DNR biosintezės bendrieji bruožai

Réussis tes devoirs et examens dès maintenant avec Quizwiz!

chelatavimas

neigiamo krūvio dalelių (pav fosfatų) stabilizacija (daro B magnio jonas)

oriC

origin of Chromosomal replication (in E.coli)

SSB funkcija

palaikyti grandines išsiskyrusias

autoradiografijos metodas

patvirtinimas, kad DNR replikuojama pusaiu konservatyviu būdu

PolI funkcija atsiliekančioje grandinėje

pašalina RNR pradmenis ir užpildo DNR

O spiralė

pirštų polimerazės struktūra, kuri lemia atvirą/uždarą konformaciją

DNR polimerazės struktūra

plyšys, delnas, pirštai, nykštys

nereguliarus polimeras

polimeras, kuris sudarytas iš nepasikartojančių monomerų

uždaroji aktyviojo centro konformacija

polimerazės konformacija, suartinanti substratus

replisomos sandara

praimosoma ir DNR holoenzimas

nesuporuotų nukleotidų reparacija

procesas, mažinantis replikacijos klaidų skaičių

DnaB baltymas

prokariotų replikacijos iniciacijoje dalyvaujanti helikazė

procesyvumas

savybė, kokio ilgio fragmentą gali fermentas susintetinti neatsijungęs

SSB protein

single-strande binding protein

sigma šerdinės dalelės struktūros funkcija

stimuliuoja epsilon struktūros aktyvumą

replikacinė šakutė

struktūra, kurioje pradedama replikuoti DNR

chi ir psi subvienetų funkcija

sąveika su SSB baltymias, replikacijos koordinacijai

priežastis, kodėl DNR turi būti antilygiagrečios

tam, kad DNR išlaikytų pastovią struktūrą

fosfodiesterinė jungtis katalizuojama polimerazės

tarp prijungiamo dNTP (vidinio) alfa fosfato ir ankstesnio dezoksinukleotido pentozės 3'-OH grupės

terminacijos taškas

taškas, kuriame susitinka replikacijos šakutės

savitieji terminacijos baltymai

terminacijoje dalyvaujantys baltymai, kai atskiriamos sudvigubėjusios chromosomos

ter sekos

terminacijos sekos: T1 ir T2

tus baltymas

termination utilization substance baltymas, kuris stabdo replikacijos šakučių judėjimą

ŽUK žiedo prijungimo dalys

trys gama-teta, delta ir delta'

sąlygos, sukuriančios tinkamą DNR molekulę tam, kad prisijungtų DNR polimerazė:

viengrandė ir pradmuo, 3' užsilenkęs galas, trūkis, prisijungęs baltymas

PolIII dalys

šerdinė dalis (x2), slystantieji žiedai (x2), žiedo užkėlimo kompleksas (x1)

ŽUK

žiedo užkėlimo (užnėrimo ant DNR) kompleksas

kiekviena bakterinė chromosoma turi...

...tik vieną replikacijos pradžią

epsilon šerdinės dalelės struktūros funkcija

3'->5' egzonukleazinis aktyvumas

kryptis, kuria sintetinama DNR

5' -> 3'

ŽUK komplekso sandara

7 baltymai

trijų tipų sekos svarbios oriC

AT rich, DnaA, GATC methylation sites

DNR matrica

DNR matricinė gradninė ir praimeris, prijungtas prie šios grandinės

alfa šerdinės dalelės struktūros funkcija

DNR polimerazinis aktyvumas

slystantieji žiedai

DNR polimerazių (PolIII) procesyvumo veiksniai

replikazė

DNR polimerazė, dalyvaujanti tik DNR replikacijoje

PolIII

DNR replikacija / reparacija

PolII funkcijos

DNR replikacija / reparacija, TLS

PolI funkcijos

DNR replikacija, Okazaki fragmentų brendimas, DNR reparacija

TLS

DNR sintezė ties pažaidomis

DNR girazė

II topoizomerazė, visada keliaujanti prieš helikazę ir atpalaiduojanti spirales

bakterijų polimerazės

PolI(A šeima), PolII(B), PolIII(C), PolIV(Y)

pagrindinė prokariotų polimerazė replikacijoje

PolIII

Okazaki fragmentų brendimo etapai

RNR pradmens pašalinimas, plyšio užpildymas, fragmentų sujungimas (ligazėmis)

TaqDNR polimerazė

Thermus aquaticus bakterijos DNR I Pol (PGR reakcijoje, netiksli)

PolII turimi aktyvumai

abu pagrindiniai aktyvumai

2 substratas

aktyvi matrica

PolIII šerdinės dalelės sandara

alfa, epsilon, sigma

slystančiųjų žiedų funkcijos

atsakas į DNR pažaidas, ląstelės ciklo valdymas, chromatino supakavimas į nukleosomas

DnaG baltymas

baltymas sintetinantis trumpus RNR pradmenis (DNR praimazė)

DNR ligazė

baltymas, kovalentiškai sujungiantis Okazaki fragmentus

DnaC baltymas

baltymas, padedantis helikazei prisijungti prie DNR (helikazės jungiklis)

pusiau konservatyvus būdas

būdas (kuriuo vyksta DNR replikacija), po kurio susidaro du nauji DNR dupleksai iš senos ir naujos grandinės

3'->5' egzonukleazės aktyvusis centras

centras, turintis klaidas taisantį aktyvumą

1 substratas

dATP, dGTP, dCTP,dTTP

Klenovo fragmentas

didysis PolI fragmentas, turintis pagrindinius aktyviuosius centrus

replikacijos savybės nuo iniciacijos srities

dvikryptė ir pusiau konservatyvi

DNR nukleotidil-transferazės

fermentai, jungiantys dNTP prie sintetinamos DNR grandinės ribozės 3'-OH grupės

DNR polimerazė

fermentas, sintetinantis DNR replikacijos ir reparacijos procesų metu

DNR praimazė

fermentas, sintetinantis RNR pradmenis (tai duoda pradžią DNR sintezei)

DNR III polimerazės holofermentas

fermentas, sudarytas iš 17 polipeptidų (10 skirtingų)

ŽUK ATPazinio aktyvumo dalys

ga,a ir teta subvienetai

Klenovo fragmento taikymas

galų bukinimui (genų inžinerijoje po endonukleazių kirpimo)

replikacijos etapai

iniciacija, elongacija, terminacija

proofreading funkcija (pačiose polimerazėse)

klaidas taisančio mechanizmo polimerazėje veikimas (sulėtėja greitis įjungus neteisingą nukleotidą)

praimosoma

kompleksas, sudarytas iš DNR helikazės ir praimazės

asparto aminorūgštys

konservatyvios polimerazių aktyviojo centro aminorūgščių liekanos

replisoma

laikinas baltymų kompleksas, veikiantis tik ties DNR replikacinėmis šakutėmis, jis užtikrina veiksmingą DNR kopijavimą

polimerzių reakcijos kofaktorius

magnio / cinko du plius jonai

indukuoto atitikimo mechanizmas

mechanizmas, vykstantis dėl aktyvaus centro konfigūracijos, kuris lemia polimerazės tikslumą


Ensembles d'études connexes

Intro to Financial Accounting Chapter 1 (Introduction to Financial Statements)

View Set

Chapter 23 Care of Patients with Brain Disorders

View Set

Packard AP Chemistry Final Exam Semester 2

View Set

OB Chapter 21 - Nursing Management of Labor and Birth at Risk

View Set

ATI Ob Chapter 27 Assessment and Management of Newborn Complications

View Set