liposomy

Funkce mikroklků a jak jinak nazýváme

Microvilli - Zvětšováním buněčného povrchu - důležité ústředního epitelií

Jaké typy akty nových struktur najdeme v živočišných buňkách

Microvilli Stresová vlákna Lamellipodia, filopodia Kontraktilní prstenec

Co je to laterální difuze pokud se bavíme o plazmatické membráně a jejím fluidním charakteru

Migrace molekul v rámci jedné vrstvy

Na co rozdělujeme světelnou mikroskopii

Mikroskopie ve světlém (bright field - BF) a tmavém poli (dark field - DF)

V kolik ji najdeme membrán mitochondrií a u chloroplastů

Mitochondrie - vnitřní a vnější membrána Chloroplasty = a vnitřní a vnější membrána a 3. Membránový systém - thylakoidní membrána

Jinak já buněčné organely eukaryotických buněk mají schopnost autoreprodukce

Mitochondrie a Chloroplasty (nezralé formy = proplastidy)

Které membránové organely se nezapojují do Vezikulárního transportu a proč

Mitochondrie a Chloroplasty - mají vlastní DNA

Z Čeho si podle endosymbiotické teorie vyvinuly mitochondrie a z čeho Chloroplasty

Mitochondrie se vyvinuly z proteobakterií a chloroplasty ze sinic.

Jak se uspořádávají molekuly vody se okolo nepolárních látek

Molekuly vody netvoří vodíkové můstky si nepolárními látkami, místo toho tvoří uspořádané klece kolem nich - jedná se o energeticky výhodnější agregovaný stav

V jakém vztahu musí být přitažlivé a odpudivé síly aby vznikla Kovalentní vazba

Musí být přesně vyváženy

Čím je vyplněná cytoplazma svalových vláken + Definice

Myofibrilami = Kontraktilní Podjednotky svalových buněk

Co je to glykoxysomy

Měchýřkovité (vezikulární) útvary - tzv. mikrotělíska rostlinných buněk obsahující enzymy, které jsou potřebné k přeměně zásobních tuků na cukry

Co je strukturním důvodem neaktivity kaspáz + jak se Kaspáza aktivuje

N-konec - důvod neaktivity V průběhu aktivace je z tohodle konce odštěpená prodoména tak a zase stává funkční

Popiš iniciační fázi apoptózy + poznáme jiná buňkách

NA BUŇKÁCH NENÍ POZOROVATELNÁ −poruchy mitochondrií a uvolnění cytochromu C, resp. napojení ligandu na death receptors- -aktivace kaspáz

Co se odehrává na hrubém endoplazmatickém retikulu

NA VNĚJŠÍM POVRCHU POKRYTO RIBOZOMY, KTERÉ SYNTETIZUJÍ PROTEINY PRO ER, GOLGIHO APARÁT, LYSOSOMY, PLAZMATICKOU MEMBRÁNU A SEKREČNÍ PROTEINY

Popiš dokování autofagosomu + co vzniká - autofagie

NAPOJENÍ NA LYSOZOM) → FÚZE VNĚJŠÍ MEMBRÁNY S LYSOZOMEM (AUTOFAGOLYSOSOM)

Co to znamená polarizace a čeho je následkem

NEROVNOMĚRNÉ ROZLOŽENÍ ELEKTRONŮ NASTÁVÁ U KOVALENTNÍCH VAZEB SPOJUJÍCÍCH ATOMY RŮZNÝCH PRVKŮ, KTERÉ PŘITAHUJÍ ELEKTRONY RŮZNOU SILOU NEROVNOMĚRNÉ ROZLOŽENÍ ELEKTRONŮ V MOLEKULE - KLADNÝ NÁBOJ JE SOUSTŘEDĚN NA JEDNOM A ZÁPORNÝ NÁBOJ NA DRUHÉM KONCI

Co nemají priony

NK

Rozdíl mezi nukleotidem a nukleosidem

NUKLEOSID = BÁZE + CUKR (ad3nosin, guanosin, cytidin,..) − NUKLEOTID = NUKLEOSID + FOSFÁT (adenin, guanin, thymin)

Na co je Redukovaná ECM v epitelech

Na Bazální laminu

Na jaké straně membrány je umístěn G protein

Na cytosolové straně

Na co se změní eri trombocyty v hypertonickém prostředí

Na echinocyty - Ježaté erytrocyty

Na co se rozpadá jederný obal během prometafáze

Na membránové váčky

Na jaké podjednotce G proteinu dochází k záměně GDP na GTP

Na podjednotce alfa

Na co se vážou mitogeny + co se děje po aktivaci

Na povrchové receptory a aktivují je - aktivované receptory stimulují různé buněčné signální dráhy, které zajistí zvýšenou proliferací tím, že uvolní nitrovuněčné molekulární brzdy, Které blokují přechod z fáze G1 do fáze S

Kde se projeví změna konformace receptorů po vazbě ligandů

Na vnitřní straně membrány

Kde jsou syntetizovány cytosolové proteiny

Na volných cytosolových ribozomech

Funkci jaké struktury v organismu často napodobují léky

Napodobují často přirozený ligand a vážou se na receptor a blokují ho (antagonisté) Nebo nadměrně stimulují(agonisté) Jeho aktivitu

Popiš periferní asociované proteiny

Napojí se přímo na lipidovou dvojvrstvu - interagují s integrálním (transmembránovým) proteinem

Jakým typem transportu probíhá vstup proteinů do ER+ Co je podmínkou

Nastává ještě před dokončením jejich syntézy - kotranslačně Přítomnost signální sekvence pro ER

Popiš terminaci Translace

Nastává v okamžiku, kdy do místa A vstoupí terminační kodon - UAA, UAG , UGA Zároveň se do místa a váže uvolňovací faktor => Místo aminokyseliny se ke karboxylovému konci vzniklého polypetidu váže molekula vody - terminace translace

Jak vznikají proteoglykany

Navázáním GAG na takzvané proteinové jádro

Průměr Intermediární filamenta

Nazývají se střední filamenta z toho důvodu že jejich průměr je střední kolem 10 nm

Co je zapojeno do navádění ribozomu k mémbráně

Nejméně dva proteiny SRP A receptor pro SRP

Hlavní tipy buněčné smrti

Nekróza Nekroptóza Apoptóza Autofagie Anoikis

Co způsobuje absence genu p53

Nemožnost pozastavení buněčného cyklu - replikace neopravené DNA - až v 50% lidský zhoubných nádorů je právě mutace genu p53 - jeho absence tady způsobuje hromadění mutací a zvyšuje tak riziko vzniku rakoviny

Kdy může dojít k nondisjunkci a co to je+ u koho

Neoddělení homologických chromozomů V anafázi I u homologních chromozomů nebo u sesterských chromatid v anafázi II

Kde se parakrinní způsob signalizace neprojevuje

Neprojevuje se v krvi

Popiš jak se liší syntéza transmembránových proteinů na ER od těch ostatních

Nepřechází do Lumen úplně, ale zůstávají zanořeny v mémbráně ER translokace je přerušená pomocnou sekvencí hydrofobních aminokyselin, která ukotvuje protein v membráně (sekvence zastavující přenos) Po odštěpení signální sekvence a umístění proteinu v lipidové dvojí vrstvě Proteosyntéza pokračuje na cytosolové straně membrány

Co je to de novo

Nově nasyntetizovaný = od počátku. Mnohé i velmi složité látky si lidský organismus dokáže vytvořit de novo z jednoduchých látek, např. bílkoviny z aminokyselin apod. Naproti tomu většinu vitaminů, stejně jako např. esenciální aminokyseliny musí získat již hotové z potravy dosl. „znovu"

Chaperony pomáhají vytvořit terciální strukturu jakých proteinů

Nově vzniklým ale i denaturovaným

Latinsky jádro

Nucleus

Jak je máme nemotorové asociované proteiny s aktinovými filamenty

Nukleační proteiny Proteiny zajišťující zásobu G-aktinu Proteiny regulující délku filament blokováním jednoho konce vlákna Proteiny stimulující polymeraci Proteiny depolymerující aktinová vlákna Proteiny spojující aktinová vlákna Proteiny schopné štěpit aktinová vlákna

Jak jinak nazýváme jaderný skelet + co to je

Nukleoskelet = Soustava proteinů uvnitř jádra , součástí je také jadérkový skelet Vlákna o průměru 3 až 5 nm

Jaký typ energie jako podpory je nutný pro transport větších molekul a makromolekulárních komplexu jadernými póry - navázání NLS

Nutná energetická podpora hydrolýzou GTP

K Čemu jsou nutné Proteiny asociované s Mikrotubuly + 2 druhy těchto proteinů

Nutná jejich přítomnost pro správnost fungování mikrotubulů - Hrají důležitou roli při rozmisťování membránových organely Eukaryotní buňce Nemotorové a motorové asociované proteiny

Jaký průchod je nutný pro přechod buňky do mitózy

Nutný je průchod buňky kontrolním bodem buněčného cyklu G2

V kolik alel musí být pro manifestací poškození inaktivováno v případě nádorových supresorů a kolik v případě onkogenů=> stále odvodíme jestli mají recesivní nebo dominantní účinek

Nádorové supresory - Pro manifestaci poškození musí být inaktivovány obě alely Diploidního organismu - recesivní účinek Onkogeny - stačí inaktivace jedné alely diploidního organismu - dominantní účinek

O kolik vyšší musí být energie pro přerušení kovalentních vazeb a řekl důvodu jsou biologických systémech Kovalentní vazby stabilní

ODOLNÉ K NÁRAZŮM VYVOLANÝM TERMÁLNÍ ENERGIÍ (ENERGIE NUTNÁ PRO JEJICH POŠKOZENÍ MUSÍ BÝT CCA 100X SILNĚJŠÍ NEŽ ENERGIE TERMÁLNÍCH TENZÍ)

Popiš odstranění primeru

ODSTRAŇUJE 5'- 3' EXONUKLEÁZOVÁ A NAHRAZUJE POLYMERÁZOVÁ AKTIVITA DNA-POLYMERÁZY

Kdy probíhá syntéza stavebních proteinů elastických vláken + nějaké buňky syntézu zajišťují

OMEZENA NA EMBRYONÁLNÍ A JUVENILNÍ (DĚTSTVÍ A RŮST) FIBROBLASTY - V DOSPĚLOSTI SYNTÉZA OMEZENA -> POSTUPNÁ ZTRÁTA PRUŽNOSTI TKÁNÍ

Co říká Oparin-Haldanova teorie vzniku života + Jiný název pro tuto teorii

ORGANICKÉ SLOUČENINY SE EVOLUČNĚ VYVINULY Z JEDNODUCHÝCH ANORGANICKÝCH SLOUČENIN Teorie abiotického vývoje

Popiš vytvoření autofagosomu Během Autofagie

Obklopuje mitochondrie a další vezikly které mají být natráveny - tvořen dvěma Biomembránami

Co je to Vezikulární transport

Obousměrný dopravní systém mezi ER a plazmatickou membránu/lysozomem Forma komunikace mezi vnitřkem buňky a okolím

Co jsou to homologní chromozomy - homology

Obě verze každého chromozomu - nejsou geneticky identické, protože nesou různé varianty mnoha genů - jeden od otce a druhý od matky

Co zajišťuje Bazální lamina (membrána)

Oddělení povrchu Epiteliálního listu a další tkáně - obvykle Pojivo

Popiš asymmetry dvojvrstvy - bilayer

Odlišné složení fosfolipidů a glykolipidů v obou vrstvách bilayeru

Jaké odpovědi buněk zajišťují často receptory spojené s enzymy

Odpovědi buněk na růstové faktory

Jaké signály se odstraňují během indukce a průběhu apoptózy

Odstranění pozitivního signálu ▪ růstové faktory - neurony ▪ interleukin 2 (IL-2) - lymfocyty

Které signály se odstraňují a které přijímají během indukce a průběhu apoptózy

Odstranění pozitivního signálu Přijetí negativního signálu

V jakém okamžiku začíná prometafáze

Okamžiku rozpadu jaderného obalu

Charakterizuj diploidní fázi už životního cyklu kvasinek a jakým způsobem se nejčastěji množí

Omezena na velmi krátkou etapu - obvykle se množí nepohlavně procesem půjčení

Jaké dvě kategorie genu bývají u nádorových buněk mutovány

Onkogeny a nádorové supresory VYSOKÁ AKTIVITA ONKOGENŮ A NEDOSTATEČNÁ AKTIVITA NÁDOROVÝCH SUPRESORŮ URYCHLUJE BUNĚČNÝ CYKLUS A PŘISPÍVÁ KE KANCEROGENEZI Mutacemi jsou onkogeny hyperaktivovány a nádorové supresory inaktivovány

Jak se nazývá regulační oblast DNA

Operátor

Jak se nazývá nejzákladnější teorie o vzniku života

Oprain-Haldanova teorie abiotického vývoje - Nezávisle na sobě jí vypracovaly Oparine a Haldan

Funkce MTOC

Organizace eukaryotických bičíků a řasinek a organizace mitotického a meiotického vřeténka, které odděluje chromozomy během buněčného dělení

Funkce centrozomu

Organizace mikrotubulů do prostorové sítě a zajišťuje navázání chromozomů na Mikrotubuly během buněčného dělení

Na co slouží lipidové rafty

Organizační centra pro signální molekule - slouží jako signální molekuly

Jakým způsobem katabolizují peroxisomy, glyokysomy

Oxidací

Uspořádání fibril kolagenu ve šlaše

PARALELNÍ SVAZKY VE SMĚRU SHODNÉM S HLAVNÍ OSOU NAPĚTÍ - NAMÁHÁNÍ V JEDNOM SMĚRU Obrázek = molekulární struktura kolagenu

Jak se nazývá růstový faktor krevních destiček + Jak funguje

PDGF (PLATELET-DERIVED GROWTH FACTOR) PORANĚNÍ → SRÁŽENÍ KRVE → KREVNÍ DESTIČKY UVOLŇUJÍ PDGF V MÍSTĚ PORANĚNÍ SE PDGF VÁŽE NA RECEPTOROVÉ TYROZINKINÁZY PŘEŽIVŠÍCH BUNĚK A STIMULUJE JEJICH BUNĚČNÝ CYKLUS (DRÁHA: RECEPTOR → CYKLIN D → RB → E2F) → ZHOJENÍ RÁNY

Co je podmínkou nekovalentní ch vazeb mezi makromolekulami - Jak mohou tvořit silnější vazby i přesto že samotná nekovalentní vazba je velmi slabá

PODMÍNKOU JE KOMPLEMENTARITA TVARU MOLEKUL PRO DOSTATEČNÉ PŘIBLÍŽENÍ - MEZI MOLEKULAMI SE VYTVÁŘÍ VĚTŠÍ POČET VAZEB INTERAKCE MEZI MOLEKULAMI JSOU SPECIFICKÉ (VAZBY SE VYTVOŘÍ S DOSTATEČNOU STABILITOU JEN MEZI SPRÁVNÝMI PARTNERY)

Co zajišťují nemotorové asociované proteiny s aktinovými filamenty

POLYMERACE A PROSTOROVÉ USPOŘÁDÁNÍ AF

V jakých strukturách je buněčné stěně s celulóza

POLYMERY CELULÓZY → VLÁKNO CELULÓZY (CELULÓZOVÉ FIBRILY) → PODÉLNÉ SVAZKY Vlákna celulózy jsou obvykle protkaná jinými Polysacharidy

Popiš elongaci Translace

POSTUPNÉ PŘIPOJOVÁNÍ AMINOKYSELIN K ROSTOUCÍMU PEPTIDU SLED UDÁLOSTÍ: − INICIAČNÍ AMINOACYL-TRNA JE NAVÁZÁNA V MÍSTĚ P RIBOZOMU − PŘENOS INICIAČNÍ AMINOKYSELINY Z TRNA V MÍSTĚ P NA TRNA V MÍSTĚ A VYTVOŘENÍM PEPTIDOVÉ VAZBY (PEPTIDYLTRANSFERÁZOVÁ AKTIVITA JE SOUČÁSTÍ PODJEDNOTKY 50S RIBOZOMU) − POSUN RIBOZOMU PO MRNA VEDOUCÍ K UMÍSTĚNÍ DALŠÍHO KODONU DO MÍSTA A − ZÁROVEŇ SE VZNIKLÝ DIPEPTID NAVÁZANÝ NA TRNA PŘEMÍSTÍ Z MÍSTA A DO MÍSTA P - PRÁZDNÁ" TRNA SE PŘEMÍSTÍ Z MÍSTA P DO MÍSTA E

Jaký je následek přímého efektu ionizujícího záření

POŠKOZENÍ CÍLOVÉ MOLEKULY (DNA - JEDNOŘETĚZCOVÉ NEBO DVOUŘETĚZCOVÉ ZLOMY V CUKR-FOSFÁTOVÉ KOSTŘE)

Vývojové druhy lysozomů - v čem se liší

PRIMÁRNÍ (NOVĚ VZNIKLÉ) A SEKUNDÁRNÍ (PO FÚZI S TRANSPORTNÍM VEZIKLEM)

Na jakém principu funguje interakce mezi buňkami a ECM

PRINCIP VAZBY FOKÁLNÍ ADHEZE A HEMIDESMOSOMU

Co probíhá na rER

PROBÍHÁ ZDE PROTEOSYNTÉZA A POSTTRANSLAČNÍ MODIFIKACE PROTEINŮ

Co je příčinou polarity NK

PROPOJENÍ 5' UHLÍKU NA JEDNO CUKERNÉM ZBYTKU S 3' UHLÍKEM NÁSLEDUJÍCÍHO CUKERNÉHO ZBYTKU PROSTŘEDNICTVÍM FOSFÁTU

Co jsou to cykliny + Vysvětli proces fungování

PROTEINY SCHOPNÉ VAZBY NA CYKLIN-DEPENDENTNÍ KINÁZY − POZITIVNÍ REGULÁTORY − ZAJIŠŤUJÍ SPRÁVNÉ ČASOVÁNÍ JEJICH AKTIVITY − NEMAJÍ ENZYMOVOU AKTIVITU, ALE INTERAKCÍ S CDK JI AKTIVUJÍ

Vysvětli Fotosyntetické membrány u sinic

Ploché Membránové útvary nacházející se v celém prostředí cytoplazmy Na povrchu Cyanosomy (fykobilisomy)

Popiš TEM

Podobné uspořádání jako LM - Ale pracuje se s proudem elektronů který prochází objektem a sledujeme obraz ZDROJ ELEKTRONŮ (KATODA) → KONDENZOR → VZOREK → OBJEKTIV → PROJEKTOR NUTNOST TZV. KONTRASTOVÁNÍ PREPARÁTU (VNESENÍ ATOMŮ TĚŽKÉHO KOVU), MALÉ OBJEKTY NEBO ULTRATENKÉ ŘEZY (MAX. 40 NM) - U OBJEKTŮ POD 40 NM SE POZOROVANÉ OBJEKTY NANESOU NA SÍŤKU A POLIJÍ SE TENKOU VRSTVOU ROZTOKU OBSAHUJÍCÍ ATOMY TÉŽKÉHO KOVU (NAPŘ. KYSELINA FOSFOWOLFRAMOVÁ)

Jak se mohou rozmnožovat eukaryotické organismy

Pohlavně i nepohlavně

Co je to fagosom a jak vzniká

Pohlcená infekční částice - fagocytóza Na povrch infekční částice se vážou protilátky- Infekční částice s navázanými protilátkami se váže na povrch fagocytické buňky a aktivuje ji- Následkem je tvorba listovitých výběžku plazmatické membrány (pseudopodií) které čas nici pohltí = vzniká fagosom - Potom fagosomy fúzují s lysozomy

Co se děje v anafázi B

Pohybují se samotné poli Vřeténka, které se od sebe vzájemně oddalují Klouzavá síla vzniká mezi polárními Mikrotubuly za opačných pólu a tlačí tyto póly od sebe Tažná síla působí přímo na póly a táhne je od sebe

Mezi jakými polohami kolísají proteiny - přenašeče + podstata přepnutí

Polohy zapnuto a vypnuto Podstata přepnutí: obvykle připojení nebo odpojení zbytku kyseliny fosforečné nebo GTP/GDP

Mechanizmus améboidního pohybu

Polymerace aktinu na vedoucím okraj buňky vysunuje plazmatickou membránu kupředu a vytváří nové oblasti s aktinovým kortexem Vytváří se nová spojení mezi aktinovými vlákny v cytoplazmě a ukotvením plazmatické membrány na povrchu, po němž se buňka pohybuje (substrát) Stah kortexu posunuje buňku kupředu, zatímco se zadní část buňky odpojuje od substrátu a přitahuje se k tělu buňky - přitom depolymerizují aktinová vlákna v přitahované části buňky a uvolněné Monomery aktinu se po koncentračním spádu pohybují do přední části buňky, kde mohou být zapojeny do dalšího cyklu Polymerace aktinových vláken - stejný cyklus se trvale opakuje a umožňuje pohyb buňky kupředu po malých krocích

Pomocí čeho protein Ras Komunikuje s receptorem

Pomocí adaptérů

Pomocí čeho se propojují IF s kolagenními vlákny ECM

Pomocí asociovaných proteinů

Jak je zprostředkován pohyb chromozomů opačným pólům Vřeténka během Anafáze

Pomocí dvou nezávislých procesu, které jsou zprostředkovány různými částmi mitotického Vřeténka

Pomocí čeho probíhá Indukovaná fúze a typy a co to je

Pomocí fúzogenů - fyzikální - elektrické pole (ovce Dolly) - Chemické - polyethylenglykol - biologické - virusy Navození umělé fúze

Prostřednictvím čeho komunikují membrány jednotlivých organel v eukaryotické buňce

Pomocí váčků

Pomocí čeho chaperoniny Hsp60 sbalují proteiny

Pomocí zvláštní kapsy, do které protein umístí

Vysvětli nemotorové asociované proteiny s Mikrotubuly + 2 druhy

Pomáhají mikrotubulům uskutečňovat jejich strukturní funkce - např. stabilizace prostorového uspořádání - důležité pro fungování nervových spojů -> MAPs (microtubule associated protein) - MAP-1, MAP-2 > většinou lokalizovaný na povrchu mikrotubulů - předpokládá se že zprostředkovávají interakce mezi Mikrotubuly a interakce mikrotubulů s jinými buněčnými strukturami -> tau-protein - nejznámější (v nervových buňkách) = nízkomolekulární MAPs > skupina velmi podobných proteinu, jejichž počet se mění v závislosti na druhu tkáně od 3 do 6

Jaké buňky mají Chloroplasty

Pouze buňky rostlin

Kolik kopií genetické informace obsahuje Gameta

Pouze jednu kopii - je haploidní kočka nechce pouze jednu sadu chromozomů

Kde najdeme Intermediární filamenta + K čemu slouží

Pouze v živočišných buňkách zvýšení odolnosti buňky proti mechanickému poškození determinace tvaru buňky a lokalizace organel integrace komponent cytoskeletu

Charakterizuj receptory pro G- Proteinovou signalizaci

Početná rodina, stovky členů Zprostředkovávají odpovědi na rozmanité podněty - hormony, lokální mediátory, nervové mediátory evoluční konzervativnost: u obratlovců (fotoreceptorový protein sítnice-rhodopsin, čichové receptory) u kvasinek,..

Další Konformace DNA

Pravotočivá A-DNA Levotočivá Z-DNA

Jaká konformace DNA je klasicky popisována

Pravotočivá B-DNA

Co způsobuje scrapii a jak se jinak tato nemoc nazyva

Priony BOVINNÍ SPONGIFORMNÍ ENCEFALOPATIE (BSE) Nemoc šílených krav

Vazebná místa pro co se nachází na vnitřní membráně jádra

Pro chromozomy a jadernou laminu =síť proteinových vláken poskytující vnitřní oporu

co je to meióza a co umožňuje

Proces buněčného dělení umožňující tvorbu haploidní gamet

Co je to Anabolismus

Proces syntézy komplexních buněčných molekulu z molekul jednodušších s využitím dříve zachycené energie

Kompartmentalizace

Proces tvorby kompartmentů Nitro buněčné kompartmenty = organely

Popiš integrální transmembránové proteiny

Prochází biomembránou skrz - na obou stranách membrány volné domény - mohu i několikrát

Příklad proteinu stimulující polymeraci - proteiny asociované s aktinem

Profilin

Co se aktivuje při přenosu signálu do cytoplazmy během apoptózy vyvolené vnějšími signály - Jaká prokaspáza

Prokaspáza 8

Jak se nazývá sekvence DNA na kterou se váže RNA-polymeráza při transkripci

Promotor - Zahájení transkripce

Co je to periplazmatický prostor

Prostor mezi PM a BS

Jakým způsobem je omezena působnost parakrinní signalizace

Prostorové i časově

Popiš indukci Autofagie

Prostřednictvím vnější ho signálu - např. nedostatek živin v okolí

Vysvětli Hypotonické prostředí + co se děje

Prostředí s nižším osmotickým tlakem Voda proniká do buněk

Co je ortologem tubulinu v cytoskeletu + Jeho funkce

Protein FtsZ - Ale plný podobné funkce jako aktinová filamenta

Jaký protein a jaký enzym zprostředkovává hladinu p53+ Vysvětli

Protein Mdm2 a ubikvitin ligáza E3 P53 aktivuje Expresi Mdm2 , Protein Mdm2 modifikuje protein p53 ubiquitinací a zajišťuje tak jeho degradaci proteazomem

Co řídí kontrolní bod restrikce v G1 fázi a jak se zastaví v týhle fázi - mechanismus

Protein Rb a transkripční faktory E2F Spojení Cdk komplexu s cyklinem D S fosforyluje protein Rb Fosforylovaný Rb ztrácí schopnost vazby E2F (= klíčový faktor S-fáze)

Co nastává při absenci adresové sekvence proteinu

Protein zůstává v cytosolu

Jaká skupina enzymu provádějí defosforylaci - BC

Proteinffosfatázy

Jaké enzymy způsobují fosforylaci - Molekulový přepínač + co dělají tyto enzymy

Proteinkináza - katalyzuje Kovalentní připojení fosfátu k proteinu Proteinfosfatáza - katalyzuje odstranění fosfátu

Jaké máme fosforylační molekulové přepínače - enzymy + Co konkrétně dělají

Proteinkináza - katalyzuje Kovalentní připojení fosfátu k proteinu Proteinfosfatáza - katalyzuje odstranění fosfátů

Typy SNARE proteinů+ Popis jejich specifitu

Proteiny SNARE váčků = v-SNARE Proteiny SNARE cílových membrán = tSNARE (target) KAŽDÁ ORGANELA MÁ SVOU TYPICKOU VARIANTU PROTEINU SNARE

Funkce exportinů

Proteiny pomáhající exportu RNA z jádra- Zajišťují translokaci membrány

Vysvětli Posttranslační transport proteinů

Proteiny přepravovány až po své syntéze - z cytosolu do mitochondrií, Chloroplastů, Peroxizomů, vnitřního prostoru jádra

Jaké máme Monmery pro výstavbu buněčných polymerů

Proteiny, Nukleové kyseliny, Polysacharidy

A co vše může být signálem u chemických signálů

Proteiny, krátké peptidy, aminokyseliny, Nukleotidy, steroidy, retinou jdi, mastné kyseliny a jejich deriváty, ale i molekuly plynu

Jaká skupina enzymu provádí fosforylační reakce, které regulují buněčný cyklus

Proteokinázy- Katalyzují přenos jedné fosfátové skupiny z ATP na určitý postranní řetězec aminokyseliny v cílovém proteinu Účinek fosfátové skupiny může být velice rychle zrušen jejím odstraněním= Defosforylace

Co jsou to kaspázy

Proteolytické enzymy vykonávající apoptózu cysteinové proteázy, štěpící na karboxyskupině kyseliny asparagové caspases = cysteinyl-aspartic-acid-protease

Jakým procesem je extrahována chemická energie při buněčné respiraci

Proč jsem postupné oxidace - kontrolovaným hořením

Jakým způsobem dojde k navázání mikrotubulů na chromozom + Jak se po tom navázání jmenují Mikrotubuly + Co tyto Mikrotubuly dělají

Proč sledujeterného obalu se Mikrotubuly náhodně setkají s Kinetochory a navážou se na ně Mikrotubuly jsou nyní nazývány kietochorové mikrotubuly A spojují se s póly Vřeténka

Jakým způsobem převádí signál receptory typu iontových kanálku

Převádějí chemický signál ve formě dávky nervového mediátoru, uvolněného do okolí cílové buňky, přímo na elektrický signál v podobě změny napětí přes plazmatickou membránu

Co je to mating

Párování opačných typu kvasinek - vznik diploidní zygoty - okamžitých vstup do meiózy - Vytvoří se ascis se 4 ascosporami - Po jejich uvolnění dávají vzniku klasickým haploidním kvasinkám

Čím je zajišťován pohyb váčků mezi organelami na krátké vzdálenosti+ Příklad takové dráhy

Př . ER -> GA - Prostá difuze

Čím je zajišťován pojí váčku mezi organelami na delší vzdálenosti + příklad nějaké takové dráhy

Př . GA-> plazmatická membrána u velkých buněk Využití motorových proteinů pohybujících se podél vláken si to skeletu

Popiš proces flip- flop v PM

Překlápění - katalyzuje enzym v Lipáza - Nedochází k němu spontánně

Funkce transmembránových proteinů v PM

Přenašeče - iontové pumpy (Na+/K+ pumpa) Spojovací proteiny (integriny) Receptory (receptory pro růstové faktor) Enzymy (adenylcykláza) Vazebné místo nějaké chemické reakce v cytoplazmě

Jakým způsobem probíhá transport všech druhů RNA z jádra

Přenášené RNA Se spojují s proteiny obsahujícími adresovou sekvenci pro export z jádra Translokace membránou probíhá v komplexu s proteiny = exportiny

Čeho je převaha U pojivových tkání ECM nebo buněk+ proč

Převaha ECM Nad buňkami - nutnost mechanické pevnosti a odolnosti

Co se děje po detekci signálu povrchovým receptorem při signalizace zproztředkované povrchovými receptory

Převod mimobuněčného ligandu do podoby Nitrobuněčného signálu

Jakým způsobem může dojít k apoptóze mimoto když nastane chyba během a buněčného cyklu

Při absenci faktorů pro přežití

Kdy se chromozomy vyskytují v kondenzovaném stavu

Při buněčném dělení (Mitóza)

Popiš samozacelovací schopnost Biomembrán

Při porušení bio membrány dochází k zabalení hydrofobních konců jako ochrana před vodou

O kolik zkrátí molekulu DNA jedno omotání DNA okolo nukleozomu

Přibližně o 1/3

Proteinům asociovaný s čím je připojen kontraktliní prstenec během cytokineze u živočichů

Připojen k proteinem asociovaný s vnitřní stranou cytoplazmatické membrány

Popiš laterální proteiny

Připojené na jedné straně membrány

Co je to tzv. capping u modifikace primárních transkriptů u eukryot

Připojení čepičky na 5' konec = místo na které se vážou další proteiny - pomáhají translaci

Co považujeme za chemický stres buňky

Působení xenobiotik

Charakterizuj Podjednotky a počet molekul RNA u prokaryot a u eukaryot

RIBOZOMY PROKARYOT (70S: 30S + 50S) - VE VELKÉ PODJEDNOTCE 2 MOLEKULY RNA (5S A 23S), V MALÉ PODJEDNOTCE 1 MOLEKULA RNA (16S) RIBOZOMY EUKARYOT (80S: 40S + 60S) - VE VELKÉ PODJEDNOTCE 3 MOLEKULY RNA (5S A 5,8S A 28S), V MALÉ PODJEDNOTCE 1 MOLEKULA RNA (18S)

Jaké enzymy mohu začít tvorbu nového řetězce při replikaci DNA bez primeru

RNA- polymerázy

Popiš rozpad autofagosomálního veziklu - autofagie

ROZPAD VNITŘNÍ MEMBRÁNY→ ROZPAD OBSAHU VEZIKLU (KOMPLETNÍ NATRÁVENÍ MITOCHONDRIÍ)

Jaký protein je klíčový regulátor Proliferace + příklad

Ras např. intracelulární injekce protilátek anti-Ras: ztráta schopnosti receptoru aktivovat buněčnou odpověď na příslušný růstový faktor

Jaký protein je klíčový regulátor Proliferace+ Příklad

Ras např. intracelulární injekce protilátek anti-Ras: ztráta schopnosti receptoru aktivovat buněčnou odpověď na příslušný růstový faktor

Jak působí růstové faktory na protein Rb

Rb se za přítomnosti růstových faktorů fosforyluje - čímž uvolní E2F

A jaký typ receptorů se váže na DNA I bez přítomnosti ligandu

Receptor pro tyroidní hormon

Struktura nitrobuněčných receptorů+ pro co jednotlivé části slouží

Receptor pro tyroidní hormon

Co je to s cílová molekula

Receptorový protein - je obvykle aktivován pouze jedním typem signálu

Jaký receptury zajišťují převod chemických signálu na signály elektrické

Receptory spojené s iontovými Kanálky

Jaké eukaryotické buňky nemají mezerové spoje a co tvoří obdobu u tohodle typu buněk

Rostlinné buňky - obdobou jsou malé komunikační kanály zvané plazmodezmata, Která prochází buněčnou stěnu mezi buňkami a spojují cytoplazmu sousedních buněk

Charakterizují fluidní charakter dvojvrstvy

Rotace molekul kolem své Podélné osy Migrace molekul v rámci jedné vrstvy Překlápění (lip-flop) -

Vysvětli jednotky CESY

Rozeta = 6 rozetových podjednotek uspořádaných dokola

Popiš 3. krok barvení podle grama

Rozpouštědlo - ethanol, aceton ODBARVENÍ - GRAM-POZITIVNÍ BAKTERIE TMAVĚ FIALOVÉ (KRYSTALOVÁ VIOLEŤ SE NEZVLÁDNE VYMÝT)- krystalová violeť má možnost se zachytit ve více vrstvách peptidoglykanu GRAM-NEGATIVNÍ BAKTERIE BEZBARVÉ (RYCHLÉ VYMYTÍ KRYSTALOVÉ VIOLETI)

Jaké dva druhy proteinů se přenášejí z cytosolu do ER

Rozpustné a Membránové

Vysvětli jakým způsobem signální kaskády mohou rozdělit signál aby současně ovlivnil několik dějů

Různé typy recepturu existují pro stejný signál různé buňky mohou interpretovat příjem stejného signálu odlišně

S čím je spojen první výskyt fotosyntetizujících a aerobních organismu

S nárůstem vzdušného kyslíku v atmosféře - první 2 miliardy let se v atmosféře nevyskytoval žádný kyslík K nárůstu koncentrace začalo docházet asi 2.8 miliardy let po vzniku planety. Postupně docházelo k jeho nárůstu až na dnešní koncentraci - asi 20%, které bylo dosaženo před asi miliardou let

S Čím Je spojeno buněčné dělení u mnoho buněčných organismu

S vývojem tkáně/organismu - udržování homeostázy u dospělých organismu Buňky se dělí jen tehdy jelito potřebné - například nahrazení odumírajících buněk, hojení ran

Popiš poslední krok barvení podle grama

SAFRANIN - JASNĚ ČERVENÝ - PO VAZBĚ NA GRAM-POZITIVNÍ BAKTERIE ŽÁDNÁ ZMĚNA (TMAVĚ FIALOVÁ BARVA - SAFRANIN NEPŘEBARVÍ KRYSTALOVOU VIOLEŤ) U GRAM-NEGATIVNÍCH BAKTERIÍ ZMĚNA BARVY NA JASNĚ ČERVENOU (V PŘEDCHOZÍM KROKU DOŠLO K VYMYTÍ KRYSTALOVÉ VIOLETI)

Popiš CMA - chaperon-mediated autofagie

SELEKTIVNÍ TYP MAKROAUTOFAGIE - VYUŽITÍ TRANSLOKAČNÍCH KANÁLŮ V MEMBRÁNĚ LYSOSOMŮ, PŘES KTERÉ MOHOU PROCHÁZET KONKRÉTNÍ MOLEKULY/PROTEINY - CHAPERONY JSOU SCHOPNÉ MĚNIT KONFORMACI TRANSPORTOVANÝCH PROTEINŮ

Charakterizuj hydrofobní interakce + pro co je toto důležité

SÍLY PLYNOUCÍ Z VYTLAČOVÁNÍ HYDROFOBNÍCH MOLEKUL Z VODNÉHO ROZTOKU NEPOLÁRNÍ MOLEKULY MAJÍ VE VODĚ TENDENCI VZÁJEMNĚ AGREGOVAT - HYDROFOBNÍ SKUPINY SE TLAČÍ K SOBĚ, ABY MINIMALIZOVALY KONTAKT S VODOU - TZV. HYDROFOBNÍ EFEKT DŮLEŽITÉ PRO NAVOZOVÁNÍ VHODNÝCH PODMÍNEK PRO INTERAKCE MEZI MOLEKULAMI - ZVLÁŠTĚ PŘI VÝSTAVBĚ BUNĚČNÝCH MEMBRÁN

Co jsou to specifické inhibitory - chronický stres buňky

SLOUČENINY ZASAHUJÍCÍ KONKRÉTNÍ BUNĚČNÝ DĚJ A ZASTAVUJÍ KONKRÉTNÍ METABOLICKOU DRÁHU, KONKRÉTNÍ REAKCI

Co se děje když je zvýšená Apoptóza a Proliferace v normálu

SNÍŽENÍ POČTU BUNĚK -> DYSTROFIE

Popiš vzhled rER

SOUSTAVA PLOCHÝCH CISTEREN, NA KTERÉ JSOU PŘIPOJENY RIBOZOMY

Popiš vzhled GA

SOUSTAVA UZAVŘENÝCH MEMBRÁNOVÝCH CISTEREN (OBVYKLE 4-8) A VĚTŠÍHO POČTU MĚCHÝŘKŮ (KE KOMUNIKACI MEZI CISTERNAMI)

Součástí jakého řetězce jsou mitochondrie a k čemu slouží

SYNTÉZA ATP (RESPIRAČNÍ ŘETĚZEC)

Čemu slouží Chloroplasty za eukaryotních buňkách

SYNTÉZA ATP A FIXACE UHLÍKU (FOTOSYNTÉZA)

V čemu slouží Endoplazmatické retikulum v eukaryotních buňkách

SYNTÉZA LIPIDŮ, PROTEOSYNTÉZA (PROTEINY PRO OSTATNÍ ORGANELY, MEMBRÁNOVÉ A EXTRACELULÁRNÍ PROTEINY), - probíhá na ribozomech rER, REGULACE CA2+ v cytoplazmě

Jaký princip byl použit při úplně prvním Sekvenování genomu

Sanger to první zkoušel postupným definováním všech aminokyselin v proteinu - tento princip však u DNA nefunguje Přišel s nápadem nahradit štěpení DNA -> syntézou Si to zastavuje ve specifických místech pomocí inhibitorů (dideoxynukleotidů - např. Dideoxyguanosintrifosfát, ddGTP) A elektroforézou stanovuje pořadí fragmentů podle velikosti Sekvencí doklad jdu stanovuje podle jejího komplementárního obrazu

Co jsou to sekundární přenašeče a jak se jinak nazývají

Second messenger jedná se o nízkomolekulární struktury, produkty enzymově katalyzovaných reakcí, které přenášejí signál od povrchových receptorů k efektorům

Jaké jsou dvě dráhy Vezikulárního transportu

Sekreční dráha a Endocytická dráha

Co jsou to primární cílie

Senzorická Organela - není to pohybová Organela - Vzniká jako první cíliální struktura u buněk - Účastní se mezi buněčné signalizace - každá buňka má většinou jednu primární cílii

Jaké máme Nitrobuněčné proteiny + mechanizmus účinku

Seroidní/tyroidní Mechanismus: malá velikost/lipofilní povaha hormonů - difúze membránou - pevná vazba na nitrobuněčné receptory - konformační změna receptorů - zvýšená afinita ke specifickým sekvencím DNA - regulace transkripce cílových genů

Popiš způsob jakým drží chromozomy u sebe během zygotene

Sesterské chromatidy v každém homologu jsou dohromady pevně sbaleny tak, že ze strany směřující k proteinové kostře vybíhá řada chromatinových smyček

Jak se nazývá buňka která produkuje specifický typ molekul které jsou předávány cílové buňce

Signalizující buňka

Co převádí stav přenašeče z neaktivního do aktivního stavu

Signál

Když putuje signál k cílové buňce, jakým způsobem cílová buňka zaznamená signál a kam pak signál putuje

Signál aktivuje receptor na vnějším povrchu cílové buňky nebo v cytoplazmě- Aktivovaný receptor signál předává efektu room uvnitř buňky

Jak se nazývá specifický typ molekuly produkován signalizující buňkou a prostřednictvím čeho je předána cílové buňce

Signální molekule - předána prostřednictvím receptorového proteinu který na ní specificky odpovídá

Z jakých aminokyselin je složená signální sekvence vznikajícího polypeptidu a kdy se odštěpuje

Signální sekvenci tvoří krátký úsek hydrofobních aminokyselin Signální sekvence se odštěpuje během přenosu do Lumen ER

Popiš strukturu Eukaryotní chromozomů

Skládá se z jedné dlouhé lineární molekuly DNA- Na kterou jsou navázány proteiny

Čím je poháněno pučení váčků + Popiš tento proces

Skládáním proteinového pláště Specifický proteinový plášť obklopuje váčky na cytosolové straně Po ukončení půjčení vláček plášť ztrácí Existují různé typy opláštěných váčků se specifickými obaly

Co se děje jakmile vznikne jaderný obal v telofázi

Skrz póry pronikají do jádra další jederné proteiny, jádro roste, Kondenzované mitotické chromozomy dekondenzují do svého Interfáza jinýho stavu a je tak obnovena transkripce genu

Co se děje v metafázi meiózy I

Spárované chromozomy se seřazují v ekvatoriální rovině buňky.

Vysvětli motorové asociované proteiny (molekulové motory) + Dva druhy

Spojené s pohybovými funkcemi - charakteristická je pro ně ATP-ázová aktivita - Vážou se k aktinovým vláknům nebo mikrotubulům a přeměňují energii z opakovaných cyklů hydrolýzy ATP v mechanický pohyb - posunují se podél aktinových filament nebo mikrotubulů vždy v jednom určitém směru - přitom se na ně vážou další buněčné komponenty a tento náklad je posunován podél vláken Kinesiny a dyneiny

Co je to difuze

Spontánní děj, během kterého přecházím ale kvůli z prostoru s vyšší koncentraci do prostoru s nižší koncentraci Pokud jí látka na jedné straně membrány koncentrovanější než na druhé straně membrány, existuje tendence látek difundovat přes membránu po klesajícím koncentračním spádu Prochází jak rozpouštědlo taky rozpuštěna látka

Co zajišťuje vazba CAM na Cytoskelet uvnitř buňky + Pomocí čeho se navážou

Stabilizace - Pomocí asociovaných proteinu - pevnější pozice buňky ve tkání

Co je to provirus a jiny název

Stadium resp. druh virové infekce, při kterém je Nukleová kyselina viru začleněna do genomu hostitelské buňky Jiný název = profág

Stavba Intermediární filamenta

Stavební protein se liší podle histogenetického typu tkáně - nemají jeden univerzální stavební protein (jiné stavební proteiny v epitelech, pojivových tkání, nervových buňkách) Jsou tvořena mnoha stočenými dlouhými vlákny, čímž je dosaženo velké pevnosti vztahu - podjednotkou jsou protáhlé (fibrilární) proteiny, Každý z nich má globulární hlavičku na aminovém(N-)konci

Jaké jsou nejznámější hydrofobní signální molekuly

Steroidní a tyroidní hormony

Co je to Ortolog

Strukturně příbuzný

Co je to homolog

Strukturně příbuzný - nadřazené slovo ortologu a paralogu

Co je první viditelnou známku Cytokineze u živočišných buněk + V jaké fázi mitózy obvykle začíná

Svraštění plazmatické membrány a vytvoření rýhy- Během Anafáze

Jaký komplex drží u sebe chromozomy v zygotene meióza I a čím je tvořen

Synaptonemální komplex je tvořen protáhlou proteinovou kostrou, která má z každé strany přiložen jeden z replikovaných homologních chromozomů

Příklad poruchy kde dojde v embryonálním vývoji k potlačení - defektu apoptózy

Syndaktylie - Srostlé prsty

K čemu slouží RNA-polymerázy

Syntéze primerů při replikaci DNA (DNA-primáza)

Jak se liší systém regulace replikace DNA A segregace chromozomů u jednotlivých typů eukaryotických buněk

Systém je totožný - u Transkripce Translace

Kdo učinil objev O teorii RNA světa Jak

T.Cech na University of Colorado a Sidney Altman (Yale University) který objevil molekulu zvanou ribozym a za tento objev také obdržel Nobelovu cenu za chemii 1989 ribozym - katalyticky aktivní molekula RNA, která pak funguje jako enzym

Popiš průběh fúze

TĚSNÝ KONTAKT FÚZOVANÝCH BIOMEMBRÁN A JEJICH NÁSLEDNÉ SPOJENÍ

Jakým způsobem Eukaryotní organismy dokázali využít schopnosti bakterií zpracovávat kyslík

Takže je pohltily a získali tak evoluční výhodu Po pohlcení došlo k přesunu části genů mitochondrie do jádra. To vysvětluje, proč některé geny veukaryotním jádře, které kódují mitochondriální enzymy, připomínají bakteriální geny.

Příklad proteinu zajišťující zásobu - G-aktinu - proteiny asociované s aktinem + co dělájí

Thymosiny- blokují polymeraci G-aktinu a udržují jeho zásoby v cytoplazmě

Proč se kinázy systému regulace buněčného cyklu nazývají CDK

To že za správné načasování aktivity proteokináz jsou z odpovědné hlavně cykliny, Které ale sami osobě nemají žádnou enzymovou aktivitu, ale jejich navázání na kinázy je nezbytné k enzymové aktivaci těchto kináz

Popiš celý proces přenosu proteinů do ER

Translací vzniká polypeptidový řetězec se signální sekvencí na N-konci Signální sekvence rozeznána a vázána SRP Zpomalení syntézy daného proteinu Komplex SRP-ribozom se váže k receptoru SRP v membráně ER Po uvolnění SRP (recyklace) signální sekvence otvírá translokační kanál, Kterým se pro ten přesuny přes membránu a zároveň se obnovuje jeho syntéza Po splnění své naváděcí role je signální sekvence odštěpená signální peptidázou

Popiš INTRACELULÁRNÍ VEZIKULÁRNÍ TRANSPORT

Transport mezi organelami prostřednictvím membránových váčků Transportované molekuly se v cytoplazmě pohybují uzavřené v biomembráně - Podo putování k cílené Organela dojde ke splynutí biomembrán Velmi sofistikovaně řízeno

Co prochází jadernými póry

Transport větších molekul

Popiš proces řízené sekrece z buňky

Transportní váčky se zvětšují na sekreční váčky Sekreční váčky se shromažďují v blízkosti plazmatické membrány Přenášena molekula se uvolní jen po přijetí signálu Signály zachycené receptorem Přijetí signálu vyvolá exocytózou

Co je to kodon

Triplet nukleotidů v mRNA Definuje jednu aminokyselinu nebo terminaci translace

Co určuje lineární sekvence aminokyselin v DNA

Trojrozměrnou strukturu proteinů

Co je prekurzorem kolagenu a kde se nachází

Tropokolagen Nachází se extracelulárně - když se nachází v MZB prostoru - přeměňuje se na kolagen - odstřihávání se konce proteinu - vzniká dlouhé kolagenové vlákno

Příklady aktivačních molekul a specifických receptorů při apoptóze vyvolené vnějšími signály

Tumor necrosis factor a (TNF-a) - TNF receptor Lymphotoxin (TNF-b) - TNF receptor Fas-ligand (FasL) - Fas receptor (CD95)

Jaký signál potřebuji větší molekuly a Makro molekulární komplexy aby prošli jaderným pórem

Tzv. jaderný lokalizační signál = NLS

Jaký rozdíl mezi primárním transkriptem eukaryot a prokaryot

U prokaryot: PRIMÁRNÍ TRANSKRIPT JE EKVIVALENTNÍ MOLEKULE MRNA MRNA SE HNED PO SVÉM VZNIKU PODROBUJE TRANSLACI U eukaryot: PRIMÁRNÍ TRANSKRIPT JE PREKURZOREM MRNA (TZV. PRE-MRNA) PRE-MRNA SE NA OBOU KONCÍCH MODIFIKUJE A ZBAVUJE PŘEPISŮ INTRONŮ PO ÚPRAVÁCH SE MRNA EXPORTUJE DO CYTOPLAZMY, KDE SE PODROBÍ TRANSLACI

Jaké funkce membránového skeletu (kortexu)

UDRŽOVÁNÍ TVARU BUŇKY - ERYTROCYTY - HUSTÁ SÍŤ SPEKTRINU VYTVÁŘEJÍCÍ TROJÚHELNÍKY − ZMĚNY TVARU, LOKOMOCE (POHYB BUŇKY) - OSTATNÍ TYPY

Jaký typ UV záření má přímý efekt na buňky+ Jaký efekt

UVC TVORBA PYRIMIDINOVÝCH A CYKLOBUTANOVÝCH DIMERŮ V DNA (POŠKOZENÍ MOLEKUL DNA) - NEJHORŠÍ Z HLEDISKA POŠKOZENÍ PRO BUŇKU -VYTVÁŘEJÍ SE CHEMICKÉ VAZBY MEZI DVĚMA SOUSEDNÍMI PYRIMIDINY - NESCHOPNOST PYRIMIDINŮ VÁZAT SE S KOMPLEMENTÁRNÍMI BÁZEMI V PROTILEHLÉM VLÁKNU - VZNIK MUTACÍ

Co jsou to lipozomy

Uměle Membránové váčky s dutinou - obě vrstvy bio membrány - cílený trans port molekul dovnitř buňky - častá metoda

Typy transportům podle počtu transportovaných molekul+ Vysvětli

Uniport - jeden typ molekuly Antiport - jedna částice je transportované jedním směrem a pak teprve může být transportované druhá částice v opačném směru Symport - pomocí jedné přinášetčové bílkoviny jsou přenášeny dvě částice stejným směrem

Popiš enzym urátoxidáza

Urát oxidáza je lokalizována hlavně v játrech, kde u mnoha tvoří velké elektronově husté krystalické jádro peroxisomy

Čím je určena orientace mikrofibril ve struktuře celulózy

Určena drahami pohybu komplexů CESA membráně - drahy patrně determinovány směrem mikrotubulů pod membránou Směr celulózových vláken v každé vrstvě = směr mikrotubulů pod plazmatickou membránou

Z jakého důvodu po ukončení půjčení váček plášť ztrácí

Usnadnění následné fúze s membránou cílové organely

Kde se syntetizuje další stěnový materiál

Uvnitř buňky - na buněčný povrch transport pomocí exocytózy

Jak vznikají peroxisomy

Uvolněním (derivací) z ER

Kdy dochází k třídění proteinů

V Průběhu nebo po dokončení jejich syntézy -> Posttranslační transport -> Kotranslační transport

V jaké fázi mitózy dochází k přerušení spojení mezi sesterskými chromatidami + jaké enzymy toto přerušení zajišťují- co toto odpojení umožňuje

V anafázi - proteolytické enzymy Odpojení umožňuje chromozomů pohybovat se směrem k pólu Vřeténka

V čem se liší eukaryotické RNA-polymerázy od prokáryotických

V dvou aspektech - PRO INICIACI TRANSKRIPCE NEVYŽADUJÍ FAKTOR SIGMA, ALE VÍCE PROTEINŮ - TZV. OBECNÉ TRANSKRIPČNÍ PROTEINY − MUSÍ BÝT SCHOPNY ZAJISTIT TRANSKRIPCI DNA USPOŘÁDANÉ V CHROMATINU

V jádrech jakých buněk se protein Rb hojně vyskytuje

V jádrech zdravých buněk všech obratlovců

Co se děje v metafázi meiózy II

V každé z buněk se chromozomy seřazují v ekvatoriální rovině

Co se děje v anafázy meiózy II

V každé z buněk se oddělují sesterské chromatidy a pohybují se k opačným pólům buňky.

V jakých fázích může být cyklus v případě potřeby pozastaven

V kontrolních bodech- Posloupnost vážím musí být zachována, i když se některá z nich protáhne

Kde probíhá lokalizace respiračního řetězce v mitochondriích

V membráně mitochondrií

Popiš strukturu mikrotubulu

V mikrotubulu po obvodu 13 protofilament (= Vlákno Polymerizovaného tubulinu) Pravidelné střídání A a B podjednotky v každém protofilamentu Jednotlivá protofilamenta jsou vůči sobě lehce pootočená - spirála

Kde v jakých místech je zahájena replikace DNA

V místě ori - replikačních počátcích (origins)

V jakém stavu jsou za normálních okolností v bance kaspázy + jak se tento stav nazývá

V neaktivním stavu = takzvané prokaspázy

V jaké fázi profáze meiózy I probíhá crossing-over a co to je

V pachytene Bivalenty během dlouhé profáze umožňují genetickou rekombinaci, při které může být část maternální chromatidy zaměněna sodpovídajícím fragmentem homologní paternální chromatidy

Kde jsou v buňce v průběhu buněčného cyklu přítomný proteinkinázy

V průběhu celého cyklu - jsou však aktivovány pouze v určité době cyklu a poté jsou opět rychle deaktivovány Aktivita těchto kináz tedy vzrůstá a klesá cyklickým způsobem

V jakém vztahu musí být procesy apoptózy a Proliferace aby nedocházelo k patologickým projevům

V rovnováze

Kde najdeme keratiny I. a druhé třídy = IF A jakej jsou s nimi asociované protein i

V různých epitelech FILAGRIN, PLECTIN, DERMOPLAKIN

Taky předchůdce buněk se označuje jako protobiont

V určité fázi RNA došlo pravděpodobně k uzavření RNA do uzavřené částice, oddělené od okolního prostředí membránou - Protobiont

Co se děje ve druhé fázi fotosyntézy

VE DRUHÉ FÁZI JE ENERGIE FOTONŮ ZACHYCENA AKTIVOVANÝMI PŘENAŠEČI ATP/NADPH ZA SOUČASNÉHO UVOLNĚNÍ KYSLÍKU Z MOLEKULY VODY. NÁSLEDNĚ POMOCÍ AKTIVOVANÝCH PŘENAŠEČŮ DOCHÁZÍ K FIXACI UHLÍKU Z CO2 ZA VZNIKU CUKRŮ

Funkce onkogenů

VELMI ROZMANITÉ, KÓDUJÍ RŮZNÉ ELEMENTY PRORŮSTOVÝCH SIGNÁLNÍCH DRAH - RŮSTOVÉ FAKTORY, RECEPTORY, PŘENAŠEČE SIGNÁLŮ, TRANSKRIPČNÍ FAKTORY − NÁDOROVÉ MUTACE FUNKCE ONKOGENŮ POSILUJÍ

Jaké molekuly nemohou póry přecházet bez signálu

VĚTŠÍ MOLEKULY A MAKROMOLEKULÁRNÍ KOMPLEXY

Jsou homologní chromozomy ve většině buněk na sobě závislé nebo ne

Ve většině buněk se chovají jako zcela nezávislé chromozomy

Charakterizuj eubakterie (velikost + stavba)

Velikost 1-10mikrometrů KLASICKÁ STAVBA PROKARYONTNÍ BUŇKY - PROKARYONTNÍ JÁDRO (KRUHOVITÁ DS DNA UCHYCENÁ K MEMBRÁNĚ) PLAZMIDY RIBOSOMY INKLUZE MESOZOMY BUNĚČNÁ STĚNA NA POVRCHU BIČÍKY NEBO FIMBRIE

Co vytváří vinutí v dvoušroubovici

Velký a malý žlábek

Jaké buňky jsou nejméně odolné vůči vystavení nízkým teplotám

Velký obsah vody - živočišné buňky

Popiš strukturu jaderného pórů

Velký počet proteinových vláken na obou stranách pórů Vlákna neomezují průchod

Čemu je podobná pohybová funkce myosinu a tropomyosinu+ popiš

Velmi podobná kinesinům a dyneinům - 3 vazebné domény ( 2 na AF a 1 na transportovanou strukturu)- konformační změna v důsledku štěpení ATP

Co je to virion a viroid

Virion je základní částice viru schopná infikovat hostitelskou buňku Viroidy jsou INFEKČNÍ KRUHOVITÉ MOLEKULY RNA - HOSTITELI JSOU ROSTLINY

Co je nutné k vizualizaci cytoskeletu

Vizualizační zásah Jednotlivé části cytoskeletu nelze nabarvit zvlášť pro mikroskopy V světelném poli - Pro tento typ mikroskopie neexistují žádná barviva která by komponenty označila

Čím je tvořen jaderný skelet

Vlákna jsou tvořena matrixinem (matricinem) a sekundárními proteiny matrix Jadérkový skelet - stavební protein nukleolin Fibrózní vrstva / lamela (nuclear lamina) je připojena k vnitřní straně jaderného obalu

Jakými dvěma způsoby je spouštěna Apoptóza

Vnitřní nebo vnější drahou- V některých buňkách musí být aktivovaný obě, v některých stačí aktivovaná pouze jedna Obě dráhy se sejdou aktivováním exekutivních kaspas 3, 7 a 6 a pak proběhne apoptóza

Jaká membrána jádra je složením velmi podobná membráně ER

Vnější - přichází v ni

Popiš dvě bio membrány jadra euk. b.

Vnější membrána - pokračování ER Vnitřní membrána -interakce s Chromatinem a s jadernou lamino

Popiš Mikrotubuly + průměr

Vybíhají od středu buňky z míst, kde se nachází buněčné jádro, jako dlouhá vlákna směřující k periferii buňky - jejich hustota se směrem od středu k okrajům snižuje

Charakteristická vlastnost GAG a Od nich odvozených proteoglykanů

Vysoce hydrofilní molekuly - vážou na sebe značné množství vody a zajišťují tak nezbytnou hydrataci tkání Tvorba viskózní ho hydratovaného gelu - vznik vodíkových můstku

Fyzikální stresy

Vysoká teplota Nízká teplota Viditelné světlo UV záření Ionizující vaření Mechanický stres (mikromanipulace)

Co vytvářejí MreB, MbI a MreBH

Vytvářejí dvojitá filamenta (paralelní nebo helikální) lokalizovaná v blízkosti plazmatické membrány

K čemu dochází při polymerizaci AF ve vedoucím řetězci + funkce

Vytváření filopodií = tenké ví běžky vyztužené paralelními svazky AF - struktury, jimiž si buňka při pohybu "osahává" terén

Že je využití fúze byla udělena Nobelova cena

Využití fúze buněk k průkazu fluidity membrán - fúzovali myší a lidskou buňku

Za jakých důvodů probíhá Autofagie

Využití vnitřních rezerv pro získání energie nebo stavebního materiálu

Co se děje když je Apoptóza v normálu a je zvýšená Proliferace

Vznik neoplasie

Co je to aminoacyl-tRNA

Vzniklý ester spojením karboxylové skupiny aminokyseliny a 3' OH konce tRNA (=aatRNA)

Co je to Replikační bublina

Vzniká po rozvolnění DNA v místě ori bohatém na AT se templatové řetězce oddělují

Co je to pyrofosfát a kdy vzniká

Vzniká především při štěpení ATP ligázami (např . Aminoacyl-tRNA-ligasy) Ale také při replikaci a transkripce kdy se z nukleosidtrifosfátů odštěpuje difosfát a nukleosidmonofosfát se začleňuje do rostoucí nukleové kyseliny

kde vzniká replikační vidlice

Vzniká v místě ori - tvar Y

Jak vzniká jaderný obal v Telofázi

Váčky jaderné membrány se nejprve shlukují kolem jednotlivých chromozomů a později fúzují za vzniku jaderného obalu

Podstata integrací signálů v buňkách

Výměna informací mezi drahami

U koho se typicky vyskytuje kortex (= Membránový skelet)

Výskyt typicky u živočišných buněk, protože chybí BS Vnitřní strana plazmatické membrány na povrchu buněk (zejména živočišné buňky)

Co umožňuje amplifikace signálu

Významnou odpověď uvnitř buňky i přes nízkou koncentraci ligandu, buňka je pak schopná reagovat i na malé změny v okolí

Stabilita aktinových filament

Většina aktinových vláken je jako Mikrotubuly - nestabilní, mohu však vytvářet stabilní struktury

Většina jakých proteinů má adresovou sekvenci

Většina proteinů určených mimo cytosol Celkově proteiny syntetizované na volných ribozomech

Charakterizuj Membránové struktury u sinic

Větší množství membránových struktur - Fotosyntetické membrány - > cyanosomy - plynové vezikly - Membránové organely nacházející se v cytoplazmě

Pro jaké molekuly Biomembrána nepropustná + co je potřeba aby mohli projít takové látky biomembránou

Větší nenabité polární molekuly ( AMK, glukóza, nukleotidy) - nutné aktivní transportní mechanismy 7 Ionty - Vytvoření iontový ch kanálku na průchod

Co bylo začleněno do syntetického genomu MYCOPLASMA MYCOIDES JCVI- SYN01

Watermarks - vodoznaky: − VYSVĚTLENÍ POUŽITÉHO KÓDOVACÍHO SYSTÉMU − URL ADRESA PRO TY, KDO ROZLUŠTÍ KÓD − SEZNAM 46 AUTORŮ A SPOLUPRACOVNÍKŮ − SÉRIE SLAVNÝCH CITÁTŮ (JAMES JOYCE, RICHARD FEYNMAN...)

Z jaké aminokyseliny vzniká oxid dusnatý

Z argininu

Z čeho vzniká mitotiké vřeténko

Z mikrotubulů a dalších proteinů

Jaké buňky se vyvinuly všechny buněčné formy života

Z pra-buňky - ancestor cell

Co je to enkapsulace

Z roztoku organických sloučenin lze tedy připravit částice, které obsahují v sobě uzavřené nějaké organické molekuly

Čím se zabývá buněčná patologie

ZABÝVÁ SE STUDIEM VLIVU STRESOVÝCH FAKTORŮ NA BUŇKY

Popiš průběh Vezikulárního transportu a co ho zajišťuje

ZAJIŠTĚN VÁČKY, KTERÉ PUČÍ Z MEMBRÁN A ZASE S NIMI FÚZUJÍ (MŮŽOU FÚZOVAT S MEMBRÁNOU JINÉ ORGANELY, NEŽ ZE KTERÉ VYPUČILY)

Charakterizuj chemii buňky

ZALOŽENA NA SLOUČENINÁCH UHLÍKU A CHEMICKÝCH REAKCÍCH, KTERÉ PROBÍHAJÍ VE VODNÉM PROSTŘEDÍ A V ÚZKÉM ROZMEZÍ TEPLOT VE VELKÉ MÍŘE JSOU V NÍ ZASTOUPENY VELKÉ POLYMERY - MOLEKULY SLOŽENÉ Z MNOHA NAVZÁJEM POSPOJOVANÝCH PODJEDNOTEK KOMPLEXNOST - NEJJEDNODUŠŠÍ BUŇKA JE VELMI SLOŽITÝ CHEMICKÝ SYSTÉM JE PŘÍSNĚ REGULOVÁNA - BUŇKY DISPONUJÍ ŘADOU MECHANISMŮ PRO ZAJIŠTĚNÍ SPRÁVNÉ RYCHLOSTI CHEMICKÝCH REAKCÍ VE SPRÁVNÉM MÍSTĚ A ČASE

Popiš iniciaci translace u eukaryot

ZAPOJENO NĚKOLIK ROZPUSTNÝCH INICIAČNÍCH FAKTORŮ INICIAČNÍ KOMPLEX SE TVOŘÍ NA 5' KONCI MRNA ZA ÚČASTI 5'-ČEPIČKY INICIAČNÍ KOMPLEX ZKOUMÁ MRNA OD 5' KONCE A HLEDÁ INICIAČNÍ KODON AUG (KÓDUJÍCÍ METIONIN) TRANSLACE ZAČÍNÁ PRVNÍM AUG OD 5' KONCE MRNA

Jaké buňky zasahují nespecifické stresové faktory + příklady takových faktorů+ důsledky

ZASAHUJÍ VŠECHNY BUŇKY A MOLEKULY BEZ OHLEDU NA TO O JAKOU KONKRÉTNÍ MOLEKULU SE JEDNÁ VÝRAZNÉ SNÍŽENÍ TEPLOTY, TĚŽKÉ KOVY, ALDEHYDY ,DENATURACE PROTEINŮ - BUŇKA PŘESTÁVÁ BÝT SCHOPNA FUNGOVAT - NEFUNGUJÍ BIOMEMBRÁNY, CYTOSKELET (TRANSPORT I MORFOLOGIE), METABOLISMUS- NENÁVRATNÉ POŠKOZENÍ BUŇKY

Co obsahují apoptická tělíska + pomocí čeho se děje rozpad buňky na Apoptická tělíska během exekutivní fáze apoptózy

ZBYTKY JÁDRA, ORGANELY A ČÁSTI CYTOPLAZMY - ROZPAD SE DĚJE POMOCÍ NOVĚ FORMOVANÉ AKTINOVÉ 3D STRUKTURY A NESVALOVÉHO MYOSINU

Jak rostou uvolněné Peroxizomy

ZVĚTŠOVÁNÍ MEMBRÁNY INZERCÍ LIPIDŮ A PROTEINŮ Z CYTOPLAZMY → NÍZKÝ STUPEŇ AUTOREPRODUKCE

Zajišťují adhezivní Glykoproteiny v ECM

Zajištění interakcí složek Mají na sobě napojené cukerné zbytky a několik vazebných domen - možnost interagovat s transmembránovými proteiny buněk tvořících tkáň a S určitou komponentou ECM

Co určuje trojrozměrná struktura proteinů (DNA)

Zajišťuje funkci proteinů

Na čem je založen princip svalové kontrakce

Založena na konformační změně myosinů Tahu svalové buňky je dosahováno současným zkracováním všech sarkomery v důsledku posuvu aktinových vláken - tento pohyb je vyvolán hlavičkami myozinvých molekul, Které trčí ze strany mi ozvi nového vlákna a interagují s aktinovými vlákny Když je sval stimulován ke vztahu, mi ozvi nové hlavičky se začínají posunovat po aktinovém filamentu opakovaných cyklech připojení a odpojení Důsledkem je vzájemný posun aktinových a my asi nových vláken a stah sarkomery

Popiš receptor pro SRP + Kde se nachází

Zanořen v mémbráně ER Přitahuje komplex Ribozom - peptid -SRP k membráně ER

S replikovaný chromozomy se během mitózy seřadí v metafázní destičce náhodně nebo podle systému

Zcela náhodně

Co bylo otázkou která zůstávala při uvědomnění si že Nukleové kyseliny jsou schopné fungovat jako templáty pro svou vlastní syntézu a proteiny ne + Kdy přišlo rozřešení a jaké

Zda byla dříve Nukleová kyselina nebo protein Proteiny mají katalytické vlastnosti a jsou tedy nutné pro katalýzu vzniku nukleové kyseliny. Na druhou stranu může však protein vzniknout pouze díky zakódování jeho struktury v podobě nukleové kyseliny. Rozřešení přišlo v 80. letech v podobě teorie tzv. „RNA světu".

Jak získáváme z monomerů buněčných polymerů zdroje energie

Zdroje energie uvolňované jejich štěpením na menší molekuly, které se zapojují do metabolismu

Typy barviv pro mikroskopii v tmavém poli

Zelené - fluorochromy Červené - rhodamin Modré - kumarin

Typy rychlých signálních drah

Změna buněčného pohybu, sekrece nebo metabolismu- Nepotřebuji jaderný aparát a proto probíhají mnohem rychleji

Popiš princip pohybu kinocílií

Změna konformace dyneinových ramen - jednotlivé do platy se vůči sobě prostorově posunou(po rozštěpení ATP) - K této změně dochází Cyklický po obvodu kinocilie (- nedochází k posunu už všech dupletů naráz, Ale pohyb se posunuje po obvodu kinocilie) - Roztočení bičíku a umožnění pohybu buňky

jak probíhá konformace Přenášených molekul přes jaderný pór

Změna konformace přinášených molekul není vyžadována

Jakým způsobem se reguluje CAM

Změnou lokalizace CAM MEMBRÁNA - EXOCYTÓZA VEZIKLŮ NA POVRCHU BUŇKY VEZIKLY - UCHOVÁVÁNÍ CAM, KDYŽ NENÍ NUTNOST BUNĚČNÉ INTERAKCE

Charakterizuj endocytické dráhy

Způsob příjmu kapaliny spolu s molekulami z vnějšího prostředí Pro malé molekuly využívají všechny eukaryotické buňky Příjem velkých částic nebo celých buněk zajišťují specializované fagocytické buňky

Co je to mesozom

Zvláštní typ vchlípeniny z cytoplazmatické membrány bakterií Má Kubíčkovi tý tvar a vybíhá do cytoplazmy Jsme tu sami se vyskytují hlavně poblíž oblasti, kde se při dělení buňky tvoří přepážka

Pomalé signální drahy příklady

Zvýšený buněčný růst a dělení, zahrnují změny v genové exprese a syntézu nových proteinu - proto probíhají poměrně pomalu

Na čem je závislá aktivita regulačních proteinů BC

Závislé na stupni fosforylace- Fosforylační reakce regulují buněčný cyklus

Popiš Membránové protein i které se přenášejí z cytosolu do ER

Zůstávají zanořeny v mémbráně ER - (Transmembránové proteiny ER , Jiných organel nebo plazmatické membrány)- Už navždy zůstávají membránovými proteiny

Co je to aneuploidie

absence nebo naopak nadbytek chromozomů ve všech buňkách určitého organizmu

Kde jsou nejčastější cílové enzymy G proteinů + co dělají + S čím je v obou případech spřažena aktivace receptoru

adenylátcykláza (tvorba cAMP) fosfolipáza C (tvorba inositoltrifosfátu a diacylglycerolu) V obou případech je aktivace receptoru spřažena s tvorbou malých signálních molekul, které rychle a ve velkém počtu vznikají a snadno difundují cytosolem k efektorům

Průběh apoptózy vyvolané vnějšími signály

aktivační molekuly (death activators) se napojují na specifické receptory v plazmatické membráně (death receptors)

Co aktivuje protein Ras po kontaktu s receptorem pomocí adaptéru+ Funkce této kaskády

aktivuje kinázovou signální kaskádu zajišťující změnu genové exprese, která buňku přivádí k aktivní proliferaci

Funkce cyklinů S

aktivují Cdk po průchodu bodem restrikce a pomáhají duplikaci chromozomů, hladina S fázových cyklinů zůstává zvýšena až do mitózy, protože tyto cykliny přispívají k řízení některých procesů rané mitózy

Funkce cyklinů G1/S

aktivují Cdk v pozdní G1, napomáhají překonání bodu restrikce, jejich hladina klesá na začátku fáze S

Funkce cyklinů M

aktivují Cdk, které stimulují vstup do mitózy po průchodu kontrolním bodem G2/M. Ve střední části fáze M jsou degradovány

Co je inhibitorem syntézy Nukleotidů

azaserin, C-merkaptopurin

Jaký inhibitory zajišťují odpojení syntézy ATP od fosforylace - inhibitory energetického metabolismu

benzimidazol, 2,4-dinitrofenol

Charakterizuj receptory typu iontových kanálku

bez enzymové aktivity • vazbou ligandu ovlivňují průchodnost membránových kanálků - změna permeability - změna toku iontů

Charakterizuj receptory napojené na protein G

bez enzymové aktivity • řídí aktivitu enzymů nebo průchodnost kanálků prostřednictvím membránového proteinu G („GTP-binding regulatory protein")

Jakého důvodu byl vznik prvních protobiontů důležitý

budoucích buněk se označuje jako protobiont. Vznik prvních protobiontů byl evolučně velmi důležitý - pokud se uvnitř tohoto útvaru nacházel například určitý důležitý enzym, byl tento kompartment evolučně zvýhodněný a docházelo k selekci.

Jak se dostávají proteiny do organel

buď přímo z cytozolu (mitochondrie, chloroplasty, peroxizomy, vnitřek buněčného jádra) nepřímo přes endoplazmatické retikulum (Golgiho aparát, lyzozomy, endozomy, jaderná membrána)

Povrchy buněk u jednotlivych organismů

buněčná stěna (bakterie, sinice, rostliny, houby) glykokalyx (živočichové)

Z jakého důvodu je potřebná kompartmentalizace v buňce

buňkách probíhá mnoho protichůdných chemických reakcí a jejich oddělení zabrání chaosu

Co produkuje složky ECM

buňky příslušné tkáně produkují složky ECM intracelulárně a vylučují je exocytózou

Charakterizuj mutaci zvyšující aktivitu Ras + V kolika případech rakoviny je tahle mutace identifikována

buňka reaguje stejně, jakoby byla neustále stimulována růstovým faktorem • mutace v genech ras identifikovány v cca 30% případů rakoviny

Charakterizuj mutaci zvyšující aktivitu Ras V kolika procentech případů rakoviny jsou mutace v genech Ras identifikovány

buňka reaguje stejně, jakoby byla neustále stimulována růstovým faktorem • mutace v genech ras identifikovány v cca 30% případů rakoviny

Jaký enzym katalyzuje syntézu celulózy

celulóza syntáza (CESA), který je součástí membrány rostlinné buňky. Je to velký komplex, který zároveň syntetizuje vždy 36 vláken. Ty se okamžitě spojují do kompaktní mikrofibrily a vytváří vazby s buněčnou stěnou. TRANSPORT SACHARIDOVÝCH MONOMERŮ PŘES MEMBRÁNU, ZAČLEŇOVÁNÍ V MÍSTĚ PŘICHYCENÍ K PLAZMATICKÉ MEMBRÁNĚ

Charakterizuj strukturu receptorů pro G- Proteinovou signalizaci

charakteristická struktura: jediný polypeptidový řetězec procházející dvojvrstvou membrány 7x

Co blokuje posun m-RNA

chloramfenikol

Popiš leptotene fázy meiózy I

chromozomy, z nichž každý je tvořen dvěma chromatidami, se začínají kondenzovat

Co způsobuje inhibici peptidyltransferázy

cykloheximid

Jaký inhibitor inhibují polymeraci aktinových filament

cytochalasiny, latrunculin

Jak se nazývají místa lokalizace desmozomů a kde se nachází

cytoplazmatické plaky (vnitřní strana plazmatické membrány)

Co se předpokládá že se v době RNA světa vyvinulo

další typy RNA (tRNA, rRNA, snRNA, snoRNA, siRNA, miRNA,...). Teprve po vzniku RNA došlo ke vzniku DNA, která je stabilnější a RNA postupně ztratila primární funkci genetického materiálu (kromě RNA virů). Předpokládá se, že v rámci RNA světa vznikly první procesy proteosyntézy, což představuje základ budoucí tvorby buněk.

Co detekuje klasická fluorescenční mikroskopie při znázorňování a vizualizaci cytoskeletu

detekuje fluorescenční barviva používaná pro barvení buněk Obarvené předměty se jeví jako jasně zářící objekty na temném pozadí (Dark Field)

Příklady fotodynamických barviv

eosin, fluorescein, akridin, chlorofyl, porfyriny...

Příklady proteinů spojující aktinová vlákna - proteiny asociované s aktinem + co zajišťují

filamin, ABP, gelactin, villin, fimbrin, fascin, alfa- aktinin - například do podoby stresových vláken

Jaký typ fosfolipázy mohou aktivovat G proteiny + Jak tato fosfolipáza působí- Vysvětli celý proces

fosfolipáza C působí na membránový inositolový fosfolipid: odštěpí hydrofilní hlavičku: vzniká cukerný inositoltrifosfát a lipidový diacylglycerol IP3 difunduje cytosolem k ER: otevře kanály v membráně ER, kterými proudí Ca2+ do cytosolu Ca2+ stejně jako diacylglycerol aktivuje Proteinkinázu C Kina zace fosforyluje své substráty

Co je podmínkou aktivity MPF u kvasinek S.cerevisiae - Konkrétní typ proteinu

fosforylace Thr-161 proteinu Cdc2 a defosforylace Thr-14 a Tyr-15 proteinu Cdc2

Co slouží jako místo vazby vnitrobuněčných signálních proteinů

fosforylované tyroziny spolu se sousedními aminokyselinami

Příklady proteinů schopné štěpit aktinová vlákna - proteiny asociované s aktinem + co umožňují

gelsolin, brevin - rozštěpení vlákna kdekoli uprostřed (Depolymerizace probíhá od konce)

co oxid dusnatý obvykle aktivuje v buňkách + co tento enzym dělá

guanylátcyklázu, která katalyzuje tvorbu cyklického GMP cGMP Aktivuje různé efektory

Jak jinak nazýváme pre-mRNA u eukaryot

hnRNA = heterogenní RNA

Kdo objevil koacerváty + při jakém pokusu

holandský biochemik H.G.Bungenberg de Jong v pokusu interakce proteinu (želatiny) s arabskou gumou.

Z jakých částí se skládá postup frakcionizace

homogenizace buňky a purifikace složek

Popiš pachytene fázi meiózy I

homologické chromozomy jsou zcela spárovány

Co se děje v diplotene meiózy I

homologické chromozomy se oddělují s výjimkou chiasmat

Co se děje v zygotene v meióze I

homologické chromozomy se začínají párovat

Charakterizuj Steroidní a thyroidní

hydrofobní a nízkomolekulární • procházejí membránou • vážou se na receptory v cytosolu nebo jádře • jejich receptory fungují jako regulátory genové exprese závislé na ligandech • vazba ligandu - změna konformace receptoru - změna schopnosti vazby DNA nebo aktivace exprese cílových genů

Dvě hypotézy jak mohl vzniknout protobiont

hypotéza „biopolymer first" (nejprve biopolymery) - nejprve vznikly funkční biopolymery, které interagovaly a došlo k obalení lipidovou dvojvrstvou (obalení bylo až po vzniku biopolymeru) hypotéza „lipid world" (svět lipidů) - postupným samosestavováním lipidových molekul vznikaly útvary, které byly předchůdci budoucích membránových útvarů (polymerizace byla až po vzniku obalu). Tato hypotéza není tak uznávaná, protože by muselo docházet k velmi složité a koordinované interakci mezi lipidy a polymery.

Jaký typ enzymu katalyzuje tvorbu cAMP + z Čeho tahle molekula vzniká

inducibilní adenylátcykláza katalyzuje tvorbu cAMP z ATP

Funkce RNA

informační - nese informaci o struktuře proteinů (sekvence nukleotidů) funkční - je schopná tvořit sekundární a terciární strukturu pomocí párování bází

Kolik druhů kaspáz existuje u člověka + které jsou iniciačních a které efektorové

iniciační (8, 9, 10 a 12) efektorové (3, 6 a 7)

4 rodiny CAM+ interakci čeho zajišťují

integriny (buňka - ECM) kadheriny (buňka - buňka) =2 hlavní selektiny ICAMs (imunoglobulin-like CAMs)

Co slouží jako základní ochrana živočišné buňky proti mechanickému stresu

intermediární filamenta (odolnost vůči mechanickým vlivům)

Jak pravděpodobně vznikl Membránový obal jádra+ vznik jaké organely se tímto procesem dá vysvětlit

invaginací - vchlípením plazmatické membrány, která postupně obklopila DNA materiál uvnitř buňky. Tímto způsobem se dá vysvětlit i vznik endoplazmatického retikula.

Jaké jsou cíle G proteinů

iontové kanály membránové enzymy zodpovědné za tvorbu sekundárních přenašečů

Co se stane když signál přechodně otevře Kanálky pro Ca2+

ionty Ca2+ rychle proudí do cytosolu a aktivují zde proteiny, které jsou na Ca2+ citlivé

Principy přenosu signálu

jedna molekula může přijímat signál z různých drah a integrovat jej,před jeho odesláním dále • signál se může větvit a šířit z jedné před jeho odesláním dále dráhy do jiné („spread") • signál se může ukotvit do určité molekuly a imobilizovat se tak („anchor") • signál může být ovlivněn jinými proteiny (např. inhibitory), které ovlivní jeho působení na efektory („modulate")

Co jsou to xenobiotika

jedy sloučeniny, které v buňce vyvolávají toxický šok principem interakce s cílovou molekulou- následkem je změna cílové molekuly (struktury, konformace, fungování,..) nespecifický (aldehydy, těžké kovy,..) a specifický účinek- schopnost vázat se na jednu cílovou molekulu a blokovat jeden konkrétní biologický děj

Kam jsou buňkami uvolňovány parakrinní signály

jsou buňkami uvolňovány do extracelulárního media v sousedství těchto buněk a působí lokálně. Stejný signál dostávají zároveň sousední buňky

Charakterizuj synaptické signály živočišných buněk

jsou přenášeny podél axonu cílové buňky. Na konci axonu se uvolní chemický Přenašeč, který signál dále šíří př. acetylcholin Je hydrofilní povahy a účastní se jí povrchové receptory

Co je to nekróza

katastrofická smrt buňky indukovaná nespecifickým zásahem

Co říká biogenní zákon a kdo ho vymyslel + cca kdy+ latinsky

každá buňka vzniká pouze z buňky (Omnis cellula e cellula) 19. století - Virchow

Také inhibitory inhibují polymerací mikrotubulů - Dynamika cytoskeletu

kolchicin, vinca-alkaloidy (vinkristin, vinblastin)

Jaký mají Vliv G proteiny na Membránové enzymy

komplexnější důsledky - tvorba dalších nitrobuněčných signálů

Pro řízení aktivity jakých komplexu cyklin-Cdk kočka v jaký fázi se využívají především CKI

komplexů cyklin-Cdk fází G1/S a S

Charakterizují rozdíl koncentrace Ca2+ iontů v buňkách

koncentrace v cytosolu je výrazně nižší než v mimobuněčném prostoru a endoplazmatickém retikulu

Struktura mezerového spoje - jaké molekuly

konexiny (6 molekul) → konexon

Co umožňuje konfokální mikroskop při znázorňování cytoskeletu

konfokální mikroskop umožňuje odstranit z obrazu objektu šum, který vytváří světlo nebo fluorescence emitovaná z těch rovin vzorku, na které není zaostřena optika Pomocí počítačů vyřízené ho posunu se v rámci jedné buňky pořizuje několik 1000 snímků v různých rovinách ostrosti - posun roviny ostrosti ve velmi malých intervalech - softwarové seskládání výsledného ostrého snímku

Jaký jiný organismus mimo rostliny má životní cyklus v podobě střídání diploidní a haploidní fáze

kvasinka Saccharomyces cerevisiae

Co tvoří hlavní výplňovou komponentů hyaluronany

kyselina glukuronová + b(1,3)-N- acetylglukosamin (až 50 000 disacharidů v 1 molekule) - PRAVIDELNÉ STŘÍDÁNÍ SACHARIDŮ (DISACHARID VŽDY Z JEDNÉ MOLEKULY KYS. GLUKURONOVÉ A ACETYLGLUKOSAMINU)

4 nejčastější typy glykoproteinů + co popřípadě zajišťují

laminin fibronektin => tyto dva nejdůležitější tenascin (antiadhezivní vlastnosti, nádorové buňky - metastázování) fibrinogen (agregace trombocytů- při tvorbě krevních sraženin)

Jaké máme typy Autofagie

makroautofagie mikroautofagie chaperon-mediated autofagie (CMA)

Co jsou to koacerváty

malé kapky organických molekul (většinou lipidy) o velikosti 1-100μm • JE MOŽNO VYTVÁŘET JE UMĚLE -

Co je to desmotubulus

membránová trubice derivovaná z ER, procházející spojem

Dvě hypotézy jak se vyvíjel metabolismus protobionta

metabolity byly k dispozici v okolním prostředí a byly nějakým způsobem přenášeny dovnitř pomocí nově vzniklých metabolických enzymů v okolí byl přítomen pouze jeden metabolit a z toho se metabolickými drahami uvnitř protobionta vyvíjely další metabolity

Typy chromozomů podle umístění centromery

metacentrický chromozom - centromera je umístěna zhruba uprostřed (dělí chromatidy na dvě zhruba stejně dlouhá ramena) submetacentrický chromozom - centromera je výrazněji posunuta směrem ke konci jednoho z ramen akrocentrický - centromera dělí chromatidy na jedno rameno velké a jedno malé uzlovité telocentrický - centromera je umístěna u oblasti telomer a chromozom se jeví jako jednoramenný

Důsledky teplotního šoku buněk - vysoká teplota

měna terciární konformace proteinů → narušení funkce proteinů poruchy koordinace metabolických drah (teplotní optimum pro jednotlivé enzymy) dezorganizace struktury biomembrán depolymerace cytoskeletálních struktur (mikrotubuly)

Charakterizují imunofluorescenci

mikroskopická analýza buněčných a tkáňových struktur pomocí protilátek značených fluoreskujícími látkami - znázornění cytoskeletu Vnášení fluorochromu, který je založený na principu imunitní reakce

Popiš signalizaci povrchovými receptory - signální kaskády

mimobuněčný signál povrchový receptor Sekundární přenašeč Cílová molekula (efektor)

Co je inhibitorem příčné vazby v DNA- Inhibitor syntézy biopolymerů

mitomycin C Alkyluje DNA Což vede k jejímu poškození - buňka s poškozenou DNA Se nemůže dělit dál a umírá

Co jsou to chiasmata

místo, kde dochází k výměně genetického materiálu mezi dvěma homologickými nesesterskými chromatidami během crossing-overu

Popiš myoziny jakožto proteiny asociované s aktinovými filamenty

molekulární motory, které vážou a hydrolyzují ATP. Myoziny umožňují pohyb, vždy směrem od minus-konce k plus-konci

Z jakých dvou základních předpokladů vychází přirozený výběr

musí existovat genetická variabilita - musí existovat rozdíly mezi genetickou výbavou jednotlivých forem života genetická variabilita umožňuje selekci nejvýhodnějšího genotypu

Jaké bakterie například se účastní intracelulárního parazitismu + K čemu vybavení hostitelské buňky využívají

mykoplazmata, rickettsie, chlamydia, Listeria monocytogenes= patogeny- Nemají plně funkční vlastní proteosyntetický aparát Vybavení hostitelské buňky využívají pro rozmnožovaní a přežívání

Co obsahují telomery + Co umožňují

nacházejí se na obou koncích chromozomů. Obsahují repetitivní nukleotidové sekvence, které umožňují replikaci konců chromozomů

Vysvětli pučení virionů

např, uvolňování virionů HIV z T- lymfocytu pučením (zůstává na něm membránový obal z buňky, kterou opustil)

Jaký protein je klíčový regulátor Proliferace + Příklad

např. intracelulární injekce protilátek anti-Ras: ztráta schopnosti receptoru aktivovat buněčnou odpověď na příslušný růstový faktor

Popiš jakým způsobem Arginin/NO ovlivňují cévy U endoteliálních buněk

nervové buňky vyšlou signál - endoteliální buňky produkují NO, který uvolní buňky hladkého svalstva cévních stěn - céva se roztáhne - krev v ní může lépe proudit

Co tvoří Intermediární filamenta VI. třídy (nestin)

neuronální kmenové buňky, nádorově transformované buňky, endotelie

Jakým způsobem funguje lék nitroglycerin + Na co je to lék

nitroglycerin se v těle mění na NO • tím uvolňuje krevní cévy a snižuje zátěž srdce Lék na anginu pectoris

Co je to replikační počátek + Co umožňují

nukleotidová sekvence signalizující začátek duplikace DNA Většina eukaryotních chromozomů obsahuje více replikačních počátků, které umožňují rychlejší replikaci

Nevýhody kompartmentalizace

nutnosti biosyntézy organel, třídění proteinů pro různé destinace, apod.

Co je výsledkem amplifikace signálu

nízká koncentrace ligandu - významná odpověď uvnitř buňky - schopnost reakce na malé změny okolí

Charakterizuj strukturu velkých proteinů G

několik variant, každá je specifická pro určitý okruh receptorů a následných přenašečů signálu hlavní struktura je obdobná u všech: • 3 proteinové podjednotky: α,β,γ • klidový stav: všechny podjednotky pohromadě, k α-podjednotce navázán GDP

Charakterizuj pomalou odpověď na cAMP

odezva během minut až hodin • cAMP aktivuje kinázu A • kináza A fosforyluje proteiny řídící transkripci určitých genů • nově exprimované geny zajistí Změnu chování buňky

Jak se chová receptor pro tyroidní hormony v přítomnosti ligandu

opět se mění na aktivátor transkripce

Jaký specifický inhibitor blokuje funkci Na+/K+ ATPázy

ouabain

Co udržuje kyselé pH lysozomů a jaké PH je uvnitř lysozomů

pH 5 Udržováno pomocí vodíkové pumpy která je poháněna ATP A jdu lysozomu čerpá H+

Co jsou to lamelipodia

panožky, které umožňují améboidní pohyb. Jedná se o dočasné výběžky cytoplazmy

Jaké inhibitory inhibují depolymeraci aktinových filament

phalloidin, jasplakinolid

Funkce cyklinů G1 -BC

podílejí se na řízení aktivity cyklinů G1/S

Popiš dočasnou aktivitu G proteinů

podjednotka α má vnitřní GTPázovou aktivitu, která po určité době (několika sekund) hydrolyzuje GTP na GDP

Co se stane po hydrolýze GTP -> GDP G proteinu

podjednotka α pak obnoví spojení s podjednotkami βγ • signalizace je vypnuta

Co podporuje endosymbiotickou teorii

podobnost mitochondrie, plazmidů a bakterií: - podobná velikost a tvar - obsah DNA, jeho podoba a zpracování - u obou organel je vlastní genom prokaryotního typu - podobné ribozomy - proteosyntéza - obě organely obsahují vlastní proteosyntetický aparát prokaryotního typu (ribozomy prokaryot mají 70S - 30S+50S-(5S a 23S); ribozomy eukaryot mají 80S - 40S+60S) - podobná struktura vnitřní membrány dvojitá membrána- Druhá membrána pochází z plazmatické membrány Eukaryotní buňky, kterou Prokaryotní buňka pronikala - množení dělením

Vysvětlí fosforylační kaskádu aktivovanou Ras

postupná fosforylace/aktivace sledu proteinkináz MAP signál postupuje od membrány k jádru, zesiluje se a rozděluje do různých směrů

Charakterizuj 3 vrstvy buněčné stěny u rostlin

primární CW (tenká) - schopnost zvětšování sekundární CW (pevná) - ztluštění primární CW nebo ukládání nových vrstev pod původní - skládá se z několika vrstev střední lamela- odděluje dvě sousední rostlinné buňky v pletivu od sebe

Popiš dvoustupňovou reakci na Steroidní hormony

primární odpověď - přímá indukce transkripce několika cílových genů sekundární odpověď - aktivace dalších genů, na které se podílejí produkty genů transkribovaných v rámci primární odpovědi

Jaká je typická brzda buněčného + Proč se nazývá zrovna takhle

protein Rb (retinoblastoma protein) = negativní regulátor buněčného cyklu - nádorový supresor Protein Rb byl původně nalezen při studiu dětského očního nádoru retinoblastomu. U postižených dětí protein Rb chybí nebo je defektní.

Dvě konformace G proteinu a co znamenají

proteiny G kolísají mezi konformacemi „zapnuto" (s GTP) a „vypnuto" (s GDP)

Proč je pro anaerobní organismy kyslík toxický

protože dochází k oxidaci jejich struktur

Je předpokládám vznik mitochondrií

před 1.5-2 miliardami let, kdy se na Zemi objevil kyslík v dostatečné koncentraci, aby dokázal negativně působit na anaerobní organizmy

Na čem závisí přežití buněk při vystavení buněk nízké teplotě

přežití buněk závisí na obsahu vody v buňce

Charakterizuj připojení hemidesmozomů

připojení intermediárních filament (IF) k ECM prostřednictvím integrinů

Vysvětli dva typy Imunofluorescence

přímá imunofluorescence - vázání fluorochromů přímo na určité molekuly - protilátka připravená přímo pro strukturu, jež chceme v buňce značit nepřímá imunofluorescence - nejprve se na molekulu nebo strukturu naváže primární protilátka a na ní se přidá komerčně dodávaná sekundární protilátka konjugovaná s fluorescinem = fluorescenčně značená sekundární protilátka (výhodou je vyšší kontrast, nevýhodou je nižší specifita) - objeví se více značek než U přímé - pozorování signál v mikroskopu je silnější

Jak mohou být propojené buňky

přímý kontakt nebo prostřednictvím ECM

Základní rozdíl mezi prokaryotické a eukaryotickou buňkou

přítomnost kompartment a jádra odděleného membránovým obalem.

Co zůsobuje předčasné uvolnění polypeptidu z ribosomů

puromycin- Předčasné ukončení Translace

Čím se zabývá Endosymbiotická teorie + Co říká

původem mitochondrií a plastidů (např. chloroplastů) Podle této teorie byly tyto organely dříve oddělené nezávislé prokaryotické organizmy, které byly pohlceny do buněk a staly se endosymbionty

jak se evolučně vysvětluje vazba ribozomů na ER

původní vazbou ribozomů na plazmatickou membránu.

Funkce signálních kaskád

přenos signálu z receptoru k efektoru • transformace signálu do podoby, která může vyvolat příslušnou odpověď • zesílení a regulace signálu • rozdělení signálu k různým efektorům

Co dělá povrchový receptor

převod mimobuněčného ligandu do podoby nitrobuněčného signálu

Popiš mechanismus funkce receptoru se sedminásobným vinutím membránou

receptor se aktivuje ligandem tuto informaci převede na protein G GDP disociuje z proteinu G a je nahrazen GTP protein G po navázání GTP ovlivní aktivitu důležitých enzymů

Hlavní typy povrchových receptorů

receptory typu iontových kanálků receptory napojené na G-protein receptory vázané na enzym (katalytické receptory)

Úrovně regulací cyklin-dependentních kináz + Míra čeho je určujících pro jednotlivé typy regulace

regulace Cdk interakcí s cykliny - určující je míra syntézy a degradace cyklinů regulace Cdk fosforylací - určující je míra aktivity příslušných kináz a fosfatáz regulace Cdk vazbou inhibitorů (CKI)

Jaké 3 typy specializovaných sekvencí kontrolují základní funkce chromozomů

replikační počátky Centromery Telomery

Co to znamená kompartmentalizace

rozdělení buňky na oddíly uvnitř

Co jsou to fyziologické podmínky

rozmezí hodnot fyzikálních a chemických faktorů, které je kompatibilní pro život biologické soustavy (buňka, organismus...)

Indukce nekrózy

rozsáhlé poškození, při němž už nemohou být aktivovány mechanismy apoptózy působení nespecifických stresových faktorů ▪ změny koncentrace iontů, pH... ▪ vyčerpání zdrojů energie ▪ změny teploty ▪ poškození buňky nebo jejích organel

Rozdělení signálních drah podle rychlosti + v čem se liší

rychlé (<s až min) pomalé (min až h)

Jaký specifický inhibitor reaguje s cholesterolem za rozpadu membrán

saponiny (digitonin), nystatin, amfotericin

Na co rozdělujeme stresové faktory a co je to buněčný stres

situace, kdy je buňka vystavena nekompatibilnímu okolí stresové faktory (fyzikální, chemické, biologické)

Typy aktinových struktur v buňkách

síť aktinových filament v cytoplazmě membránový skelet (buněčný kortex) mikroklky (microvilli) a lamelipodia a filopodia v živočišných buňkách kontraktilní prstence v živočišných buňkách stresová vlákna - silné svazky AF - v ŽB

Co je to anoikis

smrt v důsledku poruch buněčných interakcí

Co se děje v diakinezi

spárované chromozomy se dále kondenzují a připojují se k vláknům dělícího vřeténka

Co jsou to chaperony + funkce

speciální proteiny, které v buňce pomáhají skládat právě vytvořené proteiny Pomáhají vytvořit terciární strukturu proteinů Vážou hydrofobní zbytky polypeptidů a brání agregaci proteinů

Charakterizuj mezerové spoje

spoje mezi buňkami umožňující průchod vody a malých rozpustných molekul "kanálky" o průměru 1,5 nm

Co zajišťují plasmodesmata

spoje mezi rostlinnými buňkami napříč buněčnou stěnou

Charakterizuj těsné spoje

spojení sousedních buněk v epitelu, obvykle v blízkosti apikální strany účelem zabránit průchodu molekul mezi buňkami

Funkce G-proteinů

spojovací články mezi povrchovými receptory a producenty sekundárních přenašečů interagují pouze s aktivovanými receptory výměna GDP na podjednotce α za GTP

Co stimulují mitogeny

stimulují buněčné dělení tím, že překonávají přirozené brzdící mechanizmy buněčného cyklu

Cesty mluví růstové faktury

stimulují růst buněk vedoucí k navýšení buněčné hmoty tím, že indukují syntézu a inhibují degradaci proteinů a jiných makromolekul

Popiš jakým způsobem se cAMP Účastní stresové signál

stres: v nadledvinách se uvolní adrenalin a přejde do krve • váže se na receptory spojené s proteinem G (adrenergní receptory) různých buněk • v kosterním svalstvu: stimulace adenylátcyklázy - navýšení cAMP • cAMP aktivuje kinázu A, která fosforyluje enzymy metabolismu glykogenu • aktivuje se mechanismus odbourávání glykogenu na glukózu • zajištění dostatečného množství glukózy pro očekávanou svalovou námahu • signalizace nevede ke změně genové exprese - je relativně rychlá

Kdy se objevily první mnoho buněčné organismy

teprve před 500 miliony let

Co blokuje vazbu AA-tRNA

tetracyklin

Co můžeme najít na plazmatické membráně u sinic

thylakoidy, plynové Měchýřky

Charakterizuj domény buněk které spolu interagují

tkáně, resp. pletiva = buňky + extracelulární matrix (ECM)

Rozdílné účinky acetylcholinu + vysvětlení

tlumící účinek na b. srdečního svalstva stimulace kontrakce b. kosterního svalstva stimulace žláznatých buněk k sekreci Vysvětlení - různé typy receptorů pro stejný signál - odlišná interpretace stejného signálu různými buňkami (odlišnost přenašečů, efektorů, apod.)

Dva hlavní typy G proteinů

trimerní (velké), které se indukují přímou vazbou s receptory monomerní (malé) typu Ras, které interagují s receptory nepřímo prostřednictvím adaptérů všechny proteiny G mohou vázat GTP/GDP a disponují GTPázovou aktivitou

Struktura kolagenu

trojřetězcová helikální struktura superhelix (trihelix)→ kolagenové mikrofibrily → kolagenové fibrily (průměr 10-300 nm, délka v mm) → kolagenová vlákna

Jaký je následek účinek nepřímý ionizujícího záření

tvorba ROS

Co tvoří Intermediární filamenta III. třídy (Vimentin, desmin, GFAP, synemin, peripherin)

tvoří pojivou tkáň, svalové buňky, neuroglie

Co je to mitóza a co je jejím úkolem

typ buněčného dělení, jehož úkolem je zajistit rovnoměrné předání neredukované genetické informace dceřiným buňkám

Kolik procent z celkového množství proteinu usavců tvoří kolagen + kolik genů ho kóduje

u savců 25% z celkového množství proteinů (~20 genů)

Kolik různých typů podjednotek G-proteinů bylo dosud charakterizováno u savců

u savců dosud charakterizováno 20 různých typů podjednotky α, 5 typů podjednotky ß a 6 typů γ Evoluční konzervativnost

Charakterizuj protein kalmodulin- Kolik Ca2+ iontů se musí navázat aby změnil konformaci+ charakterizuj nový tvar kalmodulinu

univerzálně rozšířen • po navázání 4 iontů Ca2+ mění konformaci • nový tvar umožňuje vazbu k mnoha proteinům, čímž se mění jejich aktivita • hlavní cílem kalmodulinu jsou kinázy CaM

Jak je specifické inhibitory inhibují dehydrogenázy

uretan, barbituráty

Řekněme jeho důvodu je výhodná vazba proteoglykanů na povrch migrujících buněk

usnadnění pohybu a proliferace Vibrující buňka - např. Makrofág

Na čem závisí účinek ionizujícího záření

účinek závisí na dávce a druhu záření, na době ozařování a na senzitivitě buňky, resp. tkáně

Jaké specifické inhibitory zvyšují permeabilitu pro ionty

valinomycin, gramicidin A

Popiš desmozomy

vazba na intermediární filamenta (IF) → propojení IF v sousedních buňkách prostřednictvím kadherinů

Charakterizuj receptory váz. na enzym

vazbou ligandu získávají katalytickou schopnost • obvykle transmembránové proteiny s PTK aktivitou

Vysvětli chaperony Hsp70 - funkce

vážou se na hydrofobní části právě syntetizovaných proteinů a stabilizují je v nesbaleném stavu-> proteiny pak snadněji procházejí membránami - stimulují export proteinů z buněk - podílí se na konformaci replikačních komplexů - podporují odbourávání poškozených proteinů

Jak viditelné světlo působí jako stres pro buňky

velmi silná intenzita osvětlení nebo laserový paprsek Za normálních okolností nemá světlo na buňky vliv - relativně malá absorpce cytoplazmou

Jaký následek má rychlost částice na poškození buňky - ionizující záření

větší rychlost částice → menší ionizační hustota → menší poškození buňky

Jednotlivé kroky signalizace zproztředkované povrchovými receptory

vyloučení mimobuněčného signálu (ligandu) detekce signálu povrchovým receptorem předání signálu sekundárním přenašečům (second messenger) příjem signálu cílovou molekulou (efektorem)

Co je to Konjugace u prokaryot

výměna genetického materiálu mezi bakteriemi, nikoliv buněčné dělení Nutnost přítomnosti plazmidu Během procesu Konjugace vytvářejí ví běžky, jimiž se spojí a dojde k výměně replikovaného plazmidu

Popiš průběh nekrózy na úrovni tkáně

vznik nekrotického ložiska → invaze makrofágů → zánětlivá reakce

Co je to blebbing plazmatické membrány

vznik nepravidelných záhybů plazmatické membrány buněk, tzv. blebů, způsobený rozvolněním cytoskeletu (jeho odpojením od membrány)

V době RNA světa mohli existovat jaké dva typy tvorby RNA

zařazování nukleotidů z okolí podle daných pravidel spojování kratších sekvencí RNA z okolí

Na co působí specifické stresové faktory + příklady takových faktorů+ důsledky

záření o určité vlnové délce → absorpce cílovými molekulami nebo specifická reakce na buněčné úrovni specifické inhibitory (antibiotika, cytoskeletální toxiny) → inhibice konkrétního děje v buňce

Druhy ultrafialového záření+ na čem závisí účinek UV záření

závislost účinku na vlnové délce: UVC (200-290 nm) UVB (290-320 nm) UVA (320-400 nm)

Popiš apoptózu vyvolanou vnitřními signály

zdravá buňka exprimuje na vnější membráně mitochondrií protein Bcl-2, vázaný k Apaf-1 při vnitřním poškození buňky protein Bcl-2: ➢uvolní Apaf-1 ➢ přestane zadržovat cytochrom C v mitochondriích -> vzniká apoptosom -> vzniká aktivní kaspáza 8 (inciační) , Která štěpením aktivuje další kaspázy (efektorové)

Vysvětli Green Fluorescent Protein (GFP) + K čemu se používá

zelený fluorescenční protein byl izolovaný z medúzy a jeho zvláštností je, že fluoreskuje zeleně, pokud je vystaven modrému světlu V biochemii a molekulární biologii se často využívá jako reportérový gen pro vizualizaci exprese proteinů, testování lokalizace různých proteinů, atd ( vizualizace cytoskeletu) I jeho deriváty se pro tuto funkci používají Je to jeden z druhu fluorochromu V členění tohoto genu do genomu jiných organismu vedle genu pro nějaký buněčný protein který chceme sledovat

Typy ovlivnění efektoru

změna genové exprese změna aktivity metabolických enzymů změna konfigurace cytoskeletu změna chování buněk (aktivace syntézy DNA, pohyb, diferenciace, smrt)

Ke změně jakého typu struktury proteinů dochází při vystavení buněk vysoké teplotě

změna terciární konformace proteinů → narušení funkce proteinů

Jaké mohou být změny ve funkci napadených buněk+ Co intracelulární parazité napadají v jednotlivých případech

změny metabolismu (využití proteosyntetického aparátu) změny buněčné morfologie (cytoskeletální struktury, cytoplazmatická membrána)- Obalené víry - virus při opouštění hostitelské buňky získává obal s jeho vlastními proteiny změny chování napadené buňky, resp. organismu- typické pro infekci toxoplasmou gondii

Jak působí faktory pro přežívání

zvyšují životaschopnost buněk supresí programované buněčné smrti

Co je to Frakcionizace buněk

získání částí buňky schopných samostatné funkce Používá se pro oddělení organel a makromolekul pro následnou analýzu jejich složení a funkcí

Charakterizuj protein Ras

člen rodiny malých G-proteinů s jedinou podjednotkou • funguje jako molekulový přepínač se dvěma konformačními stavy: aktivním s navázaným GTP a neaktivním s navázaným GDP

Typy kinocílií

Řasinky ( jsou krátké, na povrchu mnoho - např. Plicní epitel) Bičíky (vložit celé buňky, většinou jeden bičík - např. Spermie)- u Živočichů jediná buňka s bičíkem

Popiš levotočivou Z-DNA

Řetězce se nevinnou plynule ale sem a tam (zig-zag) , popsána in vitro Biologická funkce nejasná

Dva typy exocytózy vysvětli

Řízená - probíhá pouze po určitou dobu, jednorázově Konstitutivní - nepřetržitě, probíhá průběžně

Co je zřejmě příčinou toho že existuje mnoho typů RNA

Že RNA Vznikla jako první

Kolik GA obsahuje obvykle živoč. buňka a buňky

Živoč. buňka - a psovi je obvykle 1 Rostlinná buňka - i několik 100

Jaké buňky jsou nejvíce citlivé vůči mechanickému stresu

Živočišné

V jaké poloze je žlábek který se vytváří během Cytokineze u živočichů vůči mitotickému vřeténku

Žlábek je vždy kolmý k ose mitotického vřeténka- Zajišťuje že se dělící rýha vytvoří mezi oběma skupinami dceřiných chromozomů

K čemu slouží žlábky na DNA

Žlábky jsou důležitým místem regulace genové exprese, vážou se do nich různé transkripční faktory a podobně.

Jakým způsobem mohou některé proteiny sloužit jako spojnice toku informací různých drah

• např. mají několik míst, která mohou být fosforylována různými kinázami

Popiš mechanismus aktivace jaderného receptoru

• vazba ligandu • „sevření" ligandu receptorem (komplementarita povrchů) • disociace inhibičního proteinu • umožnění vazby koaktivátorových proteinů • vazba na DNA a aktivace transkripce cílových genů

Principy přenosu signálu

• z jedné molekuly na druhou („relay") • využití „lešení"(„scaffold") pro udržení přenašečů ve vzájemné blízkosti • možnost převodu jednoho typu signálu na jiný („transduction") • zesílení signálu tvorbou velkého počtu nitrobuněčných mediátorů: malý počet mimobuněčných signálů vyvolává významnou odpověď („amplification")

Charakterizuj 3 podjednotky - struktura G proteinu

• α - obsahuje vazebné místo pro GTP/GDP, zajišťuje hydrolýzu GTP • ß a γ- ukotvují G protein na cytoplazmatické straně plazmatické membrány

Co dělají cyklin-Dependentní kinázy (CDK) + V jakých fázích jsou přítomny

− FOSFORYLUJÍ (PŘIDÁNÍ FOSFÁTOVÝCH SKUPIN) KLÍČOVÉ REGULÁTORY JEDNOTLIVÝCH FÁZÍ − FYZICKY PŘÍTOMNY V PRŮBĚHU CELÉHO CYKLU − AKTIVUJÍ SE JEN V JEHO URČITÉ FÁZI − AKTIVITA CYKLICKY STOUPÁ A KLESÁ

Průběh apoptózy

− SPOŘÁDANÁ LIKVIDACE BUNĚČNÝCH STRUKTUR BEZ ZÁTĚŽE PRO OKOLNÍ BUŇKY − ZMENŠENÍ A KONDENZACE BUŇKY − ODBOURÁNÍ CYTOSKELETU − ROZKLAD JADERNÉHO OBALU − FRAGMENTACE JADERNÉ DNA − ROZPAD NA APOPTICKÁ TĚLÍSKA − FAGOCYTÓZA

Důvody přítomnosti buněčné smrti

− TVAROVÁNÍ ORGÁNŮ V PRŮBĚHU EMBRYONÁLNÍHO VÝVOJE - NAPŘ. PRSTY − ODSTRAŇOVÁNÍ NEPOTŘEBNÝCH TĚLNÍCH STRUKTUR - NAPŘ. PŘEMĚNA PULCE V ŽÁBU − REGULACE POČTU BUNĚK - NAPŘ. SLADĚNÍ POČTU NERVOVÝCH BUNĚK S BUŇKAMI CÍLOVÝMI U dospělých - VYVAŽOVÁNÍ BUNĚČNÉ PROLIFERACE, ZABRÁNĚNÍ NADMĚRNÉMU RŮSTU TKÁNÍ

Příznaky a průběh nekrózy

▪ poškození mitochondriální membrány ▪ pronikání iontů Ca2+ do mitochondrií ▪ zakulacení a prasknutí mitochondrií ▪ ztráta regulace transportu iontů ▪ zakulacení buňky (swelling) ▪lýza buňky