Biochimie
Quels sont les produits normalement relâchés pendant un cycle de béta-oxydation ?
1 NADH, 1 FADH2, 1 acétyl-CoA. Le FADH2 n'est pas relâché si c'est juste avant une double liaison et 2 acétyl-CoA sont relâchés si c'est la réaction finale d'un AG pair, pour un AG impair, la dernière réaction libère un acétyl-CoA et un propionyl-CoA.
Quel est le bilan chimique du cycle de Krebs pour 1 acétyl-CoA ?
1 acétyl-CoA + 2 O2 -> 2 CO2 + H2O. Cette réaction libère 1 FADH et 3 NADH, ainsi que 1 ATP (à travers une conversion depuis GTP)
Quel est le bilan énergétique du couplage cycle de Krebs et phosphorylation oxydative ?
1 acétyl-CoA --> 1 ATP + 3 NADH (3x2,5 ATP) + 1 FADH (1x1,5 ATP) = 10 ATP.
Avec un pyruvate, combien d'ATP peut-on faire (métabolisme aérobie) ?
1 pyruvate se convertit en 1 acétyl-CoA en libérant 1 NADH2 mitochondrial. 1 acétyl-CoA donne 1 ATP dans le CK et 3 NADH mitochondriaux + 1 FADH. Donc on a 4 NADH mitochondriaux, 1 FADH et 1 ATP. Au total, ça donne 12,5 ATP.
Quelles sont les produits énergétiques de la glycolyse et quelles enzymes les produisent ?
1NADH par glycéraldéhyde-3-P (GAPDH), 1 ATP par 1,3 BPG (3-Pglycérate kinase) et 1 ATP par PEP (pyruvate kinase). Le total c'est 2 NADH et 2 ATP par glucose (il y a consommation de 2 ATP dans l'activation du glucose).
Quel est le bilan chimique de la partie irréversible du shunt des pentoses ?
6 glucose-6-P + 6 H2O + 12 NADP+ --> 12 NADPH + 6 ribose-5-P + 6 CO2
Dans quelle classe d'acide gras classe-t-on l'acide arachidonique ?
AG essentiel pair polyinsaturé.
Quels sont les corps cétoniques présents dans l'organisme ?
Acétoacétate, acétone et béta-hydroxybutyrate.
De quels intermédiaires dérivent les acides aminés suivants : alanine, acide aspartique, glutamate, glutamine, arginine ?
Alanine vient du pyruvate, acide aspartique de l'oxaloacétate, glutamate de l'alpha-cétoglutarate, glutamine du glutamate et arginine de l'ornithine qui est issue du glutamate.
Quelles molécules du corps possèdent des liaisons à haute énergie ?
Anhydres phosphoriques (ATP, ADP, GTP ...), thioesters (acétyl-CoA, acyl-CoA), 1, 3 - BPG et PEP.
Quelle maladie résulte de la déficience en B1 ? Et déficience en PP ?
B1 = Béri-béri. PP = pellagre.
A quoi sert la béta-cétothiolase ?
Béta car elle sert à la béta-oxydation. C'est elle qui fait le découpage final des deux carbones (celui en béta se détache des deux autres)
A quoi sert la citrate lyase ?
C'est l'enzyme cytosolique qui convertit le citrate en acétyl-CoA pour faire des AG.
Quels molécules peuvent composer la tête polaire des phospholipides ?
Choline, sérine, éthanolamine et inositol.
A quoi sert l'aldolase ?
Clivage du fructose 1,6-bisP en un aldéhyde et un alcool (glycéraldéhyde-3-P et di-OH-acétone-P). Utilisée dans la glycolyse.
A quoi sert l'aldolase B ?
Clivage du fructose 1-P en glycéraldéhyde (non-phosphaté) et di-OH-acétone-P. Utilisée pour convertir le fructose en un substrat pour la glycolyse.
Lesquels de ces processus sont cytosoliques et lesquels sont mitochondriaux : glycolyse, GNG, cycle de Krebs, décarboxylation oxydative du pyruvate, phosphorylation oxydative, béta-oxydation et synthèse d'AG ?
Cytosoliques : glycolyse, GNG, synthèse des acides gras. Mitochondriaux : Cycle de Krebs, phosphorylation oxydative, décarboxylation oxydative du pyruvate et béta-oxydation.
Quel est le produit de béta-oxydation des phytols ?
Des acétyl-CoA et des propionyl-CoA
A quoi sert le SAM ?
Donner les groupes méthyls qui seront ajoutés à la choline.
Quels sont les effets cellulaires d'une absence de Gal-1-P urydiltransférase ?
Déplétion en ATP car séquestration des P sur les galactose non-métabolisés.
A quoi sert l'acyl-CoA synthétase ?
Elle synthétise de l'acyl-CoA en utilisant de l'ATP à partir d'acides gras. Celui-ci sera converti en acyl-cartnitine puis transporté dans la mitochondrie, où il redeviena acyl-CoA pour la béta-oxydation.
Vrai ou faux : la synthèse de glycogène à partir de glucose nécessite d'1 ATP par glucose utilisé.
Faux. 1 ATP pour convertir le glucose en glucose-6-P puis un ATP pour créer de l'UTP qui sert à l'activation du glucose en UDP-glucose.
Vrai ou faux : le métabolisme de l'alcool inhibe la synthèse d'AG.
Faux. Au contraire, il inhibe la béta-oxydation. La béta-oxydation libère plein de NADH. Si déjà trop, ça peut pas se passer.
Vrai ou faux : la béta-oxydation se passe dans le cytosol.
Faux. C'est dans la mitochondrie.
Vrai ou faux : la vitamine B2 est essentielle au métabolisme des acides aminés.
Faux. C'est la B6. La B2 c'est le FAD.
Vrai ou faux : la décarboxylation oxydative du pyruvate est cytosolique.
Faux. C'est un processus mitochondrial.
Vrai ou faux : l'augmentation des corps cétoniques peut causer une alcalose métabolique.
Faux. Ceci cause une acidose. L'acétoacétate et le béta-hydroxybutyrate sont deux acides, donc ils peuvent libérer des protons.
Vrai ou faux : la glycogène synthase ajoute du glucose-1-P sur le glycogène.
Faux. Elle ajoute de l'UDP-glucose.
Vrai ou faux : la glycogène phosphorylase relâche du glucsoe-6-P à partir de glycogène.
Faux. Elle relâche du glucose-1-P, qui doit être changé en Glucose-6-P pour arriver à la glycolyse/GNG
Vrai ou faux : la synthèse d'acides gras est mitochondriale.
Faux. Elle se fait hors de la mitochondrie. Donc l'acétyl-CoA doit sortir de la mitochondrie (sous forme de citrate) pour être converti en acide gras.
Vrai ou faux : une réaction exergonique a une Delta G0' < 0.
Faux. Exergonique = libère de la chaleur dans toutes les conditions. C'est le Delta G qui est inférieur à 0.
Vrai ou faux : pour la synthèse d'AG, l'acétyl-CoA est activé en méthylmalonyl-CoA.
Faux. Il est activé en malonyl-CoA par l'acétyl-CoA carboxylase.
Vrai ou faux : le pyruvate ne possède pas de transporteur le permettant d'entrer dans la mitochondrie sans être converti avant.
Faux. Il existe un transporteur pour le pyruvate. D'ailleurs le rein absorbe tout le pyruvate dans l'urine primaire.
Vrai ou faux : le shunt des pentoses produit du NADH.
Faux. Il produit du NADPH.
Vrai ou faux : l'acétyl-CoA sort de la mitochondrie sous forme de acétyl-carnitine.
Faux. Il sort sous forme de citrate. Les AG ENTRENT dans la mitochondrie sous forme acyl-carnitine.
Vrai ou faux : les AG à plus de 20 carbones sont dégradés uniquement dans les peroxysomes.
Faux. Ils commencent dans les peroxysomes pour devenir plus petits mais ensuite ils vont dans la mitochondrie.
Vrai ou faux : l'ubiquinone est un transporteur d'électrons.
Faux. L'ubiquinone est un transporteur d'hydrogènes comme le NAD et le FAD. Les transporteurs d'électrons sont les cytochromes(molécules à noyau hème), fer-souffre et cuivre.
Vrai ou faux : le corps ne produit que des acides gras de type palmitique.
Faux. La FAS ne libère que ça mais ceux-ci peuvent être transformés pour donner d'autres AG pairs, qu'ils soient saturés ou pas.
Vrai ou faux : Les protéines membranaires suivantes font partie du système de transport d'électrons : complexe I, complexe II, ubiquinone, Complexe III, cyt C, complexe VI.
Faux. Le cyt c est une protéine soluble dans l'espace intermembranaire. Les autres sont effectivement membranaires.
Vrai ou faux : toutes les carboxylases nécessitent de la B2.
Faux. Toutes les carboxylases ont besoin de biotine, ATP et CO2 pour ajouter des carbones sur leur cible. La B2 est le FAD, rien à voir.
Vrai ou faux : la partie irréversible du shunt des pentoses est produit par les transcétolases.
Faux. Transcétolases font la partie réversible. La partie irréversible est faite par la glc-6-P déshydrogénase.
Quelles enzymes sont nécessaires au métabolisme du fructose pour la glycolyse ?
Fructokinase et aldolase B.
Quelles enzymes sont nécessaire au métabolisme du galactose pour la glycolyse ?
Galactokinase et Gal-1-P urydiltransférase.
Quel est le réactif de départ du shunt des pentoses ?
Glucose-6-P.
Quelles enzymes nécessitent la vitamine PP ?
Il y en a des tonnes. Toutes celles qui utilisent le NAD, qui est un dérivé de la PP.
A quoi sert la pyruvate carboxylase ?
Initie la GNG dans le foie. Elle prend 1 ATP et 1 CO2 et elle transforme un pyruvate en oxaloacétate, qui sort de la mitochondrie sous forme de malate et qui devient PEP, grâce à la PEPcarboxykinase.
Quelles sont les vitamines nécessaires aux transcétolases ?
Juste la B1. Sans B1 peu de shunt des pentoses. (seule la partie réversible utilise les transcétolases)
Quel corps cétonique est inutilisable par le corps ?
L'acétone, c'est un produit accidentel de la transformation d'acétoacétate en béta-hydroxybutyrate.
Quels sont les enzymes nécessaires à la synthèse d'acides gras ?
L'acétyl-CoA carboxylase (avec ATP, biotine et CO2) et le FAS.
Quelle est la première enzyme de la synthèse d'acides gras à partir d'acétyl-CoA ?
L'acétyl-CoA carboxylase. Vu que c'est une carboxylase elle a besoin de biotine, ATP et CO2.
Quel acide aminé est inhibiteur de la pyruvate kinase ?
L'alanine, créée à partir du pyruvate par transamination.
Quel acide aminé est créé par transamination du pyruvate ?
L'alanine.
Quelle enzyme du cycle de Krebs est bloquée par quelle molécule ?
L'isocitrate DH est bloquée par l'ATP.
Quelle est la différence entre CPT I et II (carnitine-palmytoiltransférase) ?
La CPT I échange le CoA contre la carnitine pour importer l'acide gras dans la mitochondrie, le CPT II retransforme en enlevant la carnitine et en mettant du CoA.
Quelle partie de la GNG est mitochondriale ?
La conversion du pyruvate en oxaloacétate. Celui-ci sort ensuite de la mitochondrie et est transformé en PEP. La conversion ne se fait pas par le cycle de Krebs. Elle se fait par la pyruvate carboxylase.
Quelle déficience de vitamine empêche le métabolisme du propionyl-CoA issu de la dégradation des acides gras impairs ?
La déficience en vitamine B12. Normalement le propionyl-CoA est transformé en oxaloacétate, mais sans B12 il y a accumulation d'un intermédiaire neurotoxique.
Quelles enzymes de la synthèse de glycogène/glycogénolyse sont sous contrôle hormonal ?
La glycogène phosphorylase et la glycogène synthase.
Quel est le rendement de la glycolyse/GNG ?
La glycolyse forme 2 ATP au total, la GNG demande 4 ATP et 2 GTP. Donc 2/6.
Quel est l'effet du cyanure sur le métabolisme cellulaire ?
Le cyanure lie le site d'action de l'O2 sur le complexe IV du système de transport d'électrons (inhibiteur couplant de la synthèse d'ATP)
Quel est l'effet du fluorure sur le métabolisme cellulaire ?
Le fluorure inhibe la formation de PEP et donc inhibe la glycolyse.
Par quel mécanisme le glucagon inhibe-t-il la glycolyse ?
Le glucagon, par le cAMP, inhibe la production de fructose-2, 6-BP, qui lui active la PFK et inhibe la FBP.
Quelles sont les sources de carbones pour la GNG ?
Les acides aminés (>80%), le lactate, le glycérol, un peu vient des acides gras impairs (mais la majorité fait de l'acétyl-CoA, seulement).
Quel sucre est constitué de deux glucoses alpha 1, 4 ?
Maltose.
C'est quoi un effecteur allostérique ?
Molécule qui régule le taux d'activité d'une enzyme en se liant à un site autre que le site actif.
Quelle enzyme de la glycolyse est influencée par la charge énergétique ?
PFK. Elle s'active avec l'augmentation de AMP et s'inactive avec l'augmentation de ATP.
Quel est le bilan chimique de la décarboxylation oxydative du pyruvate ?
Pyruvate + HS-CoA + NAD+ --> Acétyl-CoA + CO2 + NADH2.
Quelles enzymes nécessitent la vitamine B1 ?
Pyruvate DH, alpha-cétoglutarate DH et transcétolase.
A quoi sert le NADPH ?
Synthèse des acides gras, de H2O2, NO, détox.
Quelles enzymes nécessitent la vitamine B2 ?
Toutes celles créant une double liaison à la place d'une simple. Ceci crée une oxydation de FAD, qui est le dérivé de la B2.
Vrai ou faux : en avançant dans le système de transport d'électrons, les électrons suivent un potentiel rédox croissant.
Vrai.
Vrai ou faux : l'adrénaline stimule la glycogénolyse.
Vrai.
Vrai ou faux : le cycle de Krebs est mitochondrial.
Vrai.
Vrai ou faux : seuls le foie et les reins expriment la glc-6-Pase.
Vrai.
Vrai ou faux : les phytols sont des acides gras issus de l'isoprène.
Vrai. Acides gras isoprénoïdes formés dans les plantes.
Vrai ou faux : la Glc-6-Pase se trouve quasiment que dans le foie.
Vrai. C'est lui qui fait la GNG et donne du glucose aux autres organes. Aussi dans le rein.
Vrai ou faux : l'acétyl-CoA bloque la pyruvate deshydrogénase.
Vrai. C'est pas un blocage complet, mais un peu. Donc une augmentation de l'acétyl-CoA empêche la dégradation du pyruvate, qui devient alanine et empêche la pyruvate kinase de convertir le PEP. Donc fin de glycolyse.
Vrai ou faux : 2 NADPH sont utilisés par cycle de synthèse d'AG.
Vrai. Chaque cycle ajoute 2 carbones, chaque cycle consomme 2 NADPH.
Vrai ou faux : le métabolisme de l'alcool inhibe la GNG.
Vrai. Il crée plein de NADH, ce qui crée du lactate et donc moins de pyruvate pour la GNG.
Vrai ou faux : le cycle de Krebs ne fonctionne qu'en aérobie.
Vrai. Il produit du NADH et du FADH. Il faut les réoxyder pour pouvoir faire le cycle de Krebs. Sans O2, la glycolyse produirait du lactate au lieu du pyruvate et donc il n'y aurait pas de substrat pour le cycle de Krebs.
Vrai ou faux : la glycolyse est cytosolique.
Vrai. La GNG aussi.
Vrai ou faux : pour la GNG, du malate sort de la mitochondrie et est converti en PEP.
Vrai. La GNG convertit du pyruvate en oxaloacétate. Celui-ci sort de la mitochondrie sous forme de malate et redevient oxyloacétate puis PEP pour la GNG.
Vrai ou faux : la synthèse d'acides gras à partir d'acétyl-CoA utilise de l'ATP.
Vrai. La première enzyme (l'acétyl-CoA carboxylase) demande du CO2, de la biotine et de l'ATP.
Vrai ou faux : la GNG consomme du GTP et de l'ATP.
Vrai. La pyruvate carboxylase consomme un ATP et la PEPCK consomme un GTP.
Vrai ou faux : l'augmentation de la glycémie cause une baisse de la formation de corps cétoniques.
Vrai. Les corps cétoniques sont formés pendant le jeûne.
Vrai ou faux : la synthèse d'acides gras consomme du NADPH.
Vrai. NADPH = production de H2O2, NO, synthèse de lipides et détoxifications.
Vrai ou faux : la décarboxylation oxydative du pyruvate est irréversible.
Vrai. On ne fait pas de pyruvate à partir d'acétyl-CoA.
Vrai ou faux : l'augmentation de la NADH inhibe la GNG.
Vrai. Une augmentation de la NADH va convertir tout le pyruvate en lactate pour réoxyder le NADH.
Quel est le produit intermédiaire de la formation des corps cétoniques ?
l'HMG-CoA. Actéyl-CoA devient HMG-CoA qui devient acétoacétate (un corps cétonique), qui peut devenir acétone ou béta-hydroxybutyrate (les deux autres corps cétoniques)